Identification and characterization of microRNAs in porcine circovirus type 2 and African swine fever virus infections in vivo
Cuatro estudios diferentes fueron llevados a cabo con el fin de analizar la expresión de microRNAs (miRNAs) porcinos y virales en dos infecciones in vivo diferentes con circovirus porcino tipo 2 (PCV2) y el virus de la peste porcina africana (VPPA). El objetivo del primer estudio fue identificar el...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2016 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Repositorio: | Dipòsit Digital de Documents de la UAB |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:ddd.uab.cat:174015 |
| Acceso en línea: | https://ddd.uab.cat/record/174015 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | MicroRNAs Porc Cerdo Pig Virus |
| Sumario: | Cuatro estudios diferentes fueron llevados a cabo con el fin de analizar la expresión de microRNAs (miRNAs) porcinos y virales en dos infecciones in vivo diferentes con circovirus porcino tipo 2 (PCV2) y el virus de la peste porcina africana (VPPA). El objetivo del primer estudio fue identificar el patrón de expresión de miRNAs en cerdos infectados y no infectados con PCV2. Para ello, se llevó a cabo una infección experimental y se construyeron librerías de ARN de pequeño tamaño de tonsila y linfonodo mediastínico de estos animales. La secuenciación masiva determinó diferencias de expresión de miRNAs porcinos entre animales infectados y no infectados. La predicción del análisis funcional mostró que estos miRNAs pueden estar involucrados en rutas biológicas relacionadas con el sistema inmune y en procesos relacionados con la patogénesis provocada por PCV2. El objetivo del segundo estudio fue investigar si PCV2 puede codificar miRNAs virales. A partir de las librerías ya construidas, los resultados de la secuenciación masiva revelaron que PCV2 no expresa miRNAs en una infección subclínica in vivo. En el tercer estudio se analizó la diferencia de expresión de miRNAs en bazo y linfonodo submandibular en infecciones in vivo con el VPPA entre i) animales infectados con la cepa virulenta E75 de VPPA a distintos tiempos (3 y 7 días postinfección) y ii) entre animales infectados con la cepa virulenta E75 y animales infectados con la cepa derivada de ésta y atenuada E75CV1 a un mismo tiempo post- infección (3 días post- infección). Se crearon librerías de ARN de pequeño tamaño y la secuenciación masiva de las mismas mostró diferencias de expresión de miRNAs en ambos casos. Además, se observó la asociación de los miRNAs diferencialmente expresados con genes porcinos y virales involucrados en la respuesta inmune y las interacciones virus- hospedador. En el cuarto estudio se analizó la posibilidad de que VPPA codificase miRNAs virales. Para ello se emplearon las muestras previas de E75 y E75CV1 y se añadieron al estudio muestras de animales infectados con la cepa atenuada E75CV1 y sacrificados a día 31 post- infección aparte de animales infectados con esta misma cepa y re-inoculados a día 31 post- infección con la cepa virulenta Ba71 y eutanasiados a día 38 post- infección. La secuenciación masiva de todas las librerías de ARN de pequeño tamaño mostró que VPPA no expresa miRNAs virales en ninguna de las condiciones estudiadas. |
|---|