Understanding the mechanisms of de novo gene evolution using transcriptomics data
Aquesta tesi investiga els mecanismes de formació i evolució de gens de novo utilitzant seqüenciació massiva de transcrits complerts i de fragments protegits per ribosomes. Hem identificat milers de gens de novo en humans i ximpanzé i obtingut evidència de que aquests gens s'expressen majoritàr...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2017 |
| País: | España |
| Recursos: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/402202 |
| Acesso em linha: | http://hdl.handle.net/10803/402202 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | De novo gene Evolution Transcriptomics RNAseq Gen de novo Evolució Transcriptòmica Ribosome profiling Empremta ribosomal 575 |
| Resumo: | Aquesta tesi investiga els mecanismes de formació i evolució de gens de novo utilitzant seqüenciació massiva de transcrits complerts i de fragments protegits per ribosomes. Hem identificat milers de gens de novo en humans i ximpanzé i obtingut evidència de que aquests gens s'expressen majoritàriament a partir de promotors que han aparegut recentment en l'evolució. Hem demostrat que molts dels gens poc conservats, incloent gens que prèviament es creia que no eren codificants, es tradueixen. A més, hem observat que existeix una relació entre la capacitat que té una seqüència per ser traduïda i la seva composició nucleotídica. L'anàlisi de les variants polimòrfiques ha revelat que molts dels pèptids de ratolí no conservats en humans evolucionen de forma neutra i que, per tant, podrien ser precursors de nous gens. En conjunt, el material de partida per la formació de noves proteïnes funcionals és abundant en el genoma. |
|---|