Inclusión del pangenoma para la vigilancia genómica de los serovares Typhi y Hadar de Salmonella enterica
El estudio de la relación genética entre bacterias mediante loci cromosómicos específicos constituye la base de la vigilancia genómica en salud pública. Sin embargo, este enfoque basado en la evolución vertical, deja de lado un aspecto crucial de la evolución bacteriana: la transferencia genética ho...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2025 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad de Cantabria (UC) |
| Repositorio: | UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.unican.es:10902/36578 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/10902/36578 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Salmonella Pangenoma Índice de Jaccard Elementos genéticos móviles Salud pública Whole genome sequencing Pangenome Jaccard index Mobile genetic elements Public health |
| Sumario: | El estudio de la relación genética entre bacterias mediante loci cromosómicos específicos constituye la base de la vigilancia genómica en salud pública. Sin embargo, este enfoque basado en la evolución vertical, deja de lado un aspecto crucial de la evolución bacteriana: la transferencia genética horizontal. Esta tesis evalúa la relación del pangenoma en los serovares Typhi y Hadar de Salmonella enterica mediante un enfoque basado en el Índice de Jaccard, capturando tanto las relaciones evolutivas verticales (homología por descendencia) como horizontales (homología por mezcla) en una red reticulada. El análisis revela grupos poblacionales estrechamente relacionados, linajes emergentes y el impacto de elementos genéticos móviles que impulsan cambios epidemiológicamente relevantes en períodos cortos de tiempo. Este enfoque de alta resolución no solo mejora la detección de brotes y la atribución de fuentes de contaminación, sino que también refuerza la vigilancia de la resistencia a antibióticos. |
|---|