Metilació d'ADN en càncer de pàncrees: el fenotip metilador d'illes CpG i el seu efecte en la supervivència
S'han analitzat les dades clíniques i de metilació de 184 càncers de pàncrees obtingudes de The Cancer Genome Atlas (TCGA) per observar les possibles relacions entre el fenotip metilador d'illes CpG (CIMP) i la supervivència. Les mostres han estat classificades mitjançant un l'algorit...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/90325 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/90325 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | CIMP metilació càncer de pàncrees methylation pancreatic cancer metilación cáncer de páncreas Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | S'han analitzat les dades clíniques i de metilació de 184 càncers de pàncrees obtingudes de The Cancer Genome Atlas (TCGA) per observar les possibles relacions entre el fenotip metilador d'illes CpG (CIMP) i la supervivència. Les mostres han estat classificades mitjançant un l'algoritme K-means i s'ha trobat que 50 tenien alts valors mitjans de metilació (CIMPH) i 56 els tenien baixos (CIMPL). S'ha analitzat les corbes de supervivència Kaplan-Meier d'aquests dos grups i s'ha vist que existeixen diferències significatives entre els dos grups, indicant que l'hipermetilació aberrant representativa de CIMPH està relacionada amb una disminució de la supervivència dels pacients de càncer de pàncrees. Un anàlisis de metilació diferencial ha permès identificar 4916 sondes amb alts nivells de metilació que corresponen a 1423 gens candidats a ser marcadors per al diagnòstic de càncer de pàncrees. Aquest treball pot ajudar a definir més clarament els subgrups CIMP dintre del càncer de pàncrees i la seva relació amb la supervivència. |
|---|