Bases moleculares de la incompatibilidad replicativa de dos cepas de Rhynchosia mosaic Sinaloa virus
"Los begomovirus tienen un genoma compuesto por una o dos moléculas circulares de DNA de cadena sencilla (ssDNA) de ~2.6 kb, que se replican por el mecanismo de círculo rodante (RCR) en el núcleo de la célula vegetal. La proteína iniciadora de la replicación (Rep) codificada por estos virus per...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2014 |
| País: | México |
| Institución: | Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica |
| Repositorio: | Repositorio Institucional del IPICYT |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:ipicyt.repositorioinstitucional.mx:1010/750 |
| Acceso en línea: | http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/332 http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/750 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | info:eu-repo/classification/Autor/Begomovirus info:eu-repo/classification/Autor/Replicación info:eu-repo/classification/Autor/Pseudorecombinación info:eu-repo/classification/cti/2 info:eu-repo/classification/cti/24 info:eu-repo/classification/cti/2415 |
| Sumario: | "Los begomovirus tienen un genoma compuesto por una o dos moléculas circulares de DNA de cadena sencilla (ssDNA) de ~2.6 kb, que se replican por el mecanismo de círculo rodante (RCR) en el núcleo de la célula vegetal. La proteína iniciadora de la replicación (Rep) codificada por estos virus pertenece a la superfamilia de endonucleasas HUH, las cuales tienen un papel importante en la RCR de plásmidos, bacteriófagos, y virus circulares de ssDNA de organismos eucariotas, en la transferencia de plásmidos durante la conjugación bacteriana, y en distintos tipos de transposición. En el 2006 se aisló de una planta de Rhynchosia mínima colectada en Guasave, Sinaloa, una nueva especie de begomovirus que se denominó Rhynchosia mosaic Sinaloa virus (RhMSinV). En el presente trabajo aislamos tres begomovirus diferentes de una planta de R. minima colectada en Manzanillo, Colima, y su secuenciación reveló que uno de esos virus es una nueva cepa de RhMSinV (<92% de identidad). Este nuevo virus RhMSinV-CO exhibe en el origen de replicación cuatro presuntos sitios de unión de Rep (iterones) cuya secuencia (TGGAGTC). es diferente a la de los elementos homólogos del aislado original de Guasave (TGGAGGA), y a una variante de este último aislado también en este estudio, que denominamos RhMSinV-GUco. El alineamiento de las proteínas Rep codificadas por las dos cepas reveló una diferencia en el residuo amninoácido 71 (N-D), que fue identificado en trabajos previos de nuestro laboratorio como un potencial determinante de especificidad (SPD) de la proteína Rep. El modelado de la estructura tridimensional del dominio endonucleolítico de las proteínas Rep de RhMSinV-CO y -GU reveló que sus presuntos SPDs (los residuos 9, 11, 71 y 73) exponen sus grupos laterales hacia la superficie de una mini-hoja beta (β1-β5) que se considera crítica para el reconocimiento y unión de Rep a su DNA cognado. Experimentos de replicación transitoria en protoplastos, y de inoculación por biobalística de plantas de Nicotiana benthamiana, demostraron que RhMSinV-GU y RhMSinV-CO son incompatibles en replicación, como se predijo a partir de las diferencias en sus potenciales determinantes de especificidad (iterones y Rep-SPDs). En contraste, el DNA-A de la cepa RhMSinV-CO y el DNA-B de un begomovirus filogenéticamente distante, Pepper golden mosaic virus (PepGMV) que presenta iterones y Rep-SPDs similares, formaron pseudo-recombinantes viables que indujeron síntomas severos en las plantas bombardeadas." |
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