Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Fecha de lectura: 04 de febrero de 2016

Detalles Bibliográficos
Autor: Domínguez Ruíz, María
Tipo de recurso: tesis doctoral
Fecha de publicación:2016
País:España
Institución:Universidad Autónoma de Madrid
Repositorio:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
Idioma:español
OAI Identifier:oai:repositorio.uam.es:10486/672202
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10486/672202
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Sordera - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Hipoacusia - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Biología y Biomedicina / Biología
id ES_848318ffa4a3abe4eac62f24bfec45bc
oai_identifier_str oai:repositorio.uam.es:10486/672202
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
title Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
spellingShingle Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
Domínguez Ruíz, María
Sordera - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Hipoacusia - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Biología y Biomedicina / Biología
title_short Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
title_full Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
title_fullStr Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
title_full_unstemmed Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
title_sort Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generación
dc.creator.none.fl_str_mv Domínguez Ruíz, María
author Domínguez Ruíz, María
author_facet Domínguez Ruíz, María
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Castillo Fernández del Pino, Ignacio del
Departamento de Biología
Facultad de Ciencias
dc.subject.none.fl_str_mv Sordera - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Hipoacusia - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Biología y Biomedicina / Biología
topic Sordera - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Hipoacusia - Aspectos genéticos - Tesis doctorales
Biología y Biomedicina / Biología
description Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Fecha de lectura: 04 de febrero de 2016
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
2016-02-04
dc.type.none.fl_str_mv doctoral thesis
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
NA
http://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43
dc.type.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10486/672202
url http://hdl.handle.net/10486/672202
dc.language.none.fl_str_mv Español
spa
language_invalid_str_mv Español
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
instname:Universidad Autónoma de Madrid
instname_str Universidad Autónoma de Madrid
reponame_str Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
collection Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869412229222236160
spelling Estudio molecular de genes implicados en hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva mediante secuenciación Sanger y de nueva generaciónDomínguez Ruíz, MaríaSordera - Aspectos genéticos - Tesis doctoralesHipoacusia - Aspectos genéticos - Tesis doctoralesBiología y Biomedicina / BiologíaTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Fecha de lectura: 04 de febrero de 2016La hipoacusia es el trastorno neurosensorial más frecuente en humanos. Presenta una gran heterogeneidad genética, con 133 loci cartografiados y 90 genes identificados hasta la fecha, sólo para las formas no sindrómicas. En este trabajo nos hemos centrado en el estudio de los genes MYO7A, PCDH15, CDH23 y PJVK en una cohorte de pacientes con Hipoacusia No Sindrómica de herencia Autosómica Recesiva (HNSAR) en los que se habían excluido mutaciones en el locus DFNB1 (genes GJB2 y GJB6). Se utilizó el análisis de haplotipos para marcadores microsatélites, el análisis de heterodúplex de ADN en DHPLC y la secuenciación Sanger. De este modo, descubrimos las mutaciones responsables de la hipoacusia en el gen MYO7A (2 familias), en PCDH15 (3 familias), en CDH23 (2 familias) y en PJVK (3 familias). Este trabajo, unido a resultados previos de nuestro laboratorio nos ha permitido completar el primer estudio global de la epidemiología genética de la HNSAR en la población española (52 genes investigados en 140 familias). Por otra parte, hemos utilizado un panel de secuenciación masiva de genes de hipoacusia para investigar un grupo de 13 familias con HNSAR en las que se habían excluido mutaciones en el locus DFNB1. Encontramos las mutaciones causantes de la hipoacusia en 6 de las 13 familias. Con el fin de identificar nuevos genes implicados en HNSAR realizamos secuenciación de exoma completo de las 7 familias restantes y de 6 familias no elucidadas procedentes de nuestro estudio epidemiológico. En tres familias encontramos mutaciones en genes no incluidos en el panel y en otras dos familias hallamos mutaciones en dos genes implicados en hipoacusias sindrómicas. En total, en el curso de este trabajo hemos identificado 28 mutaciones patogénicas, 18 de ellas no descritas previamente. Por último, dado que no se puede acceder a los ARNm de oído interno en pacientes vivos, hemos estudiado la expresión de los genes implicados en HNSAR en tejidos de fácil muestreo (sangre, saliva y orina). Se investigaron cinco controles normoyentes (2 varones y 3 mujeres) para hacer RT-PCR, dos de los cuales (un varón y una mujer) se estudiaron además por secuenciación masiva del ARN (RNAseq). Los resultados obtenidos indican que casi la totalidad de los genes implicados en HNSAR se expresan en al menos uno de estos tejidos, mayoritariamente la sangre.Hearing impairment is the most common sensorineural disorder in humans. It shows a huge genetic heterogeneity, so that 133 loci have been mapped and 90 genes have been identified to date, only for non-syndromic forms. We have focused this study on the MYO7A, PCDH15, CDH23 and PJVK genes in a cohort of patients with autosomal recessive non-syndromic hearing impairment (ARNSHI), in whom mutations in the DFNB1 locus (genes GJB2 and GJB6) had been excluded. We used haplotype analysis for microsatellite markers, analysis of DNA heteroduplexes in DHPLC, and Sanger sequencing. In this way, we found the mutations responsible for the hearing impairment in the MYO7A gene (2 families) in PCDH15 (3 families), in CDH23 (2 families) and in PJVK (3 families). This work, together with previous results of our laboratory has allowed us to complete the first global study on the genetic epidemiology of ARNSHI in the Spanish population (52 genes were screened in 140 families). In addition, we used a next-generation sequencing (NGS) panel for genes involved in ARNSHI to investigate a group of 13 families in which we had excluded mutations in the DFNB1 locus. We found the deafness-causing mutations in 6 out of those 13 families. In order to identify novel genes involved in ARNSHI, we performed whole-exome sequencing in the remaining 7 families and in 6 non-elucidated families from our epidemiological study. In three families we found mutations in known ARNSHI genes that were not included in the NGS panel, and in two other families we found mutations in two genes involved in syndromic hearing impairment. Globally, in this work we have identified 28 pathogenic mutations, 18 of which have not been described previously. Finally, given that mRNAs from the inner ear can not be obtained from live patients, we have studied the expression of the genes involved in ARNSHI in tissues that can be sampled easily (blood, urine, saliva). We investigated five control subjects with normal hearing (2 males and 3 females) by means of RT-PCR, two of which were also studied through massively-parallel RNA sequencing (RNA-seq). Our results indicate that almost every gene involved in ARNSHI is expressed in at least one of those tissues, blood being the tissue with more expressed genes.Castillo Fernández del Pino, Ignacio delDepartamento de BiologíaFacultad de Ciencias20162016-02-04doctoral thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06NAhttp://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43info:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10486/672202reponame:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAMinstname:Universidad Autónoma de MadridEspañolspaopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessoai:repositorio.uam.es:10486/6722022026-06-23T12:46:27Z
score 15,300724

Similares en LA Referencia