Diseño, desarrollo y evaluación de algoritmos basados en aprendizaje profundo para automatización de experimentos Lifespan con C. elegans

[ES] En los últimos años, los nematodos C. elegans cultivados en placas de Petri se han utilizado en muchas investigaciones relacionadas con el envejecimiento. El desarrollo de nuevas herramientas para automatizar los experimentos de lifespan permite realizar más ensayos en menos tiempo y evitar err...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: García-Garví, Antonio|||0000-0002-3676-8287
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2020
País:España
Institución:Universitat Politècnica de València (UPV)
Repositorio:RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia
Idioma:español
OAI Identifier:oai:riunet.upv.es:10251/151938
Acceso en línea:https://riunet.upv.es/handle/10251/151938
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Lifespan
Edición y creación de conjunto de datos
Aprendizaje profundo
Redes neuronales convolucionales
Dataset creation and editing
Deep learning
Convolutional neural networks
Edició i creació de conjunt de dades
Aprenentatge profund
Xarxes neuronals convolucionals
INGENIERIA DE SISTEMAS Y AUTOMATICA
Máster Universitario en Automática e Informática Industrial-Màster Universitari en Automàtica i Informàtica Industrial
Descripción
Sumario:[ES] En los últimos años, los nematodos C. elegans cultivados en placas de Petri se han utilizado en muchas investigaciones relacionadas con el envejecimiento. El desarrollo de nuevas herramientas para automatizar los experimentos de lifespan permite realizar más ensayos en menos tiempo y evitar errores humanos, obteniendo resultados más precisos. El objetivo de este TFM consiste en diseñar y desarrollar métodos para abordar este problema utilizando técnicas de aprendizaje profundo. Posteriormente, se evaluarán los resultados comparando los resultados con los obtenidos empleando técnicas tradicionales de visión por computador. Inicialmente, el trabajo se centrará en la creación y edición de forma supervisada de un conjunto de imágenes bien etiquetadas. Posteriormente se diseñarán distintas arquitecturas de redes neuronales y se optimizará cada una de ellas sobre el espacio de hiperparámetros utilizando Python y Pytorch. Finalmente, se evaluarán las distintas arquitecturas propuestas, utilizando como criterios de optimización tanto las tasas de aciertos como los costes temporales de computación.