Comparative genomics to unravel virulence mechanisms in fungal human pathogens
Las Candidas forman uno de los grupos con mayor n´umero de hongos pat´ogenos en humanos. La relaci ´on que tienen desde un punto de vista filogen´etico demuestra que la capacidad de infectar humanos ha surgido varias veces de forma independiente en este clado. El complejo de Candida parapsilosis es...
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| Tipo de documento: | tese |
| Estado: | Versão publicada |
| Data de publicação: | 2014 |
| País: | España |
| Recursos: | CBUC, CESCA |
| Repositório: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/301437 |
| Acesso em linha: | http://hdl.handle.net/10803/301437 |
| Access Level: | Acceso aberto |
| Palavra-chave: | Virulence Candida parapsilosis Candida orthopsilosis Candida metapsilosis Sequencing Seqüenciació Comparative genomics Genòmica comparativa Orthologs Heterozygous Ortòlegs 578 |
| Resumo: | Las Candidas forman uno de los grupos con mayor n´umero de hongos pat´ogenos en humanos. La relaci ´on que tienen desde un punto de vista filogen´etico demuestra que la capacidad de infectar humanos ha surgido varias veces de forma independiente en este clado. El complejo de Candida parapsilosis es ideal para investigar la aparici´on de virulencia puesto que contiene tres especies cercanas que muestran diferentes grados de virulencia y de importancia: C. parapsilosis, C. orthopsilosis y C. metapsilosis. En esta tesis presento la secuenciaci´on y posterior an´alisis de quince cepas de origen cl´ınico y medioambiental que forman parte de este clado. Cabe remarcar que los genomas de C. orthopsilosis tipo 1 y de C. metapsilosis no se hab´ıan secuenciado previamente. Nuestros resultados muestran evidencia gen´omica de la existencia de recombinaci´on, apareamiento e hibridaci´on en este clado, que previamente se habia considerado asexual. Proponemos que las cepas cl´ınicas emergieron de forma independiente en linajes de cepas encontradas en el medioambiente y una posible relaci ´on entre la hibridaci´on y la adquisici´on de caracter´ısticas relevantes para la virulencia. Finalmente, para estudiar la aparici´on de virulencia en este clado, hemos comparado, por primera vez, los genomas de las tres especies que se encuentran dentro del complejo de Candida parapsilosis. Hemos encontrado expansiones de familias g´enicas previamente implicadas en virulencia, como es el caso de las adhesinas, transportadores de membrana y enzimas extracelulares. Tambi´en hemos observado expansiones de familias de genes que hasta el momento no han estado relacionadas con virulencia. En resumen, nuestros resultados aportan una base para poder elaborar numerosas hip´ otesis sobre la aparici´on de virulencia en las especies de Candida y para que estas hip´ otesis puedan ser comprobadas posteriormente en el laboratorio. |
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