Genome-wide approach to the evolution and dynamics of Neotropical primate populations

Els primats neotropicals (platirrins) estan clarament infrarepresentats en estudis genòmics, tot i ser el grup de primats més divers del planeta i enfrontar-se a greus amenaces antropogèniques. Tradicionalment, la seva evolució i biogeografia s'han estudiat a partir de paràmetres morfològics i...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Hermosilla Albala, Núria
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2025
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/694947
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/694947
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Primats neotropicals
Neotropical primates
Primates neotropicales
Seqüenciació total del genoma
Whole genome sequencing
Secuenciación total del genoma
Genòmica de poblacions
Population genomics
Genómica de poblaciones
Genòmica de la conservació
Conservation genomics
Genómica de la conservación
Evolució dels primats
Primate evolution
Evolución de primates
575
Descripción
Sumario:Els primats neotropicals (platirrins) estan clarament infrarepresentats en estudis genòmics, tot i ser el grup de primats més divers del planeta i enfrontar-se a greus amenaces antropogèniques. Tradicionalment, la seva evolució i biogeografia s'han estudiat a partir de paràmetres morfològics i marcadors genètics, explorant hipòtesis com l'efecte dels rius en la seva distribució. No obstant això, aquestes aproximacions no han mostrat prou resolució per aclarir completament la seva història. Les dades genòmiques poblacionals, com les emprades en aquesta tesi, són cada vegada més accessibles i permeten abordar aquesta limitació. A aquesta tesi analitzem més de 100 genomes dels gèneres Cacajao, Ateles i Brachyteles i introduïm un genoma de referència d'alta contigüitat d’Ateles hybridus. Aquestes dades han permès realitzar el primer estudi poblacional sobre la genòmica evolutiva de platirrins. Mitjançant la bioinformàtica, hem refinat estimacions prèvies de paràmetres de la seva història demogràfica, diversitat genètica i filogènia. Així mateix, hem explorat diferents trajectòries evolutives posteriors a la seva divergència, els seus nivells d'endogàmia i càrrega genètica. La nostra recerca revela una ràpida diferenciació dins dels gèneres, així com patrons de diversitat genètica i migració alineats amb paradigmes biogeogràfics coneguts o el dinamisme dels ecosistemes Amazònics. Amb aquesta tesi ampliem la representació genòmica dels platirrins i recalquem el paper crític de la genòmica en la seva descripció i conservació, aportant coneixements rellevants per preservar-los lligats a la necessària protecció dels seus hàbitats.