Immune cell profiling of the cerebrospinal fluid enables the characterization of the brain metastasis microenvironment

Microambient del càncer; Immunologia tumoral

Detalhes bibliográficos
Autores: Rubio Pérez, Carlota, Planas Rigol, Ester, Trincado, Juan L., Bonfill Teixidor, Ester, Arias Piñeiro, Alexandra, Marchese, Domenica, Iurlaro, Raffaella, Martínez Ricarte, Francisco Ramón, Escudero Monreal, Laura, Cordero Asanza, Esteban Xavier, Cicuendez López Ocaña, Marta, Nuciforo, Paolo Giovanni, Sahuquillo Barris, Joan, Tabernero Caturla, Josep, Seoane Suarez, Joan, Serna, Garazi
Tipo de documento: artigo
Estado:Versão publicada
Data de publicação:2021
País:España
Recursos:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)
Repositório:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
OAI Identifier:oai:scientiasalut.gencat.cat:11351/6171
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/11351/6171
Access Level:Acceso aberto
Palavra-chave:Cervell - Tumors
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[Rubio-Perez C, Planas-Rigol E, Bonfill-Teixidor E, Arias A, Serna G, Iurlaro R, Escudero L, Nuciforo P] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. [Trincado JL] CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain. Josep Carreras Leukemia Research Institute and Department of Biomedicine, School of Medicine, University of Barcelona, Barcelona, Spain. [Marchese D] CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain. [Martínez-Ricarte F, Cordero E, Cicuendez M, Sahuquillo J] Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR), Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. [Tabernero J] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. CIBERONC, Barcelona, Spain. [Seoane J] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. CIBERONC, Barcelona, Spain. Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), Barcelona, Spain
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A fraction of patients with brain metastasis benefit from treatment with immune checkpoint inhibitors (ICI) and the degree and phenotype of the immune cell infiltration has been used to predict response to ICI. However, the anatomical location of brain lesions limits access to tumor material to characterize the immune phenotype. Here, we characterize immune cells present in brain lesions and matched cerebrospinal fluid (CSF) using single-cell RNA sequencing combined with T cell receptor genotyping. Tumor immune infiltration and specifically CD8+ T cell infiltration can be discerned through the analysis of the CSF. Consistently, identical T cell receptor clonotypes are detected in brain lesions and CSF, confirming cell exchange between these compartments. The analysis of immune cells of the CSF can provide a non-invasive alternative to predict the response to ICI, as well as identify the T cell receptor clonotypes present in brain metastasis.The study was undertaken with the support of the Fundación Asociación Española contra el Cáncer (AECC), FERO (EDM), Ramón Areces Foundation, Cellex Foundation, BBVA (CAIMI), the ISCIII, FIS (PI16/01278), the Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (SAF2017-89109-P; AEI/FEDER, UE), the Juan de la Cierva formación fellowship (C.R.-P. and L.E.), Sara Borrell fellowship (E.P-R.). We acknowledge support of the Spanish Ministry of Science and Innovation to the EMBL partnership, the Centro de Excelencia Severo Ochoa and the CERCA Program/Generalitat de Catalunya. We also acknowledge the support of the Spanish Ministry of Science and Innovation through the Instituto de Salud Carlos III, the Generalitat de Catalunya through Departament de Salut and Departament d’Empresa i Coneixement, and the Co-financing by the Spanish Ministry of Ministry of Science and Innovation with funds from the European Regional Development Fund (ERDF) corresponding to the 2014–2020 Smart Growth Operating Program.Nature ResearchInstitut Català de la Salut[Rubio-Perez C, Planas-Rigol E, Bonfill-Teixidor E, Arias A, Serna G, Iurlaro R, Escudero L, Nuciforo P] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. [Trincado JL] CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain. Josep Carreras Leukemia Research Institute and Department of Biomedicine, School of Medicine, University of Barcelona, Barcelona, Spain. [Marchese D] CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Barcelona, Spain. [Martínez-Ricarte F, Cordero E, Cicuendez M, Sahuquillo J] Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR), Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. [Tabernero J] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. CIBERONC, Barcelona, Spain. [Seoane J] Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Spain. CIBERONC, Barcelona, Spain. Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), Barcelona, SpainVall d'Hebron Barcelona Hospital Campus202120212021info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/11351/6171Scientiareponame:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salutinstname:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)InglésNature Communications;12(1)https://www.nature.com/articles/s41467-021-21789-xinfo:eu-repo/grantAgreement/ES/PE2013-2016/PI16%2F01278info:eu-repo/grantAgreement/ES/PE2013-2016/SAF2017-89109-PAttribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:scientiasalut.gencat.cat:11351/61712026-06-12T09:38:37Z
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