The metabolic aspects of macroH2A histone variants

Programa de Doctorat en Biomedicina / Tesi realitzada a l'Institut Josep Carreras (IJC)

Detalles Bibliográficos
Autor: Guberović, Iva
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2021
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/673875
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/673875
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Epigenètica
Epigenética
Epigenetics
Cromatina
Chromatin
Histones
Histonas
Metabolisme
Metabolismo
Metabolism
Ciències Experimentals i Matemàtiques
575
id ES_8d2da96b724ca31f140ba18afaa19ec3
oai_identifier_str oai:www.tdx.cat:10803/673875
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv The metabolic aspects of macroH2A histone variants
title The metabolic aspects of macroH2A histone variants
spellingShingle The metabolic aspects of macroH2A histone variants
Guberović, Iva
Epigenètica
Epigenética
Epigenetics
Cromatina
Chromatin
Histones
Histonas
Metabolisme
Metabolismo
Metabolism
Ciències Experimentals i Matemàtiques
575
title_short The metabolic aspects of macroH2A histone variants
title_full The metabolic aspects of macroH2A histone variants
title_fullStr The metabolic aspects of macroH2A histone variants
title_full_unstemmed The metabolic aspects of macroH2A histone variants
title_sort The metabolic aspects of macroH2A histone variants
dc.creator.none.fl_str_mv Guberović, Iva
author Guberović, Iva
author_facet Guberović, Iva
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Buschbeck, Marcus
Corominas, Montserrat (Corominas Guiu)
Universitat de Barcelona. Facultat de Biologia
dc.subject.none.fl_str_mv Epigenètica
Epigenética
Epigenetics
Cromatina
Chromatin
Histones
Histonas
Metabolisme
Metabolismo
Metabolism
Ciències Experimentals i Matemàtiques
575
topic Epigenètica
Epigenética
Epigenetics
Cromatina
Chromatin
Histones
Histonas
Metabolisme
Metabolismo
Metabolism
Ciències Experimentals i Matemàtiques
575
description Programa de Doctorat en Biomedicina / Tesi realitzada a l'Institut Josep Carreras (IJC)
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021
2022
2022
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10803/673875
url http://hdl.handle.net/10803/673875
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 177 p.
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
dc.source.none.fl_str_mv TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red
instname:CBUC, CESCA
instname_str CBUC, CESCA
reponame_str TDR. Tesis Doctorales en Red
collection TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869413023685279744
spelling The metabolic aspects of macroH2A histone variantsGuberović, IvaEpigenèticaEpigenéticaEpigeneticsCromatinaChromatinHistonesHistonasMetabolismeMetabolismoMetabolismCiències Experimentals i Matemàtiques575Programa de Doctorat en Biomedicina / Tesi realitzada a l'Institut Josep Carreras (IJC)The histone variant macroH2A is the only structural chromatin component containing a macrodomain. In vertebrates, two genes and one event of alternative splicing give rise to three macroH2A proteins that differ in their macrodomains. As histone variants, macroH2A proteins contribute to the protein content of chromatin (Buschbeck & Hake, 2017). On the other hand, the capacity to bind ADP-ribose via its macrodomain is limited to the splice variant macroH2A1.1 (Kustatscher et al., 2005). As a consequence, macroH2A1.1, but not macroH2A1.2 or macroH2A2, binds auto-ADP-ribosylated PARP1 (Timinszky et al., 2009). Since the alternative splicing of the exon 5 affects the binding pocket of macroH2A1.2, as a consequence it cannot bind ADP-ribose (Kustatscher et al., 2005) and it remains an orphan protein. In the first study presented here, we investigated the evolution of the macrodomain-containing histone variant macroH2A1.1, an integral chromatin component that limits nuclear NAD+ consumption by inhibiting PARP1. We found that macroH2A originated in pre-metazoan protists. The crystal structure of the macroH2A macrodomain from the protist Capsaspora allowed us to identify highly conserved principles of ligand binding and pinpoint key residue substitutions, selected for during the evolution of the vertebrate stem lineage. Metabolic characterization of the Capsaspora life cycle indicated that the metabolic function of macroH2A was associated with non-proliferative stages. Taken together, we provide insight into the evolution of a chromatin element involved in compartmental NAD regulation, relevant for understanding of its metabolism and potential therapeutic applications. In the second study, we described the structurally relevant elements for ligand binding by the orphan macroH2A isoform, macroH2A1.2. Furthermore, using targeted and untargeted approaches on the verge of in silico, in vitro and in cellulo approaches, we detected phospholipids as the first putative physiological ligands of macroH2A1.2. We further observed a behavioral phenotype in macroH2A1.2 knock-out mice and report for the first time the upregulation of macroH2A1.2 expression in the differentiated cells, more specifically in differentiated neurons. We postulate that macroH2A1.2 might have a binding-pocket related role in the regulation of behavior, similarly to what was observed for PPARα in hypothalamus, whereby it regulates animal behavior depending on the binding of its phospholipid ligands (Chakravarthy et al., 2007; Roy et al., 2016).Universitat de BarcelonaBuschbeck, MarcusCorominas, Montserrat (Corominas Guiu)Universitat de Barcelona. Facultat de Biologia202220222021info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion177 p.application/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/673875TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/6738752026-06-14T12:46:07Z
score 15,301603

Similares en LA Referencia