Molecular Modelling of Switchable[2]Rotaxanes

En aquesta tesi s'ha desenvolupat i utilitzat una potent estrategia computacional per a l'estudi, tant estructural, dinàmic i energètic, de nous [2]rotaxanes que van ser sintetizats i caracteritzats experimentalment pel grup de recerca col·laborador del Prof. Donald Fitzmaurice de la Unive...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Pérez Mirón, Javier
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2008
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/3278
Acceso en línea:http://www.tdx.cat/TDX-1114108-123917
http://hdl.handle.net/10803/3278
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Nanochemistry
Molecular modelling
Mmolecular dynamics
Ciències Experimentals
54
Descripción
Sumario:En aquesta tesi s'ha desenvolupat i utilitzat una potent estrategia computacional per a l'estudi, tant estructural, dinàmic i energètic, de nous [2]rotaxanes que van ser sintetizats i caracteritzats experimentalment pel grup de recerca col·laborador del Prof. Donald Fitzmaurice de la University College Dublin, a Irlanda. Com a etapa preliminar, es van estudiar uns pseudorotaxans formats per les mateixes estacions que presentaven els nous [2]rotaxans. Es va modelitzar el comportament dels pseudorotaxans en diferents dissolvents (CH3CN i CH3OH) i amb la presència de dos tipus de contraions (PF6- i Br-). <br/>Es va voler aprofundir en el coneixement de les interaccions entre el macrocicle i les estacions. En aquesta direcció, es van determinar les energies de complexació dels complexes estació-macrocicle i també la variació energètica davant la posició del macrocicle respecte l'eix del pseudorotaxà. Els results obtinguts computacionalment van ser comparats amb els resultats obtinguts en estudis experimentals en dissolució (RMN, espectroscòpia d'absorció òptica, voltametria cíclica). <br/>Posteriorment, es va examinar el moviment traslacional del macrocicle degut a la reducció de les estacions del [2]rotaxà realitzant simulations de Perturbació d'Energia Lliure. Existeix una important contribució metodològica present en el desenvolupament de les parametritzacions per a modelitzar amb AMBER els ions PF6- i Br- i les estacions utilitzades en aquesta tesi. També s'han detectat deficiències en el mòdul RESP durant la comprovació del seu funcionament.<br/>Els [2]rotaxans estudiats són interessants ja que presenten força aplicacions pràctiques en el futur. Un dels grups bloquejador del [2]rotaxà es pot quedar unit a la superfície d'un elèctrode o alguna nanopartícula semiconductora. Així doncs, com a resultat de la col·laboració de tots dos grups es pot concloure que s'ha generat informació útil que pot ajudar a realitzar un millor disseny de [2]rotaxans i supermolècules relacionades que tinguin la capacitat de funcionar com a interrupturs bi-estables i puguin ésser utilitzats en la contrucció de futurs sistemes electrònics, en particular, com a dispositius bi-estables d'emmagatzematge d'informació.