Desarrollo de herramientas bioinformáticas para el análisis de datos genómicos y su aplicación en estudios poblacionales y SARS-CoV-2
Desde el inicio de la pandemia de COVID-19, nuestras investigaciones han avanzado en el análisis del SARS-CoV-2, investigando su origen e identificando a los supercontagiadores como motores clave de su propagación. Desarrollamos CovidPhy, herramienta bioinformática para clasificar genomas, detectar...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2025 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad de Santiago de Compostela (USC) |
| Repositorio: | Minerva. Repositorio Institucional de la Universidad de Santiago de Compostela |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:minerva.usc.gal:10347/42095 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/10347/42095 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | COVID filogenia supercontagio bioinformática 241007 Genética humana 230221 Biología molecular 242008 Virus respiratorios |
| Sumario: | Desde el inicio de la pandemia de COVID-19, nuestras investigaciones han avanzado en el análisis del SARS-CoV-2, investigando su origen e identificando a los supercontagiadores como motores clave de su propagación. Desarrollamos CovidPhy, herramienta bioinformática para clasificar genomas, detectar variantes de preocupación y eventos de supercontagio. Construimos una filogenia mutacional que reveló patrones de transmisión global y linajes clave. Además, implementamos la datación molecular viral (VMCD), útil para estimar con precisión la circulación del virus y con aplicaciones forenses en el intervalo post-mortem. Estos desarrollos aportan herramientas esenciales para gestionar brotes y prevenir futuras pandemias. |
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