Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis

El objetivo principal de la presente tesis doctoral es el estudio conformacional del antígeno Tn, ya sea solo o incluido en el esqueleto peptídico de la mucina MUC1. Conocer la estructura de este tipo de glicoproteínas es clave para poder mejorar su interacción con moléculas de interés biológico, ta...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor: Bermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]
Formato: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:España
Recursos:Universidad de La Rioja (UR)
Repositorio:RIUR. Repositorio Institucional de la Universidad de La Rioja
OAI Identifier:oai:portal.dialnet.es:doc/5c13b1dcc8914b6ed377793c
Acesso em linha:https://investigacion.unirioja.es/documentos/5c13b1dcc8914b6ed377793c
Access Level:acceso abierto
id ES_902da56ee6fbee49bb89731efbcb25e9
oai_identifier_str oai:portal.dialnet.es:doc/5c13b1dcc8914b6ed377793c
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosisBermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]El objetivo principal de la presente tesis doctoral es el estudio conformacional del antígeno Tn, ya sea solo o incluido en el esqueleto peptídico de la mucina MUC1. Conocer la estructura de este tipo de glicoproteínas es clave para poder mejorar su interacción con moléculas de interés biológico, tales como lectinas, enzimas o, el caso que nos ocupa, anticuerpos. El antígeno Tn se define comúnmente como una unidad de N-acetilgalactosamina (GalNAc) conectada mediante un enlace -O-glicosídico a un aminoácido, ya sea una serina (Ser) o una treonina (Thr), sin ningún tipo de distinción entre las mismas. Sin embargo, ambos derivados presentan diferencias en la orientación del carbohidrato en disolución; mientras que la unidad de GalNAc se presenta de manera perpendicular sobre el residuo de Thr, en el caso de la Ser ésta se dispone de manera paralela sobre el aminoácido subyacente. Sorprendentemente, y observado por primera vez en fase gas, esta diferencia desaparece, siendo indistinguible la geometría de ambos aminoácidos glicosilados. Este hecho pone de manifiesto la importancia que presentan las moléculas de agua que rodean a este tipo de moléculas y su crucial contribución estructural. Glicopéptidos y glicoproteínas del tipo mucina, en particular la mucina MUC1, están relacionados de manera intrínseca con el desarrollo de ciertos tipos de cáncer, y se presentan, por tanto, como candidato prometedores a la hora de diseñar una vacuna o como método para el diagnóstico temprano. Dado que la mucina MUC1 es una glicoproteína endógena, el sistema inmune la percibe como propia durante el desarrollo de la enfermedad, produciéndose circunstancias en las que el sistema inmune tolera su aparición y evita cualquier tipo de respuesta inmune contra ella. Para solucionar esta cuestión, durante esta tesis, se han sintetizado mucinas no naturales y se ha probado su afinidad. Una vez se conoce la estructura original de la MUC1, se han llevado a cabo modificaciones sobre el carbohidrato o el aminoácido del antígeno Tn, demostrando la influencia que sutiles modificaciones estructurales pueden producir en el reconocimiento biológico global de este tipo de compuestos o su efectividad como vacunas. En este contexto, una vacuna basada en un glicopéptido no natural conteniendo un iminoazúcar ha sido probada en ratones. Los resultado muestran que esta vacuna es reconocida por el sistema inmune, siendo capaz de generar anticuerpos que reconocen MUC1 que aparece en la superficie de células cancerosas. Además, la mejora del reconocimiento MUC1-anticuerpo puede presentar interesantes implicaciones en el uso de las mucinas como sensores tumorales o en el seguimiento del tratamiento. De nuevo, conocer la estructura de la mucina MUC1 natural permite poder elegir un residuo determinado para ser modificado. Así, la afinidad hacia los anticuerpos será mayor y se podrá aumentar la sensibilidad de este tipo de pruebas, que pueden ser aplicadas en el diagnóstico precoz del cáncer.Corzana López, FranciscoPeregrina García, Jesús Manuel2018info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://investigacion.unirioja.es/documentos/5c13b1dcc8914b6ed377793creponame:RIUR. Repositorio Institucional de la Universidad de La Riojainstname:Universidad de La Rioja (UR)Inglésinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:portal.dialnet.es:doc/5c13b1dcc8914b6ed377793c2026-06-14T12:47:17Z
dc.title.none.fl_str_mv Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
title Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
spellingShingle Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
Bermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]
title_short Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
title_full Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
title_fullStr Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
title_full_unstemmed Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
title_sort Structure-based design of glycopeptides featuring unnatural tn antigens and their applications to cancer vaccination and diagnosis
dc.creator.none.fl_str_mv Bermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]
author Bermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]
author_facet Bermejo Ruiz, Iris Alicia [0000-0001-8864-4852]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Corzana López, Francisco
Peregrina García, Jesús Manuel
description El objetivo principal de la presente tesis doctoral es el estudio conformacional del antígeno Tn, ya sea solo o incluido en el esqueleto peptídico de la mucina MUC1. Conocer la estructura de este tipo de glicoproteínas es clave para poder mejorar su interacción con moléculas de interés biológico, tales como lectinas, enzimas o, el caso que nos ocupa, anticuerpos. El antígeno Tn se define comúnmente como una unidad de N-acetilgalactosamina (GalNAc) conectada mediante un enlace -O-glicosídico a un aminoácido, ya sea una serina (Ser) o una treonina (Thr), sin ningún tipo de distinción entre las mismas. Sin embargo, ambos derivados presentan diferencias en la orientación del carbohidrato en disolución; mientras que la unidad de GalNAc se presenta de manera perpendicular sobre el residuo de Thr, en el caso de la Ser ésta se dispone de manera paralela sobre el aminoácido subyacente. Sorprendentemente, y observado por primera vez en fase gas, esta diferencia desaparece, siendo indistinguible la geometría de ambos aminoácidos glicosilados. Este hecho pone de manifiesto la importancia que presentan las moléculas de agua que rodean a este tipo de moléculas y su crucial contribución estructural. Glicopéptidos y glicoproteínas del tipo mucina, en particular la mucina MUC1, están relacionados de manera intrínseca con el desarrollo de ciertos tipos de cáncer, y se presentan, por tanto, como candidato prometedores a la hora de diseñar una vacuna o como método para el diagnóstico temprano. Dado que la mucina MUC1 es una glicoproteína endógena, el sistema inmune la percibe como propia durante el desarrollo de la enfermedad, produciéndose circunstancias en las que el sistema inmune tolera su aparición y evita cualquier tipo de respuesta inmune contra ella. Para solucionar esta cuestión, durante esta tesis, se han sintetizado mucinas no naturales y se ha probado su afinidad. Una vez se conoce la estructura original de la MUC1, se han llevado a cabo modificaciones sobre el carbohidrato o el aminoácido del antígeno Tn, demostrando la influencia que sutiles modificaciones estructurales pueden producir en el reconocimiento biológico global de este tipo de compuestos o su efectividad como vacunas. En este contexto, una vacuna basada en un glicopéptido no natural conteniendo un iminoazúcar ha sido probada en ratones. Los resultado muestran que esta vacuna es reconocida por el sistema inmune, siendo capaz de generar anticuerpos que reconocen MUC1 que aparece en la superficie de células cancerosas. Además, la mejora del reconocimiento MUC1-anticuerpo puede presentar interesantes implicaciones en el uso de las mucinas como sensores tumorales o en el seguimiento del tratamiento. De nuevo, conocer la estructura de la mucina MUC1 natural permite poder elegir un residuo determinado para ser modificado. Así, la afinidad hacia los anticuerpos será mayor y se podrá aumentar la sensibilidad de este tipo de pruebas, que pueden ser aplicadas en el diagnóstico precoz del cáncer.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://investigacion.unirioja.es/documentos/5c13b1dcc8914b6ed377793c
url https://investigacion.unirioja.es/documentos/5c13b1dcc8914b6ed377793c
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:RIUR. Repositorio Institucional de la Universidad de La Rioja
instname:Universidad de La Rioja (UR)
instname_str Universidad de La Rioja (UR)
reponame_str RIUR. Repositorio Institucional de la Universidad de La Rioja
collection RIUR. Repositorio Institucional de la Universidad de La Rioja
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869413272797577216
score 15,301603