Linfoma de células grandes B: Caracterización genética y utilidad en el diagnóstico y pronóstico de la biopsia líquida

Programa de Doctorat en Medicina i Recerca Translacional

Detalles Bibliográficos
Autor: Rivas Delgado, Alfredo
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2023
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/695179
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/695179
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Limfomes
Linfomas
Lymphomas
Hematologia
Hematología
Hematology
Malalties hematològiques
Enfermedades hematológicas
Hematologic diseases
Ciències de la Salut
616
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spelling Linfoma de células grandes B: Caracterización genética y utilidad en el diagnóstico y pronóstico de la biopsia líquidaRivas Delgado, AlfredoLimfomesLinfomasLymphomasHematologiaHematologíaHematologyMalalties hematològiquesEnfermedades hematológicasHematologic diseasesCiències de la Salut616Programa de Doctorat en Medicina i Recerca Translacional[spa] El linfoma difuso de células grandes B (LDCGB) es una neoplasia con gran heterogeneidad clínico-biológica y es el síndrome linfoproliferativo más frecuente en el mundo occidental y el paradigma de linfoma agresivo, representando el 25-35% de los casos. El linfoma de células B primario de mediastino (LPM) es un linfoma agresivo que representa del 2 al 3% de los casos de linfoma. Inicialmente se consideró un subtipo de LDCGB, pero debido a sus características clínico-patológicas distintas, actualmente es reconocido como una entidad distinta. La utilización de tecnologías basadas en secuenciación de nueva generación (NGS) ha permitido explorar la utilidad del DNA circulante tumoral (ctDNA) como marcador pronóstico y para la detección y caracterización genética de diferentes neoplasias, entre ellos los linfomas. Esta opción es particularmente útil cuando no se dispone de una muestra de biopsia del tumor para el análisis molecular. El objetivo de los dos primeros trabajos fue analizar el perfil mutacional de pacientes con LDCGB y LPM en el momento del diagnóstico y correlacionar los niveles de ctDNA con las variables clínicas iniciales, la respuesta terapéutica y la supervivencia de los pacientes. En el primer trabajo se incluyeron 100 pacientes con LDCGB de forma prospectiva entre 2016 y 2019. Se obtuvo una muestra de plasma al diagnóstico y previo al inicio del tratamiento. Se pudo realizar la determinación del perfil mutacional en 79 pacientes (H/M 42/37; edad mediana 63 años) detectando al menos una mutación en 69 de los casos (87.3%). A partir del perfil mutacional del ctDNA se pudo clasificar a los pacientes de acuerdo con los grupos genómicos descritos recientemente utilizando la herramienta LymphGen. La sensibilidad del ctDNA para detectar mutaciones en las muestras de FFPE basales fue del 69% (IC95%: 64,1-73,9). Los niveles más elevados de ctDNA (definido como >2.5 log hGE/mL) se correlacionaron significativamente con la presencia de síntomas B, niveles séricos elevados de LDH, β2-microglobulina, estadio IV de Ann Arbor y con IPI de riesgo intermedio-alto o alto (P < 0.05 en todos los casos). En el grupo de pacientes tratados con intención curativa, aquellos con niveles elevados de ctDNA pretratamiento tuvieron una tasa de respuesta completa (RC), supervivencia libre de progresión (SLP) y supervencia global (SG) significativamente más bajas que aquellos con niveles bajos (tasa de RC, 65% frente a 96%, P < 0.004; SLP a los 24 meses de 73 vs. 100%, P= 0.016; y SG a 24 meses de 100 vs. 73%, p = 0.001). Además, se evaluó el volumen metabólico tumoral (VMT) y la glicolisis total de la lesión (GTL) en 56 pacientes de nuestra serie. Como era de esperar, el VMT y la GTL elevados se correlacionaron con la enfermedad voluminosa, la presencia de síntomas B, niveles séricos elevados de LDH, β2-microglobulina, estadio avanzado e IPI de alto riesgo (P < 0.05 en todos los casos), además de presentar una menor tasa de respuesta al tratamiento (VMT, 97% frente a 41%, p <0.001; GTL, 93% frente a 39%, P < 0.001). Además, la concentración de ctDNA se correlacionó significativamente con el VMT (R= 0.57, P <0.001) y GTL (R= 0.45; P <0.001), confirmando que las mediciones de ctDNA están relacionadas con la carga tumoral del linfoma. En el segundo trabajo se incluyeron 20 pacientes diagnosticados de LPM en dos centros españoles entre 2015 y 2020. El perfil mutacional se pudo evaluar en ctDNA en18/20 casos (M/H 11/7; mediana de edad 30 años). La sensibilidad del ctDNA para detectar las mutaciones presentes en las muestras pareadas de FFPE fue del 69% (95% IC: 60-78%). El perfil mutacional obtenido de las muestras de plasma fue altamente concordante el descrito en la literatura. Además, observamos una concordancia del 75% entre los microarrays de DNA y el low-pass WGS para detectar ganancias/pérdidas cromosómicas, con una concordancia de ambas técnicas notablemente mayor para las alteraciones clonales (18/20, 90%). No se observaron asociaciones significativas entre la cantidad de ctDNA y la carga tumoral o el pronóstico de los pacientes. Como conclusión de ambos trabajos, el ctDNA es una fuente alternativa para estimar la carga tumoral y determinar el perfil mutacional y la clasificación genética del tumor, con implicaciones pronósticas y pueden contribuir a un futuro tratamiento personalizado. El linfoma testicular de células B grandes (TLBCL) es un linfoma agresivo y poco frecuente que se presenta en un sitio inmunoprivilegiado, recientemente reconocido como una entidad distinta del DLBCL. El objetivo del tercer trabajo fue la caracterización genética de TLBCL, así como la posterior comparación con dos series previamente publicadas, una de LDCGB nodal y otra de linfoma difuso de células de células grande B primario del sistema nervioso central (PCNSL). Se incluyeron 61 pacientes diagnosticados de TLBCL en seis centros españoles entre 2002 y 2021. La determinación de la célula de origen se evaluó mediante inmunohistoquímica (algoritmo de Hans) y/o arrays de expresión (Lymph2Cx). Para caracterizar las alteraciones genéticas del TLBCL, realizamos NGS utilizando un panel diseñado de 115 genes, arrays de expresión para determinar las alteraciones del número de copias y estudios de FISH (BCL2, BCL6 y MYC). El 30% de los pacientes presentaban enfermedad diseminada (estadio IV) al diagnóstico, incluidos 6 casos con afectación del SNC. El 83% de los casos presentó un fenotipo no GCB por el algoritmo de Hans y el 71% correspondieron al subtipo ABC por Lymph2Cx. Se observó una alta prevalencia de pérdida de expresión de HLA clase I (91%) y HLA clase II (62%). Se detectaron reordenamientos de BCL6 en el 36% (17/47) de los casos, sin reordenamientos concomitantes de BCL2 y MYC. Integrando los resultados de las mutaciones y CNA los genes/regiones alteradas en >50% de los casos fueron PRDM1, CDKN2A/B, TNFAIP3, SGK1, ARID1B, MYD88L265P, SPIB, PIM1 y CD79B. Se detectaron alteraciones concomitantes en MYD88L265P, CD79B y PIM1 en 12 (29%) casos. Utilizando la herramienta LymphGen, el 71% (30/42) de los casos se pudo clasificar en un subgrupo molecular, siendo MCD el grupo más frecuente (66%, 20/30). Comparamos los pacientes con enfermedad localizada frente a los pacientes con enfermedad sistémica (estadio IV). No se observaron diferencias en el subtipo de COO, los subgrupos LymphGen o los reordenamientos MYC, BCL2 y BCL6. Los pacientes con enfermedad localizada o diseminada mostraron una complejidad genómica similar según la cantidad de CNA y la cantidad de genes mutados. En comparación con el LDCGB nodal, los pacientes con TLBCL, tanto localizado como diseminado, presentaron menos complejidad en el número de CNA (P= 0.01 y P < 0.04, respectivamente) pero mostraron una mayor cantidad de mutaciones (P= 0.01 y P < 0.001, respectivamente). El TLBCL presentó con mayor frecuencia ganancias de 18q21.32-q23 (BCL2) y deleciones 6q y 9p21.3 (CDKN2A/B). Las mutaciones de PIM1, MYD88L265P, CD79B, TBL1XR1, MEF2B, CIITA, EP300 y ETV6 se encontraron enriquecidos en el TLBCL, mientras que las mutaciones de BCL10 en el LDCGB nodal. No se hallaron diferencias genéticas entre TLBCL y PCNSL. En conclusión, el TLBCL tiene un perfil genético distintivo similar al del PCNSL, lo que respalda su reconocimiento como una entidad separada del LDCGB y proporciona información decisiva para adaptar los enfoques terapéuticos.Universitat de BarcelonaGiné Soca, EvaLópez Guillermo, ArmandoLópez Guillermo, ArmandoUniversitat de Barcelona. Facultat de Medicina i Ciències de la Salut202520252023info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion211 p.application/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/695179TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAEspañolADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. 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