Involvement of ES6S region of 40S subunit in mRNA threading and scanning during translation initiation

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 15-10-19

Detalles Bibliográficos
Autor: Díaz López, Irene
Tipo de recurso: tesis doctoral
Fecha de publicación:2019
País:España
Institución:Universidad Autónoma de Madrid
Repositorio:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAM
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:repositorio.uam.es:10486/690249
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10486/690249
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Genética humana - Tesis doctorales
Biología y Biomedicina / Biología
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spelling Involvement of ES6S region of 40S subunit in mRNA threading and scanning during translation initiationDíaz López, IreneGenética humana - Tesis doctoralesBiología y Biomedicina / BiologíaTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 15-10-19La traducción de proteínas comienza con la unión del ARNm al complejo ribosomal de pre-iniciación 43S (PIC), seguido del scanning del complejo resultante 48S a través del ARNm hasta localizar el codón de iniciación de la traducción (TIS). El ARNm penetra a través de la cara soluble del 43S-PIC para ser enhebrado como cadena sencilla, necesario para su posterior decodificación. Esto requiere la eliminación de las estructuras secundarias presentes en el ARNm mediante las ARN helicasas DEAD-box, como la helicasa eIF4AI. A pesar de la importancia del proceso, el mecanismo y la topología del complejo de scanning unido al ARNm (48S-PIC), y la influencia de la composición de cara soluble de la subunidad 40S del ribosoma en el scanning aún no se conoce en profundidad. En este trabajo hemos descrito que la región ES6S del ARNr 18S del complejo 48S-PIC constituye un canal de unión por el cual el ARNm atraviesa para ser traducido. Este canal está implicado en la eliminación de estructura secundaria mediada por la helicasa eIF4AI. Hemos sido capaces de bloquear la región ES6S mediante el uso de oligonucleótidos unidos a fluoróforos (VIC-oligo 4), complementarios a la región ES6S (nucleótidos 850- 900 del ARNr 18S). También hemos bloqueado esta región usando una fusión de la proteína eS4 con EGFP. El bloqueo de la región ES6S inhibe la traducción de los ARNm cap-dependientes que presentan una 5’UTR larga y/o muy estructurada, pero no afecta la traducción de ARNm que presentan elementos estructurales que permiten un inicio de la traducción interna (IRES). Este efecto diferencial se observa tanto en ensayos in vitro como en el análisis a nivel genómico de la traducción en células humanas, donde se puede observar la amplia diversidad del transcriptoma humano en la dependencia por el proceso de scanning. Estos resultados indican que el oligo VIC-oligo 4 reduce drásticamente la traducción de ARNm que presentan 5’UTRs complejas, muchos de ellos, involucrados en proliferación y transducción de señales. Por otro lado, la traducción de ARNm con 5’UTRs cortas y poco estructuradas, como los ARNm 5’TOP, no se afecta o incluso se estimula en presencia del VIColigo 4. Con estos datos hemos visto que la región ES6S es necesaria para los ARNm con estructura, haciendo el proceso de scanning más lento pero aumentando su procesividad. Basándonos en los resultados de esta tesis, presentamos un modelo topológico y funcional del complejo de scanning 48S.Ventoso Bande, Iván JoséToribio López, Francisco RenéDepartamento de Biología MolecularFacultad de Ciencias20192019-10-15doctoral thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06NAhttp://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43info:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10486/690249reponame:Biblos-e Archivo. Repositorio Institucional de la UAMinstname:Universidad Autónoma de MadridInglésengopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessoai:repositorio.uam.es:10486/6902492026-06-23T12:46:27Z
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