Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica

El locus STM2209-STM2208 (opvAB) es exclusivo de Salmonella enterica y presenta características típicas de genes adquiridos por transferencia horizontal. Fue descrito inicialmente como un locus reprimido por metilación Dam. Sin embargo, durante el desarrollo de esta tesis se ha establecido que la me...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Cota García, Ignacio
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2016
País:España
Institución:Universidad de Sevilla (US)
Repositorio:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
OAI Identifier:oai:idus.us.es:11441/34335
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/11441/34335
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Salmonella
id ES_9f90efcdaf70f690a49f22fdb9f2e914
oai_identifier_str oai:idus.us.es:11441/34335
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entéricaCota García, IgnacioSalmonellaEl locus STM2209-STM2208 (opvAB) es exclusivo de Salmonella enterica y presenta características típicas de genes adquiridos por transferencia horizontal. Fue descrito inicialmente como un locus reprimido por metilación Dam. Sin embargo, durante el desarrollo de esta tesis se ha establecido que la metilación Dam no reprime simplemente la expresión de opvAB, sino que forma parte de un mecanismo complejo de regulación que da lugar a dos subpoblaciones genéticamente iguales pero con distinto nivel de expresión de opvAB. Otro factor fundamental para la formación de estas subpoblaciones es OxyR, un factor de transcripción de tipo LysR. La regulación de la expresión de opvAB es transcripcional y se ejerce a través de una secuencia reguladora situada en la región 5’ previa al promotor de opvAB, en la cual se incluyen cuatro sitios GATC y sitios de unión de OxyR que solapan con ellos. La eliminación de los sitios GATC de esta secuencia reguladora elimina la variación de fase y permite la expresión constitutiva de opvAB. La síntesis de OpvA y OpvB modifica la estructura del lipopolisacárido, reduciendo la longitud predominante del antígeno O a 3-8 unidades de repetición. La expresión de opvAB y la consecuente alteración del la estructura del antígeno O divide las poblaciones de Salmonella enterica en dos subpoblaciones: la subpoblación mayoritaria OpvABOFF es virulenta y sensible a bacteriófagos que usan el antígeno O como receptor. La subpoblación minoritaria OpvABON es resistente a dichos bacteriófagos y avirulenta. La expresión variable de opvAB constituye un mecanismo epigenético y reversible de resistencia a bacteriófagos que utilizan el antígeno O como receptor. En presencia del bacteriófago, la subpoblación OpvABOFF es eliminada y se seleccionan las células OpvABON. Cuando el bacteriófago desaparece, la alta tasa de transición ON®OFF permite la rápida regeneración de la subpoblación OpvABOFF. La formación de subpoblaciones OpvABOFF y OpvABON depende de la formación de patrones de metilación específicos en los cuatro sitios GATC situados en la región reguladora de opvAB. En fase OFF, los sitios GATC1 y GATC3 están protegidos por la proteína OxyR y se encuentran desmetilados, mientras que GATC2 y GATC4 son metilados. En fase ON, el patrón es el contrario: OxyR protege los sitios GATC2 y GATC4 de ser metilados, mientras que GATC1 y GATC3 son metilados. Se han identificado factores auxiliares que participan en la formación de las subpoblaciones OpvABOFF y OpvABON. SeqA es una proteína de unión a sitios GATC que reprime específicamente la tasa de transición OFF®ON. La proteína asociada al nucleoide HU es fundamental para la formación de la subpoblación OpvABON.Casadesús Pursals, JosepGenética2016info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11441/34335reponame:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevillainstname:Universidad de Sevilla (US)Inglésinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:idus.us.es:11441/343352026-06-17T12:51:07Z
dc.title.none.fl_str_mv Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
title Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
spellingShingle Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
Cota García, Ignacio
Salmonella
title_short Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
title_full Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
title_fullStr Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
title_full_unstemmed Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
title_sort Epigenetic control of O-antigen length in Salmonella entérica
dc.creator.none.fl_str_mv Cota García, Ignacio
author Cota García, Ignacio
author_facet Cota García, Ignacio
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Casadesús Pursals, Josep
Genética
dc.subject.none.fl_str_mv Salmonella
topic Salmonella
description El locus STM2209-STM2208 (opvAB) es exclusivo de Salmonella enterica y presenta características típicas de genes adquiridos por transferencia horizontal. Fue descrito inicialmente como un locus reprimido por metilación Dam. Sin embargo, durante el desarrollo de esta tesis se ha establecido que la metilación Dam no reprime simplemente la expresión de opvAB, sino que forma parte de un mecanismo complejo de regulación que da lugar a dos subpoblaciones genéticamente iguales pero con distinto nivel de expresión de opvAB. Otro factor fundamental para la formación de estas subpoblaciones es OxyR, un factor de transcripción de tipo LysR. La regulación de la expresión de opvAB es transcripcional y se ejerce a través de una secuencia reguladora situada en la región 5’ previa al promotor de opvAB, en la cual se incluyen cuatro sitios GATC y sitios de unión de OxyR que solapan con ellos. La eliminación de los sitios GATC de esta secuencia reguladora elimina la variación de fase y permite la expresión constitutiva de opvAB. La síntesis de OpvA y OpvB modifica la estructura del lipopolisacárido, reduciendo la longitud predominante del antígeno O a 3-8 unidades de repetición. La expresión de opvAB y la consecuente alteración del la estructura del antígeno O divide las poblaciones de Salmonella enterica en dos subpoblaciones: la subpoblación mayoritaria OpvABOFF es virulenta y sensible a bacteriófagos que usan el antígeno O como receptor. La subpoblación minoritaria OpvABON es resistente a dichos bacteriófagos y avirulenta. La expresión variable de opvAB constituye un mecanismo epigenético y reversible de resistencia a bacteriófagos que utilizan el antígeno O como receptor. En presencia del bacteriófago, la subpoblación OpvABOFF es eliminada y se seleccionan las células OpvABON. Cuando el bacteriófago desaparece, la alta tasa de transición ON®OFF permite la rápida regeneración de la subpoblación OpvABOFF. La formación de subpoblaciones OpvABOFF y OpvABON depende de la formación de patrones de metilación específicos en los cuatro sitios GATC situados en la región reguladora de opvAB. En fase OFF, los sitios GATC1 y GATC3 están protegidos por la proteína OxyR y se encuentran desmetilados, mientras que GATC2 y GATC4 son metilados. En fase ON, el patrón es el contrario: OxyR protege los sitios GATC2 y GATC4 de ser metilados, mientras que GATC1 y GATC3 son metilados. Se han identificado factores auxiliares que participan en la formación de las subpoblaciones OpvABOFF y OpvABON. SeqA es una proteína de unión a sitios GATC que reprime específicamente la tasa de transición OFF®ON. La proteína asociada al nucleoide HU es fundamental para la formación de la subpoblación OpvABON.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11441/34335
url http://hdl.handle.net/11441/34335
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
instname:Universidad de Sevilla (US)
instname_str Universidad de Sevilla (US)
reponame_str idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
collection idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869414938787708928
score 15,300719