Análisis de la variación nucleotídica de la región génica que incluye el gen phantom en poblaciones de Drosophila melanogaster de África y Norteamérica
La especie Drosophila melanogaster es originaria de África subsahariana y mediante el 'comensalismo' con los humanos se ha expandido por todo el mundo. Debido a la relativamente reciente expansión, los efectos de la adaptación al nuevo clima además del efecto demográfico se deberían de ref...
| Autor: | |
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| Tipo de documento: | dissertação |
| Data de publicação: | 2021 |
| País: | España |
| Recursos: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositório: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/126968 |
| Acesso em linha: | http://hdl.handle.net/10609/126968 |
| Access Level: | Acceso aberto |
| Palavra-chave: | drosophila melanogaster natural selection nucleotide variation selección natural variación nucleotídica Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Resumo: | La especie Drosophila melanogaster es originaria de África subsahariana y mediante el 'comensalismo' con los humanos se ha expandido por todo el mundo. Debido a la relativamente reciente expansión, los efectos de la adaptación al nuevo clima además del efecto demográfico se deberían de reflejar en el genoma. En una población europea, se habían encontrado huellas de la selección en una región del cromosoma X que incluye el gen phantom. En este trabajo se analiza la variación nucleotídica en esta misma región en busca de huellas de la selección en cuatro poblaciones de D. melanogaster (una norteamericana y tres africanas. Asimismo, se comparan las poblaciones africanas para ver si se han diferenciado. Para ello, las secuencias se ubican en el genoma, se alinean y se analizan mediante los programas bioinformáticos BLAST, MEGA y DnaSp. Con los resultados obtenidos se llega a las siguientes conclusiones: En el caso de las tres poblaciones africanas se observa que se rechaza la neutralidad, pero probablemente este efecto se genere en otra región cercana. En el caso de la población estadounidense la diversidad nucleotídica es muy baja. Aunque se rechaza la neutralidad también se deben de realizar más análisis para comprobar con total certeza la existencia de selección en esta región. Por otro lado, las poblaciones africanas se han diferenciado entre sí, pero al realizar comparaciones en grupos de dos en dos la única diferenciada es la población etíope. |
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