Estudio metagenómico de muestras de agua superficial y de sedimento procedentes de la laguna hipersalina de Pétrola (Albacete)
La finalidad de este trabajo ha sido caracterizar desde un punto de vista microbiológico la laguna hipersalina de la región de Pétrola. Para ello se extrajo el ADN total de muestras de agua y sedimento de siete puntos representativos de la laguna y se secuenció el gen que codifica para 16S rRNA con...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/95906 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/95906 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | metagenómica laguna hipersalina 16S rRNA metagenòmica llac hipersalí metagenomic hypersaline lagoon Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | La finalidad de este trabajo ha sido caracterizar desde un punto de vista microbiológico la laguna hipersalina de la región de Pétrola. Para ello se extrajo el ADN total de muestras de agua y sedimento de siete puntos representativos de la laguna y se secuenció el gen que codifica para 16S rRNA con la tecnología de secuenciación masiva Ilumina. El análisis bioinformático para el tratamiento de las secuencias y la asignación taxonómica se llevó a cabo gracias a la herramienta QIIME2. Para llevar a cabo este proceso fue necesario el uso de una supercomputadora. La obtención de la diversidad alfa y beta, y el análisis estadístico de abundancia diferencial fueron llevados a cabo con el software R y los paquetes vegan y DESeq2. También se ha realizado un análisis comparando los resultados obtenidos con 5 estudios de varias lagunas con diferentes salinidades. Respecto a la diversidad alfa se ha podido observar la diferencia de diversidad que existe entre las muestras de agua y sedimento, siendo los sedimentos mucho más ricos en diversidad que las aguas. La diversidad beta mostro como tres muestras de tres puntos (dos de sedimento y una de agua) diferían respecto del resto de muestras debido a las características de la laguna y a la localización geográfica de estos puntos. El análisis de abundancia diferencial ha mostrado que existen organismos que tienen una mayor predisposición a crecer en ambientes acuáticos. El estudio comparativo con los artículos ha mostrado que las aguas de la laguna tienen una gran riqueza microbiológica. |
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