Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum

Mutlaq S. Binsarha, Mohammad

Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum

Programa de Doctorat en Ciències del Mar

Detalles Bibliográficos
Autor:	Mutlaq S. Binsarha, Mohammad
Tipo de recurso:	tesis doctoral
Estado:	Versión publicada
Fecha de publicación:	2024
País:	España
Institución:	CBUC, CESCA
Repositorio:	TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:	oai:www.tdx.cat:10803/693396
Acceso en línea:	http://hdl.handle.net/10803/693396
Access Level:	acceso abierto
Palabra clave:	Ecologia marina Ecología marina Marine ecology Coralls Corales Corals Metagenòmica Metagenómica Metagenomics Ciències Experimentals i Matemàtiques 504

id	ES_78b8ec0c26e13bcae40e97acf66dafcf
oai_identifier_str	oai:www.tdx.cat:10803/693396
network_acronym_str	ES
network_name_str	España
repository_id_str
spelling	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusumMutlaq S. Binsarha, MohammadEcologia marinaEcología marinaMarine ecologyCorallsCoralesCoralsMetagenòmicaMetagenómicaMetagenomicsCiències Experimentals i Matemàtiques504Programa de Doctorat en Ciències del Mar[eng] Corals are crucial to marine ecosystems, offering varied habitats for microbial communities that, in return, provide essential compounds for coral health and resilience. Numerous factors, such as coral age, species, health, and environmental conditions like depth and temperature, influence the structure and function of the coral microbiome. Disruptions in the coral-microbe relationship can lead to infections, bleaching, and increased coral mortality. Understanding these influences on the microbiome is vital for deciphering coral-microbe interactions. This thesis explores the coral microbiome concerning depth and temperature variations using highthroughput meta-omics approaches. Our analysis of the influence of depth on the Mediterranean coral Eunicella singularis revealed significant taxonomic and functional differences between shallow and mesophotic zones. Shallow water colonies prominently featured Symbiodinium, essential for photosynthesis, while its absence in mesophotic zones indicated a shift in microbial community composition. In mesophotic water colonies, the microbiome exhibited higher abundances of genes related to carbohydrate, energy, amino acid, cofactor, and vitamin metabolism, suggesting adaptation to diverse nutrient sources and enhanced nutrient availability. Metagenome-assembled genomes (MAGs) analysis identified key taxa, such as DT-91 (Order Pseudomonadales) and Endozoicomonas, involved in nutrient recycling and vitamin production, underscoring their role in maintaining microbiome fitness and coral resilience. Further research is needed to determine the active expression of these genes and their impact on coral health. Additionally, our study on the cold-water coral D. pertusum under prolonged thermal stress revealed significant changes in the microbiome's taxonomic and functional structure. Elevated temperatures correlated with an increase in microbial taxa such as Rhodobacterales and genes associated with carbon metabolism and secretion systems, potentially destabilizing the microbiome and promoting the growth of opportunistic pathogens. Furthermore, we observed a rise in genes related to diazotrophic activity, including denitrification and nitrification, which could disrupt nitrogen cycle balance and heighten disease susceptibility. These findings highlight the importance of environmental factors in shaping coral microbiomes and emphasize the need for further research on gene expression profiles to better understand microbial activity and regulation under stress conditions. Such understanding is crucial for developing strategies to enhance coral resilience in changing environments.Universitat de BarcelonaLogares, RamiroCalafat Frau, AntoniCalafat Frau, AntoniUniversitat de Barcelona. Facultat de Ciències de la Terra202520252024info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion206 p.application/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/693396TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésL'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/6933962026-06-14T12:46:07Z
dc.title.none.fl_str_mv	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
title	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
spellingShingle	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum Mutlaq S. Binsarha, Mohammad Ecologia marina Ecología marina Marine ecology Coralls Corales Corals Metagenòmica Metagenómica Metagenomics Ciències Experimentals i Matemàtiques 504
title_short	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
title_full	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
title_fullStr	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
title_full_unstemmed	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
title_sort	Metagenomic Exploration of the Effects of Depth and Temperature on the Microbiome Structure and Function of the Gorgonian Eunicella Singularis and the Cold Water Scleractinia Desmophyllum pertusum = Exploració metagenòmica dels efectes de la profunditat i la temperatura sobre l'estructura i la funció del microbioma de la gorgònia Eunicella singularis i el corall d'aigua freda Desmophyllum pertusum
dc.creator.none.fl_str_mv	Mutlaq S. Binsarha, Mohammad
author	Mutlaq S. Binsarha, Mohammad
author_facet	Mutlaq S. Binsarha, Mohammad
author_role	author
dc.contributor.none.fl_str_mv	Logares, Ramiro Calafat Frau, Antoni Calafat Frau, Antoni Universitat de Barcelona. Facultat de Ciències de la Terra
dc.subject.none.fl_str_mv	Ecologia marina Ecología marina Marine ecology Coralls Corales Corals Metagenòmica Metagenómica Metagenomics Ciències Experimentals i Matemàtiques 504
topic	Ecologia marina Ecología marina Marine ecology Coralls Corales Corals Metagenòmica Metagenómica Metagenomics Ciències Experimentals i Matemàtiques 504
description	Programa de Doctorat en Ciències del Mar
publishDate	2024
dc.date.none.fl_str_mv	2024 2025 2025
dc.type.none.fl_str_mv	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format	doctoralThesis
status_str	publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv	http://hdl.handle.net/10803/693396
url	http://hdl.handle.net/10803/693396
dc.language.none.fl_str_mv	Inglés
language_invalid_str_mv	Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv	http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv	http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
eu_rights_str_mv	openAccess
dc.format.none.fl_str_mv	206 p. application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv	Universitat de Barcelona
publisher.none.fl_str_mv	Universitat de Barcelona
dc.source.none.fl_str_mv	TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red instname:CBUC, CESCA
instname_str	CBUC, CESCA
reponame_str	TDR. Tesis Doctorales en Red
collection	TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_	1869411281589501952
score	15,812455

Similares en LA Referencia