Scipion: a software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D Electron Microscopy

Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Escuela Politécnica Superior, Departamento de Ingeniería Informática. Fecha de lectura : 25-10-2017

Detalles Bibliográficos
Autor: Rosa Trevín, José Miguel de la
Tipo de recurso: tesis doctoral
Fecha de publicación:2017
País:España
Institución:Universidad Autónoma de Madrid
Repositorio:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:repositorio.uam.es:10486/681439
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10486/681439
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Imágenes, Tratamiento de las - Tesis doctorales
Soporte lógico - Desarrollo - Tesis doctorales
Informática
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spelling Scipion: a software framework toward integration, reproducibility and validation in 3D Electron MicroscopyRosa Trevín, José Miguel de laImágenes, Tratamiento de las - Tesis doctoralesSoporte lógico - Desarrollo - Tesis doctoralesInformáticaTesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Escuela Politécnica Superior, Departamento de Ingeniería Informática. Fecha de lectura : 25-10-2017In the past few years, 3D electron microscopy (3DEM) has undergone a revolution in instrumentation and methodology. One of the central players in this wide-reaching change is the continuous development of image processing software. Here we present Scipion, a software framework for integrating several 3DEM software packages through a work owbased approach. Scipion allows the execution of reusable, standardized, traceable and reproducible image-processing protocols. These protocols incorporate tools from di erent programs while providing full interoperability among them. Scipion is an open-source project that can be downloaded from http://scipion.cnb.csic.es.Marabini Ruiz, RobertoCarazo García, José MaríaDepartamento de Ingeniería InformáticaEscuela Politécnica Superior20172017-10-25doctoral thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06NAhttp://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43info:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10486/681439reponame:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAMinstname:Universidad Autónoma de MadridInglésengopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessoai:repositorio.uam.es:10486/6814392026-06-23T12:46:27Z
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