Passat, present i futur de la filogenòmica eucariota : famílies gèniques, convergències i reticulacions

La present tesi doctoral se centra, d’una banda, en reconstruir l’evolució de famílies gèniques potencialment relacionades amb determinats events de convergència evolutiva en eucariotes; i d’altra banda, en desenvolupar un marc metodològic que permeti estudiar la rellevància de les reticulacions (tr...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Ocaña Pallarès, Eduard
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2020
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/668495
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/668495
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Comparative genomics
Eukaryotes
Reticulate evolution
Convergent evolution
Phylogenomics
Genòmica comparada
Eucariotes
Evolució reticular
Evolució convergent
Filogenòmica
575
Descripción
Sumario:La present tesi doctoral se centra, d’una banda, en reconstruir l’evolució de famílies gèniques potencialment relacionades amb determinats events de convergència evolutiva en eucariotes; i d’altra banda, en desenvolupar un marc metodològic que permeti estudiar la rellevància de les reticulacions (transferències horitzontals i fusions gèniques) en l'evolució del contingut gènic en relació a l’origen d’animals i fongs. La filogènia dels gens relacionats amb el reconeixement d’orígens de replicació mostra com l’adaptació convergent al parasitisme ha comportat en molts llinatges la simplificació d’aquest complex multiproteic anteriorment considerat com a constitutiu de la cèl·lula eucariota. La filogènia dels gens relacionats amb l’assimilació del nitrat mostra com la transferència horitzontal ha jugat un paper important en la transmissió de l’autotrofia i l’osmotrofia entre diferents llinatges eucariotes. Finalment, també es manifesten algunes limitacions metodològiques i conceptuals detectades en l'estudi de l'evolució reticular, la superació de les quals és necessària per millorar la nostra comprensió sobre el procés evolutiu.