Genetic and molecular basis of reproductive efficiency in swine
En els darrers anys, la caracterització del transcriptoma s'ha convertit en un tema candent a la recerca genòmica, ja sigui en humans o en animals. En aquests últims, els avanços en transcriptòmica tenen com a principal objectiu entendre millor els caràcters amb major impacte econòmic. Una de l...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2015 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/377433 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/377433 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Ciències de la Salut 575 |
| Sumario: | En els darrers anys, la caracterització del transcriptoma s'ha convertit en un tema candent a la recerca genòmica, ja sigui en humans o en animals. En aquests últims, els avanços en transcriptòmica tenen com a principal objectiu entendre millor els caràcters amb major impacte econòmic. Una de les espècies més importants en la producció ramadera és la porcina. Els caràcters reproductius com la prolificitat poden afectar directament la seva rendibilitat, però la gran variabilitat genètica existent entre races porcines i la baixa heretabilitat d'aquest caràcter han fet de la seva selecció tot un repte. Això posa de manifest la importància d'estudiar les interaccions gèniques i els mecanismes de regulació que afecten el tamany final de la camada en aquesta espècie. En aquesta tesi, oferim una visió global del transcriptoma de l'endometri de dues races porcines que difereixen significativament en els seus nivells de prolificitat, donant una llista de més d'un centenar de gens diferencialment expressats la funció dels quals està associada amb etapes crítiques per a la supervivència embrionària durant la gestació. Aquestes diferències d'expressió han estat validades per 12 gens que constitueixen una llista de nous candidats a exercir un paper clau en l'arquitectura genètica de caràcters relacionats amb l'eficiència reproductiva en el porc. Donat que les microRNAs (miRNAs) són coneguts reguladors post-transcripcionals de l’expressió génica, vam pensar que les diferències observades en el nivell d'expressió d'aquests gens podia respondre a un patró d'expressió de microRNAs diferent. Per validar aquesta hipòtesi, es va analitzar el perfil d'expressió de miRNAs en l'endometri de truges gestants amb nivells de prolificidad divergents, identificant 10 miRNAs madurs diferencialment expressats. Tot i que després de la seva quantificació relativa els nivells d'aquests microRNAs van resultar ser similars, es van trobar correlacions significatives entre l'expressió dels miRNAs ssc-miR-92a i ssc-miR-133a i els gens candidats MMP8, PTGS2, PTHLH i SCNN1G. A més, es va dur a terme la caracterització funcional de nou miRNAs altament implicats en reproducció identificant un total de 13 polimorfismes (SNPs) a les seves seqüències precursores. Per determinar l'efecte d'aquestes variants en l'eficiència reproductiva de les truges, es va realitzar un estudi d'associació que va revelar que el genotip per a les variants identificades a la seqüència de ssc-mir-27a, ssc-mir-29b-2 i ssc-mir-106 era determinant tant per als nivells d'expressió del miRNA madur com per als valors d’EBV. Aquests resultats suggerien que les variants genètiques a la seqüència de miRNAs precursors juguen un paper clau en els caràcteres relacionades amb la reproducció porcina. Finalment, es va dur a terme la validació funcional de la regulació dels gens ADM, HTRA3, PTHLH i VEGFA per part dels seus microRNAs diana ssc-miR-181d-5p, ssc-miR-101-3p, ssc-miR-144 i ssc-miR-195-5p respectivament, que ens va permetre establir una relació directa entre aquestes interaccions i una disminució en els seus nivells d'expressió. |
|---|