Diagnòstic microbiològic i epidemiologia dels virus respiratoris a la província de Lleida
La malaltia més freqüent que afecta l’espècie humana és la produïda pels virus respiratoris. La seva ràpida identificació millora l’ús d’antimicrobians, redueix exploracions innecessàries, la duració de l’estància hospitalària, i ajuda a limitar la transmissió viral entre altres avantatges. Encara q...
| Author: | |
|---|---|
| Format: | doctoral thesis |
| Status: | Published version |
| Publication Date: | 2023 |
| Country: | España |
| Institution: | Universidad Pontificia Comillas ICAI-ICADE |
| Repository: | Repositori Obert UdL |
| OAI Identifier: | oai:repositori.udl.cat:10459.1/469230 |
| Online Access: | http://hdl.handle.net/10803/696084 https://hdl.handle.net/10459.1/469230 |
| Access Level: | Open access |
| Keyword: | Virus respiratoris Virus Respiratori Sincitial Lleida Virus respiratorios Virus Respiratorio Sincitial Lérida Respiratory viruses Respiratory Syncytial Virus Microbiologia 579 |
| Summary: | La malaltia més freqüent que afecta l’espècie humana és la produïda pels virus respiratoris. La seva ràpida identificació millora l’ús d’antimicrobians, redueix exploracions innecessàries, la duració de l’estància hospitalària, i ajuda a limitar la transmissió viral entre altres avantatges. Encara que la majoria produeixen escassa morbimortalitat, alguns d’ells poden produir bronquitis, bronquiolitis o pneumònia. Aquesta tesi està formada per 3 tipus d’estudis diferenciats: L’objectiu del primer estudi ha sigut estudiar l’epidemiologia dels virus respiratoris a la província de Lleida. Es van analitzar 12.154 mostres en el laboratori de microbiologia de l’Hospital Universitari Arnau de Vilanova de Lleida (HUAV) entre 2016 i 2020. En el 48,3% d’aquestes mostres només es va realitzar l’estudi de Virus de la Grip A, Virus de la Grip B, i Virus respiratori sincitial (VRS). En la resta de mostres (n = 6.288) es van analitzar la totalitat de virus. En el 71,1% es va detectar algun virus, essent el Rhinovirus (HRV) el més freqüent (23,25%). A partir del confinament per SARS-CoV-2 van deixar de circular tots els virus fins el final de 2020 on van reaparèixer el HRV i l’Adenovirus. En el 32,6% de les mostres positives es va detectar un mínim de 2 virus, essent els més prevalents en codeteccions el Bocavirus i el Parechovirus. En el segon estudi s’ha pretès comparar dos tècniques comercials de RT-PCR múltiple per la detecció de virus respiratoris. Es van processar 257 mostres paral·lelament i el coeficient de concordança va ser elevat (κ 0,804). Allplex respiratory panel (Seegene) va detectar més HRV i LightMix (TIB Molbiol) va detectar més Metaneumovirus. L’última part de la tesi estudia si la codetecció del VRS i altres virus respiratoris afecta a la gravetat de les bronquiolitis en comparació amb la monodetecció del VRS. Es va realitzar un estudi prospectiu des de 2016 a 2019 incloent a pacients menors de 2 anys que van acudir a urgències de l’HUAV. Durant el període d’estudi es van diagnosticar 437 bronquiolitis per VRS. El 45,5% d’aquestes van presentar codetecció amb un altre virus respiratori. L’anàlisi bivariant de les dades no va mostrar diferencies estadísticament significatives entre els dos grups. La codetecció viral en pacients pediàtrics és freqüent però no sembla afectar a la gravetat d’aquesta infecció. |
|---|