Fully exploiting SNP arrays to uncover underlying genomic variation for health association studies
Els polimorfismes de nucleòtid únic (SNPs, per les seves sigles en anglès) són la pedra angular de la variació genòmica, però per si sols no poden explicar tot l'espectre de diferències fenotípiques que existeixen entre els humans. Tot i així, quan s'analitzen amb les eines adients, els SN...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2024 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Repositorio: | Dipòsit Digital de Documents de la UAB |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:ddd.uab.cat:304756 |
| Acceso en línea: | https://ddd.uab.cat/record/304756 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Variació genòmica Genomic variation Variación genómica Array d'SNPs SNP array Salut humana Human health Salud humana Ciències de la Salut |
| Sumario: | Els polimorfismes de nucleòtid únic (SNPs, per les seves sigles en anglès) són la pedra angular de la variació genòmica, però per si sols no poden explicar tot l'espectre de diferències fenotípiques que existeixen entre els humans. Tot i així, quan s'analitzen amb les eines adients, els SNPs poden ser fonamentals per detectar diferents tipus de variació genòmica subjacent. L'objectiu d'aquesta tesi és demostrar el potencial que tenen les dades d'arrays de SNPs per generar nous coneixements sobre el rol de la variació genòmica complexa en estudis de salut humana. Inicialment, vam dur a terme una revisió de diverses eines de programari dissenyades per a aquest propòsit. Posteriorment, vam aplicar cinc d'aquestes eines en estudis de recerca, generant nous coneixements sobre l'impacte de la variació genòmica complexa en la salut infantil i les conseqüències de la COVID-19. La nostra investigació sobre la salut infantil va identificar dues variacions en el número de còpies (CNVs) que influeixen en el metabolisme de la desintoxicació dels ftalats, així com dos loci on la presència de segments d'homozigosi (ROHs) s'associa amb l'índex ponderal i dos més relacionats amb la capacitat de concentració. En el context de la COVID-19, vam descobrir quatre loci de risc relacionats amb la presència de ROH i vam demostrar que ROHs, alteracions cromosòmiques en mosaic (mCAs) i la pèrdua del cromosoma Y (LOY) contribueixen al biaix de gènere observat en la gravetat i mortalitat de la malaltia. Al final d'aquesta tesi, documentem el nostre treball en sportòmica, començant amb la investigació bàsica d'SNPs i seguint amb l'aplicació dels nostres coneixements sobre la variació genòmica en diferents scores de risc poligènic (PRSs). Finalment, culminem amb la translació d'aquesta recerca en aplicacions pràctiques, tant per a atletes d'elit com per a amateurs. |
|---|