Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function

Salichs Fradera, Eulàlia

Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function

PolyHistidine repeats and DYRK1A: from the localization to the function<br/>El principal objectiu d'aquesta tesi ha estat el d'esbrinar noves funcions de la proteína quinasa DYRK1A en el nucli cel.lular. Donat que el domini de repetició d'histidines de DYRK1A dirigeix la proteín...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor:	Salichs Fradera, Eulàlia
Formato:	tesis doctoral
Estado:	Versión publicada
Fecha de publicación:	2008
País:	España
Recursos:	CBUC, CESCA
Repositorio:	TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:	oai:www.tdx.cat:10803/7119
Acesso em linha:	http://www.tdx.cat/TDX-0305109-143811 http://hdl.handle.net/10803/7119
Access Level:	acceso abierto
Palavra-chave:	polyHistidine repeat-containing proteins polyHistidine repeats nuclear speckles nuclear dynamics DYRK1A Brn-3b speckles nuclears SFC (compartiment de factors d'splicing) RNA polimerasa II repeticions d'histidines repeticions d'aminoacids unics proteïnes amb repeticions d'histidines proteina quinasa factor de transcripcio dinamica intranuclear protein kinase RNA polymerase II SFC (splicing factor compartment) single amino acid repeats transcription factor 577

id	ES_d3b9535c2c1c77f3c7ba4cd79e889cd3
oai_identifier_str	oai:www.tdx.cat:10803/7119
network_acronym_str	ES
network_name_str	España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
title	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
spellingShingle	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function Salichs Fradera, Eulàlia polyHistidine repeat-containing proteins polyHistidine repeats nuclear speckles nuclear dynamics DYRK1A Brn-3b speckles nuclears SFC (compartiment de factors d'splicing) RNA polimerasa II repeticions d'histidines repeticions d'aminoacids unics proteïnes amb repeticions d'histidines proteina quinasa factor de transcripcio DYRK1A dinamica intranuclear Brn-3b protein kinase RNA polymerase II SFC (splicing factor compartment) single amino acid repeats transcription factor 577
title_short	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
title_full	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
title_fullStr	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
title_full_unstemmed	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
title_sort	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function
dc.creator.none.fl_str_mv	Salichs Fradera, Eulàlia
author	Salichs Fradera, Eulàlia
author_facet	Salichs Fradera, Eulàlia
author_role	author
dc.contributor.none.fl_str_mv	La Luna, Susana de Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.subject.none.fl_str_mv	polyHistidine repeat-containing proteins polyHistidine repeats nuclear speckles nuclear dynamics DYRK1A Brn-3b speckles nuclears SFC (compartiment de factors d'splicing) RNA polimerasa II repeticions d'histidines repeticions d'aminoacids unics proteïnes amb repeticions d'histidines proteina quinasa factor de transcripcio DYRK1A dinamica intranuclear Brn-3b protein kinase RNA polymerase II SFC (splicing factor compartment) single amino acid repeats transcription factor 577
topic	polyHistidine repeat-containing proteins polyHistidine repeats nuclear speckles nuclear dynamics DYRK1A Brn-3b speckles nuclears SFC (compartiment de factors d'splicing) RNA polimerasa II repeticions d'histidines repeticions d'aminoacids unics proteïnes amb repeticions d'histidines proteina quinasa factor de transcripcio DYRK1A dinamica intranuclear Brn-3b protein kinase RNA polymerase II SFC (splicing factor compartment) single amino acid repeats transcription factor 577
description	PolyHistidine repeats and DYRK1A: from the localization to the function<br/>El principal objectiu d'aquesta tesi ha estat el d'esbrinar noves funcions de la proteína quinasa DYRK1A en el nucli cel.lular. Donat que el domini de repetició d'histidines de DYRK1A dirigeix la proteína al compartiment d'speckles nuclears, aquesta propietat ha estat utilitzada per adreçar aquesta pregunta. Els resultats obtinguts en aquesta tesi han permès proposar els homopolímers d'histidina com una nova i general senyal de localització a speckles nuclears. Proteïnes amb segments de polihistidines, la majoria d'elles factors de transcripció, mostren un comportament intranuclear dinàmic, compatible amb un model en el quèl diferents dominis d'interacció competeixen entre ells pel reclutament de la proteína a diferents subcompartiments nuclears. El mecanisme molecular que media l'acumulació a speckles de les proteïnes amb polihistines s'ha estudiat utilitzant DYRK1A com a model. Els resultats obtinguts exclouen la unió a l'RNA com a mecanisme de reclutament i concloure que, aquest, ocorre mitjançant la interacció amb proteïnes residents. S'han identificat dues noves proteïnes interactores per a DYRK1A, l'RNA polimerasa II i el factor de transcripció Brn-3b. La fosforilació de DYRK1A sobre el domini C-terminal o CTD de l'RNA polimerasa II suggereix una funció directa de la quinasa en el procés de transcripció o del seu acoblament al processament d'RNAs missatgers. La fosforilació de DYRK1A sobre el domini d'activació de Brn-3b sembla regular positivament l'activitat transcripcional d'aquest factor. Aquests resultats indiquen una funció activa de DYRK1A en la regulació de la transcripció gènica, tant directament sobre la maquinària transcripcional com indirectament, modulant l'activitat de factors de transcripció. <br/>PolyHistidine repeats and DYRK1A: from the localization to the function<br/>The main objective of this thesis work has been to identify new roles for the protein kinase DYRK1A in the cell nucleus. Given that a histidine repeat in DYRK1A targets the protein to the nuclear speckle compartment, this property has been used as a tool to approach the question. The results obtained in this thesis work have allowed proposing homopolymeric histidine runs as a novel and general nuclear speckle-directing signal. Proteins with polyHistidine segments, mostly transcription factors, present a dynamic intranuclear behaviour compatible with a model in which distinct interacting domains compete for recruiting elements within the nucleus. The molecular mechanisms that mediate speckle accumulation have been studied in DYRK1A as a model system. The results allow excluding RNA binding as the recruiting mechanism and concluding that targeting is mediated by interaction with speckle-resident proteins. Two novel DYRK1A interactors have been identified during the study, the RNA polymerase II and the transcription factor Brn-3b. DYRK1A phosphorylation of the C-terminal domain or CTD of the RNA polymerase II suggests a direct role of DYRK1A on transcription or coupling of transcription with RNA processing. DYRK1A phosphorylation of Brn-3b within its activation domain seems to positively regulate Brn-3b transcriptional activity. These results confirm an active role for DYRK1A in gene transcription regulation both direct on the transcriptional machinery and indirect by modulating the activity of transcription factors.
publishDate	2008
dc.date.none.fl_str_mv	2008 2009 2009 2011
dc.type.none.fl_str_mv	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format	doctoralThesis
status_str	publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv	http://www.tdx.cat/TDX-0305109-143811 http://hdl.handle.net/10803/7119
url	http://www.tdx.cat/TDX-0305109-143811 http://hdl.handle.net/10803/7119
dc.language.none.fl_str_mv	Inglés
language_invalid_str_mv	Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv	info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv	openAccess
dc.format.none.fl_str_mv	application/pdf application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv	Universitat Pompeu Fabra
publisher.none.fl_str_mv	Universitat Pompeu Fabra
dc.source.none.fl_str_mv	TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red instname:CBUC, CESCA
instname_str	CBUC, CESCA
reponame_str	TDR. Tesis Doctorales en Red
collection	TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_	1869420484460806144
spelling	Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the functionSalichs Fradera, EulàliapolyHistidine repeat-containing proteinspolyHistidine repeatsnuclear specklesnuclear dynamicsDYRK1ABrn-3bspeckles nuclearsSFC (compartiment de factors d'splicing)RNA polimerasa IIrepeticions d'histidinesrepeticions d'aminoacids unicsproteïnes amb repeticions d'histidinesproteina quinasafactor de transcripcioDYRK1Adinamica intranuclearBrn-3bprotein kinaseRNA polymerase IISFC (splicing factor compartment)single amino acid repeatstranscription factor577PolyHistidine repeats and DYRK1A: from the localization to the function<br/>El principal objectiu d'aquesta tesi ha estat el d'esbrinar noves funcions de la proteína quinasa DYRK1A en el nucli cel.lular. Donat que el domini de repetició d'histidines de DYRK1A dirigeix la proteína al compartiment d'speckles nuclears, aquesta propietat ha estat utilitzada per adreçar aquesta pregunta. Els resultats obtinguts en aquesta tesi han permès proposar els homopolímers d'histidina com una nova i general senyal de localització a speckles nuclears. Proteïnes amb segments de polihistidines, la majoria d'elles factors de transcripció, mostren un comportament intranuclear dinàmic, compatible amb un model en el quèl diferents dominis d'interacció competeixen entre ells pel reclutament de la proteína a diferents subcompartiments nuclears. El mecanisme molecular que media l'acumulació a speckles de les proteïnes amb polihistines s'ha estudiat utilitzant DYRK1A com a model. Els resultats obtinguts exclouen la unió a l'RNA com a mecanisme de reclutament i concloure que, aquest, ocorre mitjançant la interacció amb proteïnes residents. S'han identificat dues noves proteïnes interactores per a DYRK1A, l'RNA polimerasa II i el factor de transcripció Brn-3b. La fosforilació de DYRK1A sobre el domini C-terminal o CTD de l'RNA polimerasa II suggereix una funció directa de la quinasa en el procés de transcripció o del seu acoblament al processament d'RNAs missatgers. La fosforilació de DYRK1A sobre el domini d'activació de Brn-3b sembla regular positivament l'activitat transcripcional d'aquest factor. Aquests resultats indiquen una funció activa de DYRK1A en la regulació de la transcripció gènica, tant directament sobre la maquinària transcripcional com indirectament, modulant l'activitat de factors de transcripció. <br/>PolyHistidine repeats and DYRK1A: from the localization to the function<br/>The main objective of this thesis work has been to identify new roles for the protein kinase DYRK1A in the cell nucleus. Given that a histidine repeat in DYRK1A targets the protein to the nuclear speckle compartment, this property has been used as a tool to approach the question. The results obtained in this thesis work have allowed proposing homopolymeric histidine runs as a novel and general nuclear speckle-directing signal. Proteins with polyHistidine segments, mostly transcription factors, present a dynamic intranuclear behaviour compatible with a model in which distinct interacting domains compete for recruiting elements within the nucleus. The molecular mechanisms that mediate speckle accumulation have been studied in DYRK1A as a model system. The results allow excluding RNA binding as the recruiting mechanism and concluding that targeting is mediated by interaction with speckle-resident proteins. Two novel DYRK1A interactors have been identified during the study, the RNA polymerase II and the transcription factor Brn-3b. DYRK1A phosphorylation of the C-terminal domain or CTD of the RNA polymerase II suggests a direct role of DYRK1A on transcription or coupling of transcription with RNA processing. DYRK1A phosphorylation of Brn-3b within its activation domain seems to positively regulate Brn-3b transcriptional activity. These results confirm an active role for DYRK1A in gene transcription regulation both direct on the transcriptional machinery and indirect by modulating the activity of transcription factors.Programa de doctorat en BiomedicinaUniversitat Pompeu FabraLa Luna, Susana deUniversitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut2011200920082009info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfapplication/pdfhttp://www.tdx.cat/TDX-0305109-143811http://hdl.handle.net/10803/7119TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/71192026-06-14T12:46:07Z
score	15,300724

Polyhistidine repeats and Dyrk 1a: from the localization on the function

Registos relacionados