Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics

Opisthokonta is an eukaryotic supergroup that contains Metazoa, Fungi and their unicellular relatives. Therefore, this group provides an ideal framework to study distinct unicellular-multicellular transitions, among them, the transition towards animal multicellularity. This thesis aims to describe n...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: López Escardó, David
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/587085
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/587085
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Opistoconts
Origen dels animals
Evolució
Protistologia
Genòmica
Single-cell genomics
Evolution
Animal multicellularity
Opisthokonts
Choanoflagellates
575
id ES_7d3d0aae2a67f1f905253aabd484f16f
oai_identifier_str oai:www.tdx.cat:10803/587085
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomicsLópez Escardó, DavidOpistocontsOrigen dels animalsEvolucióProtistologiaGenòmicaSingle-cell genomicsEvolutionAnimal multicellularityOpisthokontsChoanoflagellates575Opisthokonta is an eukaryotic supergroup that contains Metazoa, Fungi and their unicellular relatives. Therefore, this group provides an ideal framework to study distinct unicellular-multicellular transitions, among them, the transition towards animal multicellularity. This thesis aims to describe new Opisthokonta diversity at many different levels, a very neeeded starting point to better understand the evolution of opisthokonts and the origin of multicellularity in animals. In particular, we here described a new genus and species at the onset of Holomycota (Parvularia atlantis), detected new molecular metazoan diversity through a metabarcoding approach, and evaluated the power of single-cell genomics to increment the genomic diversity of choanoflagellates. Overall, this thesis provided new insights into the diversity of Opisthokonta and into the power of single-cell genomics technologies. Finally, our results also have reshaped the phylogeny of choanoflagellates and increased the knowledge of the pre-metazoan genetic tool-kit.Els Opistoconts són el supergroup d'eucariotes que engloba els animals, els fongs i els seus respectius parents unicel·lulars. Ofereixen, per tant, un marc ideal on estudiar la transició d'organismes unicel·lulars a pluricel·lulars, entre elles, la transició a la pluricel·lularitat animal. Aquesta tesis pretén entendre millor la diversitat dels Opistoconts a diferents nivells, com a primer pas imprescindible, per poder entendre millor la seva evolució i obtenir noves dades que ajudin a compendre els processos que van precedir l'origen de la pluricel·lularitat animal. Concretament, els resultats obtinguts corresponen a: la descripció d'un nou génere i una nova espècie a la base dels holomycots (Parvularia atlantis), la detecció de nova diversitat animal gràcies a un estudi metagenètic (metabarcoding) i l'avaluació de l'ús de técniques de genòmica unicel·lular (Single-cell genomics) per poder expandir la diversitat genòmica dels coanoflagel·lats. Amb tot, els resultats donen una millor comprensió de la diversitat dels Opistoconts i del potencial de la genòmica unicel·lular. Finalment, els resultats han permés també remodelar la filogènia dels coanoflagel·lats i incrementar el conexiement sobre el contingut genètic que va precedir l'aparició dels animals.Programa de doctorat en BiomedicinaUniversitat Pompeu FabraRuiz Trillo, IñakiUniversitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut201820182018info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion244 p.application/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/587085TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/5870852026-06-14T12:46:07Z
dc.title.none.fl_str_mv Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
title Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
spellingShingle Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
López Escardó, David
Opistoconts
Origen dels animals
Evolució
Protistologia
Genòmica
Single-cell genomics
Evolution
Animal multicellularity
Opisthokonts
Choanoflagellates
575
title_short Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
title_full Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
title_fullStr Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
title_full_unstemmed Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
title_sort Unveiling new molecular Opisthokonta diversity : A perspective from evolutionary genomics
dc.creator.none.fl_str_mv López Escardó, David
author López Escardó, David
author_facet López Escardó, David
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Ruiz Trillo, Iñaki
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.subject.none.fl_str_mv Opistoconts
Origen dels animals
Evolució
Protistologia
Genòmica
Single-cell genomics
Evolution
Animal multicellularity
Opisthokonts
Choanoflagellates
575
topic Opistoconts
Origen dels animals
Evolució
Protistologia
Genòmica
Single-cell genomics
Evolution
Animal multicellularity
Opisthokonts
Choanoflagellates
575
description Opisthokonta is an eukaryotic supergroup that contains Metazoa, Fungi and their unicellular relatives. Therefore, this group provides an ideal framework to study distinct unicellular-multicellular transitions, among them, the transition towards animal multicellularity. This thesis aims to describe new Opisthokonta diversity at many different levels, a very neeeded starting point to better understand the evolution of opisthokonts and the origin of multicellularity in animals. In particular, we here described a new genus and species at the onset of Holomycota (Parvularia atlantis), detected new molecular metazoan diversity through a metabarcoding approach, and evaluated the power of single-cell genomics to increment the genomic diversity of choanoflagellates. Overall, this thesis provided new insights into the diversity of Opisthokonta and into the power of single-cell genomics technologies. Finally, our results also have reshaped the phylogeny of choanoflagellates and increased the knowledge of the pre-metazoan genetic tool-kit.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018
2018
2018
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10803/587085
url http://hdl.handle.net/10803/587085
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 244 p.
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat Pompeu Fabra
publisher.none.fl_str_mv Universitat Pompeu Fabra
dc.source.none.fl_str_mv TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red
instname:CBUC, CESCA
instname_str CBUC, CESCA
reponame_str TDR. Tesis Doctorales en Red
collection TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869411648788234240
score 15,301603

Similares en LA Referencia