ANÁLISIS TRANSCRIPTÓMICO DE EXOCARPO DE MANGO (Mangifera Indica L.) Y GENES QUE PARTICIPAN EN LA BIOSÍNTESIS DE CUTÍCULA
El objetivo de esta investigación fue correlacionar la expresión de genes que participan en la biosíntesis con la formación de cutícula durante la ontogenia del fruto de mango. Se realizó una investigación documental sobre la composición, fisiología y biosíntesis de la cutícula en plantas que permit...
| Author: | |
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| Format: | doctoral thesis |
| Status: | Published version |
| Publication Date: | 2015 |
| Country: | México |
| Institution: | Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo |
| Repository: | Repositorio Institucional del CIAD |
| Language: | Spanish |
| OAI Identifier: | oai:ciad.repositorioinstitucional.mx:1006/132 |
| Online Access: | http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/132 |
| Access Level: | Open access |
| Keyword: | info:eu-repo/classification/Bioquímica de vegetales/Tecnología de alimentos de origen vegetal info:eu-repo/classification/cti/2 |
| Summary: | El objetivo de esta investigación fue correlacionar la expresión de genes que participan en la biosíntesis con la formación de cutícula durante la ontogenia del fruto de mango. Se realizó una investigación documental sobre la composición, fisiología y biosíntesis de la cutícula en plantas que permitió proponer un modelo del mecanismo molecular de biosíntesis. Se determinaron los cambios en la cantidad de cutícula durante la ontogenia del fruto de mango. Asimismo, se analizó el transcriptoma de exocarpo de mango maduro y senescente mediante RNA-Seq y se realizó un análisis de los cambios en la expresión de genes que fueron identificados que participan en la biosíntesis de cutícula. Se generaron aproximadamente 400 millones de pares de lecturas y fueron ensambladas de novo en 107,744 unigenes, con una longitud promedio de 1,717 bp. De estos, se identificaron 91,736 unigenes mostrando homología a proteínas en la base de datos UniProt/TrEMBL. Estos participan principalmente en el metabolismo de lípidos, cutina, metabolitos secundarios y polisacáridos de la pared celular. Además, se identificó que la biosíntesis de monómeros de cutina es una ruta metabólica enriquecida durante la maduración. La biosíntesis de cutícula mostró un patrón bifásico con una mayor acumulación durante la maduración y senescencia del fruto. Este comportamiento correlaciona con la expresión de los genes analizados. Con esta información, se propuso un modelo molecular de biosíntesis de cutícula incluyendo todos los genes analizados y un modelo donde se describe la función de un gen que codifica para una proteína transportadora de lípidos. Los genes analizados en esta investigación constituyen la primera evidencia experimental que apoyará la elucidación del mecanismo molecular de la biosíntesis de cutícula en mango. Los resultados de este estudio proporcionan un recurso genómico de gran importancia que permitirá el diseño de estrategias para aumentar la vida postcosecha del mango. Palabras clave: Mango, exocarpo, cutícula, biosíntesis, RNA-Seq, transcriptoma. |
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