Segmentación de gliomas en imagen de resonancia magnética multimodal

RESUMEN: El glioma es el tipo de tumor cerebral más común, presentando distintos grados de malignidad y agresividad, así como un pronóstico variable. La gran variabilidad que caracteriza a estas lesiones implica un estudio completamente único, así como un tratamiento personalizado. Es por esto que l...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Noriega Puente, Andrea
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2019
País:España
Institución:Universidad de Cantabria (UC)
Repositorio:UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria
Idioma:español
OAI Identifier:oai:repositorio.unican.es:10902/17859
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10902/17859
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Deep Learning
Glioma
Segmentación
Neuroimagen
Imagen médica
Segmentation
Neuroimaging
Medical image
Descripción
Sumario:RESUMEN: El glioma es el tipo de tumor cerebral más común, presentando distintos grados de malignidad y agresividad, así como un pronóstico variable. La gran variabilidad que caracteriza a estas lesiones implica un estudio completamente único, así como un tratamiento personalizado. Es por esto que la segmentación manual de este tipo de lesiones supone tanto un gran consumo de tiempo como un trabajo duro para el experto, el cual implica el análisis multimodal de varias secuencias diferentes, normalmente, de Resonancia Magnética. En este trabajo se presenta un modelo de segmentación automática de gliomas de alto grado, HGG, cuya arquitectura se basa en el empleo de redes neuronales convolucionales simétricas, denominada U-Net. Para el entrenamiento del modelo se ha hecho uso del conjunto de datos del Data Challenge BraTS 2018 (Brain Tumor Segmentation), compuesto por un total de 237 estudios de IRM, 162 HGG y 75 LGG, de los que solo se han empleado los primeros. Los resultados en cuanto a la obtención de mapas binarios de segmentación de los tumores han sido positivos. Se ha calculado el coeficiente DICE medio, relacionado con la calidad de la determinación de la forma del tumor, logrando 0:64 +- 0:39 para el modelo entrenado con imágenes T1, y 0:57 +- 0:41 para el modelo entrenado con secuencias T1 con contraste. Cualitativamente se ha observado además un buen desempeño a la hora de localizar espacialmente los tumores, incluso si la forma no es determinada tan precisamente.