Análisis de la diversidad genética de Clavibacter michiganensis subp. michiganensis, Pseudomonas syringae pv. tomato y Xanthomonas campestris pv. vesicatoria en cultivos de tomate en Sinaloa

En Sinaloa el cultivo de tomate es de gran importancia económica y recientemente se ha visto afectado por las enfermedades cancro bacteriano, peca bacteriana y mancha bacteriana causadas por Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), Pseudomonas syringae p.v. tomato (Pst) y Xanthomonas ca...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: MARIELA GUADALUPE ESPINOZA MANCILLAS
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2008
País:México
Institución:Instituto Politécnico Nacional
Repositorio:Repositorio de Ciencia Sinaloa IPN
Idioma:español
OAI Identifier:oai:http://www.cienciasinaloa.ipn.mx:123456789/204
Acceso en línea:http://www.cienciasinaloa.ipn.mx:80/jspui/handle/123456789/204
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/cti/6
BIOTECNOLOGÍA AGRÍCOLA
Descripción
Sumario:En Sinaloa el cultivo de tomate es de gran importancia económica y recientemente se ha visto afectado por las enfermedades cancro bacteriano, peca bacteriana y mancha bacteriana causadas por Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), Pseudomonas syringae p.v. tomato (Pst) y Xanthomonas campestris p.v. vesicatoria (Xcv). Debido al alto riesgo fitosanitario que representan estas bacterias, se requiere de métodos de detección eficientes tanto en semilla como en plántulas de invernadero y de campo que permitan el manejo adecuado de la enfermedad. El objetivo del presente estudio fue analizar la diversidad genética de Cmm, Pst y Xcv infectando al cultivo del tomate en Sinaloa. Para el desarrollo de este trabajo se realizaron muestreos en las principales áreas productoras de tomate del Estado de Sinaloa, así como en aquellas donde se tenían antecedentes previos de enfermedades bacterianas. Los municipios muestreados fueron Ahome, Guasave, Mocorito, Culiacán, Elota, Rosario y Mazatlán. La prueba de PCR específica para estas bacterias mostró la presencia de Cmm, Pst y Xcv en 47 de las 112 plantas de tomate con síntomas típicos de enfermedades bacterianas colectadas; 10 de las 47 muestras fueron positivas para Cmm, 10 para Pst y 27 para Xcv. Cmm se detectó en muestras colectadas en invernadero y campo (fruto, semilla y follaje), mientras que Pst y Xcv solo se detectaron en muestras colectadas en campo (follaje y fruto). Los productos de PCR fueron secuenciados y posteriormente comparados con otras secuencias previamente reportadas en el NCBI/GenBank y mediante el programa MegAlign, mostrando una alta identidad (97-100%) entre ellas. Por medio de la técnica de Rep-PCR con los oligonucleótidos ERIC y BOX se obtuvo la huella genómica de cada uno de los aislados bacterianos. Los patrones de bandas observados mediante la técnica de Rep-PCR indican que existe variabilidad genética entre los miembros de cada grupo de bacterias.