Desarrollo y utilización de marcadores moleculares para el genotipado de la colección de líneas de introgresión de Solanum lycopersicoides en el fondo genético del tomate cultivado
[ES] Con objeto de ensanchar la base genética de las especies cultivadas se recurre a las especies silvestres relacionadas. Solanum lycopersicoides es la especie silvestre más alejada genéticamente del tomate cultivado (S. lycopersicum), a partir de la cual, ha sido posible obtener descendencia fért...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2012 |
| País: | España |
| Recursos: | Universitat Politècnica de València (UPV) |
| Repositorio: | RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:riunet.upv.es:10251/27382 |
| Acesso em linha: | https://riunet.upv.es/handle/10251/27382 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | Tomate Solanum lycopersicoides Líneas de introgresión Caps Tomato Introgression lines Máster Universitario en Mejora Genética Vegetal-Màster Universitari en Millora Genètica Vegetal |
| Resumo: | [ES] Con objeto de ensanchar la base genética de las especies cultivadas se recurre a las especies silvestres relacionadas. Solanum lycopersicoides es la especie silvestre más alejada genéticamente del tomate cultivado (S. lycopersicum), a partir de la cual, ha sido posible obtener descendencia fértil a través del híbrido interespecífico. Se han realizado numerosos estudios que demuestran su potencial como fuente de variación en programas de mejora. Un grupo de investigadores desarrolló una colección de líneas de introgresión (ILs) de S. lycopersicoides en el fondo genético de la especie cultivada. Dada la isogenicidad entre líneas con respecto al genoma recurrente, toda la variación genética que se distingue entre ellas puede ser directamente asociada al segmento introgresado. Esta población de premejora constituye, por tanto, una herramienta muy útil para el cartografiado de genes de interés así como la incorporación rápida de dichas características en programas de mejora. Un importante porcentaje de líneas de la colección, por problemas de esterilidad, no se puede mantener en homocigosis. Para el manejo y evaluación de la colección es necesario disponer de marcadores moleculares que permitan determinar o confirmar la presencia de la introgresión en las líneas. Incrementar la densidad de los marcadores disponibles facilita, por una parte, la identificación de recombinación en los fragmentos grandes mantenidos en heterocigosis y, por otra parte, aumenta la definición en la determinación del tamaño de las introgresiones. El objetivo del presente trabajo fue desarrollar marcadores de tipo CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) para permitir el manejo de la colección de ILs. Además, se pretendía utilizar los marcadores desarrollados para genotipar líneas homocigotas para la introgresión, con objeto de conocer la longitud de dicho fragmento, así como estudiar la segregación de la descendencia de líneas heterocigotas con la finalidad de reproducir la semilla disponible. Para la consecución del primer objetivo, se emplearon marcadores CAPS descritos como polimórficos entre tomate y otras especies silvestres relacionadas, fundamentalmente derivados de marcadores RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) o COS (Conserved Ortholog Set). Se realizó la amplificación mediante PCR de los parentales de la colección ILs, así como, del híbrido interespecífico entre ambos. Para la búsqueda de polimorfismo se utilizó una batería compuesta por diez endonucleasas. En 25 de los 44 marcadores probados se obtuvo producto de amplificación para S. lycopersicoides y S. lycopersicum, así como en el híbrido interespecífico. Se desarrollaron un total de 14 marcadores polimórficos, 3 de los cuales proceden de polimorfismo hallado en PCR, mientras que en los 11 restantes el polimorfismo surge tras la digestión enzimática. En el genotipado de líneas de la colección se emplearon marcadores polimórficos desarrollados en este trabajo y algunos identificados en estudios previos. Se genotiparon nueve líneas de la colección de ILs. Se estudió la longitud de la introgresión en los fragmentos mantenidos en homocigosis., En el caso de las líneas mantenidas en heterocigosis, se analizó la segregación en su descendencia. Se confirmó la distorsión de la segregación asociada a la presencia de determinadas introgresiones. En algunos casos se detectó recombinación, mientras que en otros se identificó la pérdida del fragmento. Estos resultados ponen en evidencia la importancia del incremento en la densidad de marcadores polimórficos para el manejo de la colección de ILs |
|---|