Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53

[cat] En la majoria de processos cel·lulars, hi ha multitud de proteïnes que interaccionen entre sí, essent aquests contactes proteïna-proteïna, fonamentals per al correcte funcionament de cadascun d'aquests processos. Aquests contactes, es donen a través de les superfícies de les diferents pro...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Martinell Pedemonte, Marc
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2004
País:España
Institución:Universidad de Barcelona
Repositorio:Dipòsit Digital de la UB
OAI Identifier:oai:diposit.ub.edu:2445/42908
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/2445/42908
http://www.tdx.cat/TDX-0716104-121715
http://hdl.handle.net/10803/2790
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Síntesi de pèptids
Reconeixement molecular
Síntesi proteica
Interfícies biològiques
Peptide synthesis
Molecular recognition
Protein synthesis
Biological interfaces
id ES_3cc2b4e05ced700f9dd36a8334a9b9e4
oai_identifier_str oai:diposit.ub.edu:2445/42908
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53Martinell Pedemonte, MarcSíntesi de pèptidsReconeixement molecularSíntesi proteicaInterfícies biològiquesPeptide synthesisMolecular recognitionProtein synthesisBiological interfaces[cat] En la majoria de processos cel·lulars, hi ha multitud de proteïnes que interaccionen entre sí, essent aquests contactes proteïna-proteïna, fonamentals per al correcte funcionament de cadascun d'aquests processos. Aquests contactes, es donen a través de les superfícies de les diferents proteïnes, de manera que aquestes superfícies són unes dianes terapèutiques potencialment molt interessants. Donada la importància del reconeixement de superfícies proteiques, aquest treball de tesis doctoral s'ha dirigit a l'estudi de la utilització de lligands peptídics per al reconeixement de superfícies proteiques riques en carboxilats. En concret, com a diana, s'ha escollit el domini de tetramerització de la proteïna supressora de tumors p53. Així, partint dels estudis previs realitzats en el grup de recerca basats en la interacció de molècules tetraguanidíniques no peptídiques amb petits pèptids model amb quatre residus àcids distribuïts en i / i+3 / i+6 / i+9, s'ha pogut dissenyar i sintetitzar un pèptid (Ac-AGAAGWARGRARSR-NH2), el qual és capaç de reconèixer la superfície rica en carboxilats de la p53. Per poder dur a terme aquests estudis, ha estat necessari establir la metodologia per obtenir mitjançant expressió en cultius bacterians, el domini de tetramerització de la p53 (amb i sense marca isotòpica). El pèptid s'ha dissenyat mitjançant eines de modelat molecular, i la interacció s'ha estudiat mitjançant la combinació de diferents tècniques com són l'espectroscòpia de fluorescència, la ressonància magnètica nuclear, la ressonància de plasmó superficial i la microcalorimetria. A partir d'aquest estudis s'ha pogut concloure que la constant d'afinitat és de l'ordre de 10 milimicres. A més a més, s'ha pogut comprovar que el pèptid Candidat 4, és capaç de creuar la membrana cel·lular, fet que obre les portes a poder avaluar aquesta interacció in vivo. A partir del pèptid Candidat 4, s'ha dissenyat una quimioteca de 40 pèptids amb l'objectiu d'optimitzar l'afinitat i entendre quins són els factors que controlen aquest procés de reconeixement. La quimioteca corresponent s'ha sintetizat, purificat i avaluat la seva interacció amb el domini de tetramerització de la p53 mitjançant espectroscòpia de fluorescència. A partir d'aquests estudis, s'ha comprovat que s'han pogut preparar quatre pèptids amb una afinitat fins a un ordre de magnitud superior i s'han pogut extreure idees de caràcter més general que poden ser útils per al disseny de lligands per a altres superfícies proteiques. Finalment, també s'han obtingut anticossos dirigits a dues regions diferents del domini de tetramerització de la p53.Universitat de BarcelonaGiralt Lledó, ErnestUniversitat de Barcelona. Departament de Química Orgànica2004info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/2445/42908http://www.tdx.cat/TDX-0716104-121715http://hdl.handle.net/10803/2790Tesis Doctorals - Departament - Química Orgànicareponame:Dipòsit Digital de la UBinstname:Universidad de BarcelonaCatalán(c) Martinell Pedemonte, 2004info:eu-repo/semantics/openAccessoai:diposit.ub.edu:2445/429082026-05-27T06:46:51Z
dc.title.none.fl_str_mv Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
title Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
spellingShingle Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
Martinell Pedemonte, Marc
Síntesi de pèptids
Reconeixement molecular
Síntesi proteica
Interfícies biològiques
Peptide synthesis
Molecular recognition
Protein synthesis
Biological interfaces
title_short Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
title_full Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
title_fullStr Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
title_full_unstemmed Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
title_sort Disseny, síntesi i estudi de lligands peptídics capaços de reconèixer la superfície de la P53
dc.creator.none.fl_str_mv Martinell Pedemonte, Marc
author Martinell Pedemonte, Marc
author_facet Martinell Pedemonte, Marc
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Giralt Lledó, Ernest
Universitat de Barcelona. Departament de Química Orgànica
dc.subject.none.fl_str_mv Síntesi de pèptids
Reconeixement molecular
Síntesi proteica
Interfícies biològiques
Peptide synthesis
Molecular recognition
Protein synthesis
Biological interfaces
topic Síntesi de pèptids
Reconeixement molecular
Síntesi proteica
Interfícies biològiques
Peptide synthesis
Molecular recognition
Protein synthesis
Biological interfaces
description [cat] En la majoria de processos cel·lulars, hi ha multitud de proteïnes que interaccionen entre sí, essent aquests contactes proteïna-proteïna, fonamentals per al correcte funcionament de cadascun d'aquests processos. Aquests contactes, es donen a través de les superfícies de les diferents proteïnes, de manera que aquestes superfícies són unes dianes terapèutiques potencialment molt interessants. Donada la importància del reconeixement de superfícies proteiques, aquest treball de tesis doctoral s'ha dirigit a l'estudi de la utilització de lligands peptídics per al reconeixement de superfícies proteiques riques en carboxilats. En concret, com a diana, s'ha escollit el domini de tetramerització de la proteïna supressora de tumors p53. Així, partint dels estudis previs realitzats en el grup de recerca basats en la interacció de molècules tetraguanidíniques no peptídiques amb petits pèptids model amb quatre residus àcids distribuïts en i / i+3 / i+6 / i+9, s'ha pogut dissenyar i sintetitzar un pèptid (Ac-AGAAGWARGRARSR-NH2), el qual és capaç de reconèixer la superfície rica en carboxilats de la p53. Per poder dur a terme aquests estudis, ha estat necessari establir la metodologia per obtenir mitjançant expressió en cultius bacterians, el domini de tetramerització de la p53 (amb i sense marca isotòpica). El pèptid s'ha dissenyat mitjançant eines de modelat molecular, i la interacció s'ha estudiat mitjançant la combinació de diferents tècniques com són l'espectroscòpia de fluorescència, la ressonància magnètica nuclear, la ressonància de plasmó superficial i la microcalorimetria. A partir d'aquest estudis s'ha pogut concloure que la constant d'afinitat és de l'ordre de 10 milimicres. A més a més, s'ha pogut comprovar que el pèptid Candidat 4, és capaç de creuar la membrana cel·lular, fet que obre les portes a poder avaluar aquesta interacció in vivo. A partir del pèptid Candidat 4, s'ha dissenyat una quimioteca de 40 pèptids amb l'objectiu d'optimitzar l'afinitat i entendre quins són els factors que controlen aquest procés de reconeixement. La quimioteca corresponent s'ha sintetizat, purificat i avaluat la seva interacció amb el domini de tetramerització de la p53 mitjançant espectroscòpia de fluorescència. A partir d'aquests estudis, s'ha comprovat que s'han pogut preparar quatre pèptids amb una afinitat fins a un ordre de magnitud superior i s'han pogut extreure idees de caràcter més general que poden ser útils per al disseny de lligands per a altres superfícies proteiques. Finalment, també s'han obtingut anticossos dirigits a dues regions diferents del domini de tetramerització de la p53.
publishDate 2004
dc.date.none.fl_str_mv 2004
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/2445/42908
http://www.tdx.cat/TDX-0716104-121715
http://hdl.handle.net/10803/2790
url https://hdl.handle.net/2445/42908
http://www.tdx.cat/TDX-0716104-121715
http://hdl.handle.net/10803/2790
dc.language.none.fl_str_mv Catalán
language_invalid_str_mv Catalán
dc.rights.none.fl_str_mv (c) Martinell Pedemonte, 2004
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv (c) Martinell Pedemonte, 2004
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
publisher.none.fl_str_mv Universitat de Barcelona
dc.source.none.fl_str_mv Tesis Doctorals - Departament - Química Orgànica
reponame:Dipòsit Digital de la UB
instname:Universidad de Barcelona
instname_str Universidad de Barcelona
reponame_str Dipòsit Digital de la UB
collection Dipòsit Digital de la UB
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869406396539207680
score 15,300724

Similares en LA Referencia