Diagnóstico y caracterización molecular de la peste porcina africana (PPA). MOLDAVIA. Informe emitido por el Laboratorio de Referencia de la Unión Europea de Peste porcina africana (EURL-PPA), CISA-INIA/CSIC
Scientific-technical report on the diagnostic confirmation and molecular characterization of viruses circulating in specific áreas of Moldova, based on 15 samples from wild boar and domestic pig, received at the EU Reference Laboratory (EURL) of CISA-INIA/CSIC. This report consists of 8 pages and in...
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| Fecha de publicación: | 2025 |
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| Institución: | Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) |
| Repositorio: | DIGITAL.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC |
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| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10261/405725 |
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Diagnóstico y caracterización molecular de la peste porcina africana (PPA). MOLDAVIA. Informe emitido por el Laboratorio de Referencia de la Unión Europea de Peste porcina africana (EURL-PPA), CISA-INIA/CSIC African Swine Fever (ASF) diagnosis and molecular characterization. MOLDOVA. Report issued by the European Union Reference Laboratory for African swine fever EURL-ASF), CISA-INIA/CSIC |
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Diagnóstico y caracterización molecular de la peste porcina africana (PPA). MOLDAVIA. Informe emitido por el Laboratorio de Referencia de la Unión Europea de Peste porcina africana (EURL-PPA), CISA-INIA/CSIC Gallardo Frontaura, María de Carmen peste porcina africana african swine fever diagnóstico genotipado variantes virus laboratorio nacional de referencia laboratorio de referencia de la unión europea(ue) LNR NRL EURL |
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Scientific-technical report on the diagnostic confirmation and molecular characterization of viruses circulating in specific áreas of Moldova, based on 15 samples from wild boar and domestic pig, received at the EU Reference Laboratory (EURL) of CISA-INIA/CSIC. This report consists of 8 pages and includes the results obtained from the received samples of spleen, and bone marrow, using validated diagnostic and genotyping techniques: virological (PCR, virus isolation, haemadsorption test) and serological (ELISA screening and confirmatory Immunoperoxidase Test). Genotyping and molecular characterization studies were conducted, including molecular studies and sequence analysis, of six different genome regions: CVR, IGR I73R/I329L, O174L, K145R, IGR MGF505 9R/10R, and ECO2 as genetic subtyping markers previously described by Gallardo et al., 2023 (Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850); Giammarioli et al., 2024 (Viruses. 2024;16(8):1185), and specific unpublished information from the EURL. The report includes an updated subtyping table showing groups based on variants identified since 2007 in Europe following molecular analysis of the six variable regions mentioned above of the African Swine Fever virus.[EN] Informe científico-técnico de confirmación diagnóstica y caracterización molecular de virus circulantes en áreas geográficas específicas de Moldavia, a partir de 15 muestras de cerdos domésticos y jabalí recibidas en el Laboratorio de Referencia de la UE (EURL), del CISA-INIA/CSIC. Este Informe consta de 8 páginas, e incluye los resultados obtenidos en las muestras recibidas de bazo y médula ósea, empleando técnicas validadas de diagnóstico y para la investigación epidemiológica: virológicas (PCR, virus isolation, haemadsorption test) y serológicas (ELISA screening y de confirmación Immunoperoxidase Test)Se realizan estudios de genotipado y de caracterización molecular que incluyó estudios moleculares y análisis de secuencias de 6 regiones diferentes del genoma, CVR, IGR I73R/I329L, O174L, K145R, IGR MGF505 9R/10R, and ECO2 como marcadores genéticos de subtipado descritos previamente en estudios previos por gallardo et al, 2023 (Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850); Giammarioli et al., 2024 (Viruses. 2024;16(8):1185), e información específica no publicada del EURL. El informe incluye una tabla actualizada de subtipado mostrando grupos basados en variantes identificadas desde 2007 en Europa tras el análisis molecular de las 6 regiones variables mencionadas del virus de la Peste porcina Africana.[ES] |
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Fernández-Pinero J, Gallardo C, Elizalde M, Robles A, Gómez C, Bishop R, Heath L, Couacy-Hymann E, Fasina FO, Pelayo V, Soler A, Arias M, Molecular diagnosis of African swine fever by a new real-time PCR using universal probe library (2013). Transbound Emerg Dis 60 (2013) 48–58. doi: 10.1111/j.1865-1682.2012.01317.x. Epub 2012 Mar 7. Forth JH, Calvelage S, Fischer M, Hellert J, Sehl-Ewert J, Roszyk H, Deutschmann P, Reichold A, Lange M, Thulke HH, Sauter-Louis C, Höper D, Mandyhra S, Sapachova M, Beer M, Blome S. African swine fever virus - variants on the rise. Emerg Microbes Infect. 2023 Dec;12(1):2146537. doi: 10.1080/22221751.2022.2146537. Gallardo, C., Fernández-Pinero, J., Pelayo, V., Gazaev, I., Markowska-Daniel, I., Pridotkas, G., Nieto, R., Fernández-Pacheco, P., Bokhan, S., Nevolko, O., Drozhzhe, Z., Pérez, C., Soler, A., Kolvasov, D., & Arias, M. (2014). Genetic variation among African swine fever genotype II viruses, eastern and central Europe. Emerging infectious diseases, 20(9), 1544–1547. https://doi.org/10.3201/eid2009.140554 Gallardo C, Casado N, Soler A, Djadjovski I, Krivko L, Madueño E, Nieto R, Perez C, Simon A, Ivanova E, Donescu D, Milicevik V, Chondrokouki E, Nurmoja I, Frant M, Feliziani F, Václavek P, Pileviciene S, Arias M.A multi gene-approach genotyping method identifies 24 genetic clusters within the genotype II-European African swine fever viruses circulating from 2007 to 2022. Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850. doi: 10.3389/fvets.2023.1112850 Giammarioli M, Torresi C, Biccheri R, et al. Genetic Characterization of African Swine Fever Italian Clusters in the 2022-2023 Epidemic Wave by a Multi-Gene Approach. Viruses. 2024;16(8):1185. Published 2024 Jul 24. doi:10.3390/v16081185 Mazur-Panasiuk N, Walczak M, Juszkiewicz M, Woźniakowski G. The Spillover of African Swine Fever in Western Poland Revealed Its Estimated Origin on the Basis of O174L, K145R, MGF 505-5R and IGR I73R/I329L Genomic Sequences. Viruses. 2020 Sep 27;12(10):1094. doi: 10.3390/v12101094. PMID: 32992547; PMCID: PMC7601147 Nix, R. J., Gallardo, C., Hutchings, G., Blanco, E., & Dixon, L. K. (2006). Molecular epidemiology of African swine fever virus studied by analysis of four variable genome regions. Archives of virology, 151(12), 2475–2494. https://doi.org/10.1007/s00705-006-0794-z Quembo, C. J., Jori, F., Vosloo, W., & Heath, L. (2018). Genetic characterization of African swine fever virus isolates from soft ticks at the wildlife/domestic interface in Mozambique and identification of a novel genotype. Transboundary and emerging diseases, 65(2), 420– 431. https://doi.org/10.1111/tbed.12700 WOAH. May 2021. posting date. Chapter 3.9.1. African swine fever (Infection with African swine fever virus). In Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals 2021. World Organization for Animal Health. Paris. France https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/3.09.01_ASF.pdf Sí |
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Diagnóstico y caracterización molecular de la peste porcina africana (PPA). MOLDAVIA. Informe emitido por el Laboratorio de Referencia de la Unión Europea de Peste porcina africana (EURL-PPA), CISA-INIA/CSICAfrican Swine Fever (ASF) diagnosis and molecular characterization. MOLDOVA. Report issued by the European Union Reference Laboratory for African swine fever EURL-ASF), CISA-INIA/CSICGallardo Frontaura, María de CarmenArias Neira, María Luisapeste porcina africanaafrican swine feverdiagnósticogenotipadovariantes viruslaboratorio nacional de referencialaboratorio de referencia de la unión europea(ue)LNRNRLEURLScientific-technical report on the diagnostic confirmation and molecular characterization of viruses circulating in specific áreas of Moldova, based on 15 samples from wild boar and domestic pig, received at the EU Reference Laboratory (EURL) of CISA-INIA/CSIC. This report consists of 8 pages and includes the results obtained from the received samples of spleen, and bone marrow, using validated diagnostic and genotyping techniques: virological (PCR, virus isolation, haemadsorption test) and serological (ELISA screening and confirmatory Immunoperoxidase Test). Genotyping and molecular characterization studies were conducted, including molecular studies and sequence analysis, of six different genome regions: CVR, IGR I73R/I329L, O174L, K145R, IGR MGF505 9R/10R, and ECO2 as genetic subtyping markers previously described by Gallardo et al., 2023 (Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850); Giammarioli et al., 2024 (Viruses. 2024;16(8):1185), and specific unpublished information from the EURL. The report includes an updated subtyping table showing groups based on variants identified since 2007 in Europe following molecular analysis of the six variable regions mentioned above of the African Swine Fever virus.[EN] Informe científico-técnico de confirmación diagnóstica y caracterización molecular de virus circulantes en áreas geográficas específicas de Moldavia, a partir de 15 muestras de cerdos domésticos y jabalí recibidas en el Laboratorio de Referencia de la UE (EURL), del CISA-INIA/CSIC. Este Informe consta de 8 páginas, e incluye los resultados obtenidos en las muestras recibidas de bazo y médula ósea, empleando técnicas validadas de diagnóstico y para la investigación epidemiológica: virológicas (PCR, virus isolation, haemadsorption test) y serológicas (ELISA screening y de confirmación Immunoperoxidase Test)Se realizan estudios de genotipado y de caracterización molecular que incluyó estudios moleculares y análisis de secuencias de 6 regiones diferentes del genoma, CVR, IGR I73R/I329L, O174L, K145R, IGR MGF505 9R/10R, and ECO2 como marcadores genéticos de subtipado descritos previamente en estudios previos por gallardo et al, 2023 (Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850); Giammarioli et al., 2024 (Viruses. 2024;16(8):1185), e información específica no publicada del EURL. 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Genetic variation among African swine fever genotype II viruses, eastern and central Europe. Emerging infectious diseases, 20(9), 1544–1547. https://doi.org/10.3201/eid2009.140554Gallardo C, Casado N, Soler A, Djadjovski I, Krivko L, Madueño E, Nieto R, Perez C, Simon A, Ivanova E, Donescu D, Milicevik V, Chondrokouki E, Nurmoja I, Frant M, Feliziani F, Václavek P, Pileviciene S, Arias M.A multi gene-approach genotyping method identifies 24 genetic clusters within the genotype II-European African swine fever viruses circulating from 2007 to 2022. Front Vet Sci. 2023 Jan 25;10:1112850. doi: 10.3389/fvets.2023.1112850Giammarioli M, Torresi C, Biccheri R, et al. Genetic Characterization of African Swine Fever Italian Clusters in the 2022-2023 Epidemic Wave by a Multi-Gene Approach. Viruses. 2024;16(8):1185. Published 2024 Jul 24. doi:10.3390/v16081185Mazur-Panasiuk N, Walczak M, Juszkiewicz M, Woźniakowski G. The Spillover of African Swine Fever in Western Poland Revealed Its Estimated Origin on the Basis of O174L, K145R, MGF 505-5R and IGR I73R/I329L Genomic Sequences. Viruses. 2020 Sep 27;12(10):1094. doi: 10.3390/v12101094. PMID: 32992547; PMCID: PMC7601147Nix, R. J., Gallardo, C., Hutchings, G., Blanco, E., & Dixon, L. K. (2006). Molecular epidemiology of African swine fever virus studied by analysis of four variable genome regions. Archives of virology, 151(12), 2475–2494. https://doi.org/10.1007/s00705-006-0794-zQuembo, C. J., Jori, F., Vosloo, W., & Heath, L. (2018). Genetic characterization of African swine fever virus isolates from soft ticks at the wildlife/domestic interface in Mozambique and identification of a novel genotype. Transboundary and emerging diseases, 65(2), 420– 431. https://doi.org/10.1111/tbed.12700WOAH. May 2021. posting date. Chapter 3.9.1. African swine fever (Infection with African swine fever virus). 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