Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"

[cat] Les proteïnes HP1 (Heterocromatin protein 1) estan conservades als eucariotes, on la majoria de les espècies contenen vàries isoformes. A partir de les propietats de l'HP1a de Drosophila, s'ha proposat que les proteïnes HP1 uneixen la metilació de l'H3K9 i recluten factors invol...

Full description

Bibliographic Details
Author: Font Burgada, Joan
Format: doctoral thesis
Status:Published version
Publication Date:2009
Country:España
Institution:Universidad de Barcelona
Repository:Dipòsit Digital de la UB
OAI Identifier:oai:diposit.ub.edu:2445/41865
Online Access:https://hdl.handle.net/2445/41865
http://www.tdx.cat/TDX-0712110-115357
http://hdl.handle.net/10803/1846
Access Level:Open access
Keyword:Drosòfila melanogaster
Cromatina
Histones
Proteïnes de membrana
Regulació genètica
Expressió gènica
Drosophila melanogaster
Chromatin
Membrane proteins
Genetic regulation
Gene expression
id ES_d5bc8fa5f366c67bd69ddb5ed7d5c292
oai_identifier_str oai:diposit.ub.edu:2445/41865
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"Font Burgada, JoanDrosòfila melanogasterCromatinaHistonesProteïnes de membranaRegulació genèticaExpressió gènicaDrosophila melanogasterChromatinMembrane proteinsGenetic regulationGene expression[cat] Les proteïnes HP1 (Heterocromatin protein 1) estan conservades als eucariotes, on la majoria de les espècies contenen vàries isoformes. A partir de les propietats de l'HP1a de Drosophila, s'ha proposat que les proteïnes HP1 uneixen la metilació de l'H3K9 i recluten factors involucrats en l'ensamblatge de l'heterocromatina i el silenciament. No se sap, però, si aquest model és aplicable a totes les isoformes d'HP1 i tots el contextos funcionals. En aquest article aportem que l'HP1c regula l'expressió gènica, ja que (1) localitza a dominis de cromatina activa, on colocalitza abastament amb la forma pausada de la RNA polimerasa II (RNApolII), PolIIser5, i amb la trimetilació de l'H3K4, suggerint una contribució a la regulació transcripcional; (2) la seva localització ectòpica a un gen reporter no indueix el seu silenciament, ans el contrari, incrementa la seva expressió, i (3) interacciona amb dues proteïnes que contenen varis Zn-fingers, WOC (without children) i ROW (Relative of WOC, que són putatius factors de transcripció. També mostrem que tot i que l'HP1c s'uneix eficientment a la metilació de l'H3K9 in vitro, la seva unió a la cromatina in vivo depèn estrictament de WOC i ROW. A més a més, les anàlisis d'expressió realitzades indiquen que HP1c, WOC i ROW regulen un programa d'expressió gènica comú, el qual és executat en part, en el context del sistema nerviós. A partir d'aquestes dades, que revelen la contribució de factors que uneixen ADN a la funcionalitat i el reclutament de l'HP1c, les proteïnes HP1 emergeixen com una família de proteïnes reguladores de la cromatina cada cop més diversa.[eng] Heterochromatin protein 1 (HP1) proteins are conserved in eukaryotes, with most species containing several isoforms. Based on the properties of Drosophila HP1a, it was proposed that HP1s bind H3K9me2,3 and recruit factors involved in heterochromatin assembly and silencing. Yet, it is unclear whether this general picture applies to all HP1 isoforms and functional contexts. Here, we report that Drosophila HP1c regulates gene expression, as (1) it localizes to active chromatin domains, where it extensively colocalizes with the poised form of RNApolymerase II (RNApol II), Pol IIoser5, and H3K4me3, suggesting a contribution to transcriptional regulation; (2) its targeting to a reporter gene does not induce silencing but, on the contrary, increases its expression, and (3) it interacts with the zinc-finger proteins WOC (without children) and Relative-of-WOC (ROW), which are putative transcription factors. Here, we also show that, although HP1c efficiently binds H3K9me2,3 in vitro, its binding to chromatin strictly depends on both WOC and ROW. Moreover, expression profiling indicates that HP1c, WOC, and ROW regulate a common gene expression program that, in part, is executed in the context of the nervous system. From this study, which unveils the essential contribution of DNA-binding proteins to HP1c functionality and recruitment, HP1 proteins emerge as an increasingly diverse family of chromatin regulators.Universitat de BarcelonaAzorín, F.Marfany i Nadal, GemmaUniversitat de Barcelona. Departament de Genètica2009info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/2445/41865http://www.tdx.cat/TDX-0712110-115357http://hdl.handle.net/10803/1846Tesis Doctorals - Departament - Genèticareponame:Dipòsit Digital de la UBinstname:Universidad de BarcelonaCatalán(c) Font Burgada, 2009info:eu-repo/semantics/openAccessoai:diposit.ub.edu:2445/418652026-05-27T06:46:51Z
dc.title.none.fl_str_mv Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
title Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
spellingShingle Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
Font Burgada, Joan
Drosòfila melanogaster
Cromatina
Histones
Proteïnes de membrana
Regulació genètica
Expressió gènica
Drosophila melanogaster
Chromatin
Membrane proteins
Genetic regulation
Gene expression
title_short Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
title_full Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
title_fullStr Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
title_full_unstemmed Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
title_sort Caracterització funcional d'HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de "Drosophila"
dc.creator.none.fl_str_mv Font Burgada, Joan
author Font Burgada, Joan
author_facet Font Burgada, Joan
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Azorín, F.
Marfany i Nadal, Gemma
Universitat de Barcelona. Departament de Genètica
dc.subject.none.fl_str_mv Drosòfila melanogaster
Cromatina
Histones
Proteïnes de membrana
Regulació genètica
Expressió gènica
Drosophila melanogaster
Chromatin
Membrane proteins
Genetic regulation
Gene expression
topic Drosòfila melanogaster
Cromatina
Histones
Proteïnes de membrana
Regulació genètica
Expressió gènica
Drosophila melanogaster
Chromatin
Membrane proteins
Genetic regulation
Gene expression
description [cat] Les proteïnes HP1 (Heterocromatin protein 1) estan conservades als eucariotes, on la majoria de les espècies contenen vàries isoformes. A partir de les propietats de l'HP1a de Drosophila, s'ha proposat que les proteïnes HP1 uneixen la metilació de l'H3K9 i recluten factors involucrats en l'ensamblatge de l'heterocromatina i el silenciament. No se sap, però, si aquest model és aplicable a totes les isoformes d'HP1 i tots el contextos funcionals. En aquest article aportem que l'HP1c regula l'expressió gènica, ja que (1) localitza a dominis de cromatina activa, on colocalitza abastament amb la forma pausada de la RNA polimerasa II (RNApolII), PolIIser5, i amb la trimetilació de l'H3K4, suggerint una contribució a la regulació transcripcional; (2) la seva localització ectòpica a un gen reporter no indueix el seu silenciament, ans el contrari, incrementa la seva expressió, i (3) interacciona amb dues proteïnes que contenen varis Zn-fingers, WOC (without children) i ROW (Relative of WOC, que són putatius factors de transcripció. També mostrem que tot i que l'HP1c s'uneix eficientment a la metilació de l'H3K9 in vitro, la seva unió a la cromatina in vivo depèn estrictament de WOC i ROW. A més a més, les anàlisis d'expressió realitzades indiquen que HP1c, WOC i ROW regulen un programa d'expressió gènica comú, el qual és executat en part, en el context del sistema nerviós. A partir d'aquestes dades, que revelen la contribució de factors que uneixen ADN a la funcionalitat i el reclutament de l'HP1c, les proteïnes HP1 emergeixen com una família de proteïnes reguladores de la cromatina cada cop més diversa.
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/2445/41865
http://www.tdx.cat/TDX-0712110-115357
http://hdl.handle.net/10803/1846
url https://hdl.handle.net/2445/41865
http://www.tdx.cat/TDX-0712110-115357
http://hdl.handle.net/10803/1846
dc.language.none.fl_str_mv Catalán
language_invalid_str_mv Catalán
dc.rights.none.fl_str_mv (c) Font Burgada, 2009
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv (c) Font Burgada, 2009
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
dc.source.none.fl_str_mv Tesis Doctorals - Departament - Genètica
reponame:Dipòsit Digital de la UB
instname:Universidad de Barcelona
instname_str Universidad de Barcelona
reponame_str Dipòsit Digital de la UB
collection Dipòsit Digital de la UB
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869420751842443264
score 15,300724

Similar Items