Identification and phylogeny of clinical and environmental isolates of Alternaria, Cladosporium and other genera of dematiaceous hyphomycetes
La present tesi s’ha centrat en l’estudi de la diversitat d’espècies i la taxonomia dels gèneres Alternaria i Cladosporium, així com d’altres gèneres d’hifomicets dematiàcis morfològicament similars. S’han estudiat un total de 589 aïllats; 56 d’origen clínic i 533 de mostres mediambientals (204 de f...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2020 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/670929 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/670929 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Alternaria Cladosporium Dematiaci Dematiaceous Dematiáceos Ciències 57 574 579 |
| Sumario: | La present tesi s’ha centrat en l’estudi de la diversitat d’espècies i la taxonomia dels gèneres Alternaria i Cladosporium, així com d’altres gèneres d’hifomicets dematiàcis morfològicament similars. S’han estudiat un total de 589 aïllats; 56 d’origen clínic i 533 de mostres mediambientals (204 de fem, 200 de sòl, 129 de restes vegetals) recollides a en territori espanyol, però també a Indonèsia, Mèxic i Vietnam. Els gèneres objecte de la nostra recerca es consideren taxonòmicament complexos a causa de les dificultats en identificar les seves espècies utilitzant només trets morfològics. L’espectre real de la diversitat d’espècies associada a un substrat particular només es coneix si s’utilitzen estudis moleculars basats en anàlisis de seqüències de marcadors filogenètics apropiats pel reconeixement d’espècies. La caracterització fenotípica dels aïllats i anàlisis de seqüències de les regions ITS i LSU de l'ADN ribosòmic, així com de regions de gens que codifiquen proteïnes, com la l’actina, ATPasa, gliceraldehid-3-fosfat deshidrogenasa, factor d'elongació, RNA polimerasa II i β- tubulina), segons el gènere estudiat, ens ha permes identificar: 39 espècies Alternaria, incloent 13 de noves per a la ciència i 11 espècies filogèniques no descrites, encara en caracterització; 45 espècies de Cladosporium, incloses set noves espècies i una espècie filogenètica encara en estudi; 10 espècies de Curvularia, tres proposades com a noves; el nou gènere Neodendryphiella amb tres espècies noves; dues noves espècies de Pseudopenidiella, a mens de cinc fongs nous pertanyents a Apenidiella, Cyphellophora, Heliocephala, Matsushimaea i Venturia. Entre les noves Alternaria, tres han resultat ser agents de l’alternarosi cutània (A. anthropophila, A. atrobrunnea i A. guarroi). S’ha observat una gran diversitat d’espècies, en els aïllats d’Alternaria i Cladosporium de fonts mediambientals, però la femta d’herbívors ha estat el substrat on s’han recuperar més espècies noves o rares, concloent que aquest és un excel·lent reservori d’hifomicets interessants. |
|---|