Uncovering a novel function of the exonuclease Xrn1 in viral and cellular mRNA translation
The exonuclease Xrn1 degrades messenger RNAs (mRNAs) and controls transcription. By using a model system that replicates brome mosaic virus (BMV) in yeast, here we show that Xrn1 promotes translation initiation of BMV RNA. This function is linked to the highly structured 5’UTR and the coding sequenc...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2016 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/664207 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/664207 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Xrn1 Saccharomyces cerevisiae BMV Ribosome profiling Degradació exonucleasa Traducció 577 |
| Sumario: | The exonuclease Xrn1 degrades messenger RNAs (mRNAs) and controls transcription. By using a model system that replicates brome mosaic virus (BMV) in yeast, here we show that Xrn1 promotes translation initiation of BMV RNA. This function is linked to the highly structured 5’UTR and the coding sequence. The exonuclease activity of Xrn1 is required for its role in viral RNA translation. In contrast, the role of Xrn1 in translation is independent from its function in transcription. Importantly, ribosome profiling analyses reveal that Xrn1 acts as a translational activator of a specific group of cellular mRNAs enriched for glycosylation functions. As for BMV RNA, these cellular mRNAs depend on the exonuclease activity of Xrn1 for translational activation and contain long and structured 5’UTR. Our results reveal a new cross-talk between mRNA degradation and translation, and uncover an unexpected function of the exonuclease Xrn1 in viral and cellular translational control. Xrn1 és una exonucleasa que degrada l’ARN missatger (ARNm) i en regula la transcripció. Emprant un sistema model basat en el virus del mosaic del brom (BMV) i el llevat S. cerevisiae, en aquest treball es demostra que Xrn1 promou l’inici de la traducció de l’ARN viral. Aquesta funció en traducció està lligada a la regió no traduïda a l’extrem 5’ i a la seqüència codificant. L’activitat exonucleasa pròpia de Xrn1 és necessària per tal que actuï en traducció. En canvi, la funció de Xrn1 en transcripció és independent de la funció en traducció. Mitjançant estudis amb perfil de ribosomes, es va constatar que Xrn1 també actua com a activador de la traducció d’un subgrup d’ARNm cel·lulars. Aquests, codifiquen per funcions relacionades amb la glucosilació. Tal i com s’observa per l’ARN de BMV, aquests ARNm cel·lulars depenen de l’activitat exonucleasa de Xrn1 per a la seva traducció i tenen una elevada estructura secundària a la regió no traduïda de l’extrem 5’. En conjunt, els nostres resultats descriuen un nou exemple de la comunicació existent entre la degradació i la traducció de l’ARNm i revelen que Xrn1 té una funció inesperada en el control de la traducció de l’ARNm viral i cel·lular. |
|---|