Transcriptome profiling and longitudinal cohort studies of myositis subsets

Les miopaties inflamatòries són una família heterogènia de malalties autoimmunes rares que afecten múltiples òrgans i sistemes, inclosos els músculs, la pell, els pulmons i/o les articulacions. Definir-ne amb precisió la patogènia i classificar-les correctament és clau per comprendre i manejar aques...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor: Pinal-Fernandez, Iago
Formato: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2020
País:España
Recursos:Universitat Oberta de Catalunya (UOC)
Repositorio:O2, repositorio institucional de la UOC
OAI Identifier:oai:openaccess.uoc.edu:10609/138315
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/10609/138315
Access Level:acceso abierto
Palavra-chave:miositis
dermatomiositis
polimiositis
miopatia per cossos d'inclusió
seqüenciació d'ARN
bioinformàtica
miopatía por cuerpos de inclusión
bioinformática
myositis
dermatomyositis
polymyositis
inclusion body myositis
secuenciación de ARN
sequence analysis, RNA
bioinformatics
Bioinformatics
Bioinformàtica
Bioinformática
Descrição
Resumo:Les miopaties inflamatòries són una família heterogènia de malalties autoimmunes rares que afecten múltiples òrgans i sistemes, inclosos els músculs, la pell, els pulmons i/o les articulacions. Definir-ne amb precisió la patogènia i classificar-les correctament és clau per comprendre i manejar aquestes malalties. En aquesta tesi doctoral explorem subconjunts específics de miositis definides per autoanticossos i comparem quantitativament la capacitat dels autoanticossos amb la classificació EULAR/ACR de 2017 per predir el fenotip de pacients amb miositis. A més, realitzem la seqüenciació d'ARN en 119 biòpsies musculars de pacients amb diferents tipus de miositis i 20 controls. Estudiem l'expressió diferencial, fem anàlisis de vies i desenvolupem processos d'aprenentatge automàtic exploratoris per definir els perfils específics d'expressió i les vies patogèniques a cada subgrup de malalties. Amb aquests estudis determinem que els autoanticossos superen els criteris clínics actuals per predir el fenotip dels pacients amb miositis i descobrim perfils d'expressió únics al teixit muscular de pacients amb diferents tipus de miositis.