Combined use of NMR and computational tools for fragment based drug discovery targeting protein-protein interactions VEGF protein surface recognition as a case study

[spa] En el contexto de la presente tesis hemos abordado los siguientes objetivos: 1. El uso de métodos de RMN, basados tanto en la observación del ligando como en la observación de proteína, para estudiar la unión de los compuestos de una quimioteca a la zona de VEGF involucrada en la unión a sus r...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Goldflam, Michael
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2013
País:España
Institución:Universidad de Barcelona
Repositorio:Dipòsit Digital de la UB
OAI Identifier:oai:diposit.ub.edu:2445/46745
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/2445/46745
http://hdl.handle.net/10803/123711
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Reconeixement molecular
Ressonància magnètica nuclear
Angiogènesi
Proteïnes
Disseny de medicaments
Disseny assistit per ordinador
Dianes farmacològiques
Molecular recognition
Nuclear magnetic resonance
Neovascularization
Proteins
Drug design
Computer-aided design
Drug targeting
Descripción
Sumario:[spa] En el contexto de la presente tesis hemos abordado los siguientes objetivos: 1. El uso de métodos de RMN, basados tanto en la observación del ligando como en la observación de proteína, para estudiar la unión de los compuestos de una quimioteca a la zona de VEGF involucrada en la unión a sus receptores. La interacción VEGF/VEGFR puede ser considerada como un caso de estudio para la evaluación de las interfaces proteína-proteína mediante cribado de fragmentos. 2. Desarrollar herramientas basadas en la combinación de RMN y métodos computacionales para abordar: i) un sistema automático de diseño de mezclas de fragmentos; ii) el análisis automático de datos procedentes de cribados basados en RMN; iii) la evolución de fragmentos con muy baja afinidad. 3. Explorar el uso de técnicas de “mRNA display” para el descubrimiento de nuevos ligandos peptídicos para VEGF.

Similares en LA Referencia