Genomic analysis of epithelial fusion and wound healing morphogenetic processes in Drosophila / Análisis genómico de los procesos morfogenéticos de fusión de epitelios y cicatrización en Drosophila
[spa] Esta tesis se basa en el estudio de los procesos morfogenéticos de fusión de epitelios y cicatrización utilizando Drosophila melanogaster como organismo modelo. Ya que esta tesis se basa en un análisis por microarray de las células involucradas activamente en el proceso de cicatrización en com...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2013 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad de Barcelona |
| Repositorio: | Dipòsit Digital de la UB |
| OAI Identifier: | oai:diposit.ub.edu:2445/43585 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/2445/43585 http://hdl.handle.net/10803/112198 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Epiteli Genòmica Genètica animal Drosòfila melanogaster Epithelium Genomics Animal genetics Drosophila melanogaster |
| Sumario: | [spa] Esta tesis se basa en el estudio de los procesos morfogenéticos de fusión de epitelios y cicatrización utilizando Drosophila melanogaster como organismo modelo. Ya que esta tesis se basa en un análisis por microarray de las células involucradas activamente en el proceso de cicatrización en comparación con aquellas células vecinas no implicadas activamente en dicho proceso, se estandarizó un nuevo sistema para cultivar discos imaginales in vitro. Gracias a este sistema, que recapitula todos los procesos que ocurren durante la cicatrización, se pudieron aislar una gran cantidad de tanto de células activamente involucradas en la cicatrización (puc-GFP positivas) como de sus vecinas no involucradas (puc-GFP negativas). Una vez obtenidas las distintas poblaciones celulares se realizaron las extracciones de RNA y posteriores hibridaciones en chip de Affymetrix. Los datos obtenidos se analizaron mediante diferentes estudios estadísticos, resaltando 302 genes regulados positivamente y 209 genes regulados negativamente con un fold change por encima o por debajo de 2 y -2 respectivamente. También se realizaron análisis de la ontología génica (GO) de los genes que aparecían modificados, lo que nos permitió ver que categorías génicas aparecían mas representadas (como por ejemplo genes implicados en la regulación de la actina, la respuesta inmune, el movimiento celular o factores de activación de la transducción). Una vez realizados los análisis estadísticos se procedió al análisis funcional de aquellos genes que aparecían modificados. Ya que realizar un cribado en cicatrización era un proceso largo y tedioso se decidió hacer un cribado previo utilizando el modelo de fusión del tórax. Para ello se sobreexpresaron RNA de interferencia mediante un driver que digiere su expresión a la zona dorsal del tórax. Se testaron 206 líneas UAS-RNAi para disminuir la expresión de 123 genes y 21 líneas UAS para sobreexpresar aquellos genes que aparecían regulados negativamente. De estos 89 líneas UAS-RNAi (43 % de los testados) correspondiente a 54 genes (44 %) y 18 líneas UAS (42 %) correspondientes a 11 genes (44%) presentaban problemas de fusión de tórax. Aquellos genes que producían fenotipos mas fuertes estaban relacionados con factores de transcripción, con la regulación de la actina o las adhesiones celulares (esperable ya que ya se ha descrito previamente la importancia de estos factores durante la cicatrización), y de forma preliminar, fueron estudiados durante el proceso de cicatrización, identificando nuevos genes implicados en el mismo. |
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