Modelització de dades òmiques amb autoencoders

La finalitat d'aquest treball és reproduir i explorar l'ús de xarxes neuronals basades en autoencoders apilats per a la modelització de dades òmiques. Donada la seva gran dimensionalitat, per l'anàlisi de dades òmiques s'han hagut de desenvolupar noves tècniques. Els mètodes de d...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Masip Masip, Jordi
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2019
País:España
Institución:Universitat Oberta de Catalunya (UOC)
Repositorio:O2, repositorio institucional de la UOC
OAI Identifier:oai:openaccess.uoc.edu:10609/98407
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10609/98407
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:autoencoder
omics data
deep learning
dades òmiques
aprenentatge profund
datos ómicos
aprendizaje profundo
Bioinformatics -- TFM
Bioinformàtica -- TFM
Bioinformática -- TFM
Descripción
Sumario:La finalitat d'aquest treball és reproduir i explorar l'ús de xarxes neuronals basades en autoencoders apilats per a la modelització de dades òmiques. Donada la seva gran dimensionalitat, per l'anàlisi de dades òmiques s'han hagut de desenvolupar noves tècniques. Els mètodes de deep learning són unes de les eines que en els últims anys han suposat millores en el seu tractament. El treball de Xie et al. (1) mostra una superioritat d'un model de perceptró multicapa basat en autoencoders apilats (MLP-SAE) per estudiar la relació del patró de polimorfisme genètic de nucleòtids simples (SNP) i el recompte d'expressió genètica per tècniques de seqüenciació d'alt rendiment (HTSeq), respecte a altres tècniques d'anàlisis.