Studying the limits of protein-ligand docking to predict new non-covalent inhibitors for the SARSCoV-2 main protease
La pandèmia global coneguda com a COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019) va tenir un profund impacte en els sistemes sanitaris d'arreu del món, tensionant els països i les societats d'una manera que no s'havia vist des de la globalització. El SARS-CoV-2, un virus d'ARN monocatenari...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2023 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/688358 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/688358 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | SARS-CoV-2 molecular docking Ciències 004 577 |
| Sumario: | La pandèmia global coneguda com a COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019) va tenir un profund impacte en els sistemes sanitaris d'arreu del món, tensionant els països i les societats d'una manera que no s'havia vist des de la globalització. El SARS-CoV-2, un virus d'ARN monocatenari de sentit positiu del gènere Betacoronavirus, és l'agent causant de COVID-19, i ha estat investigat a fons per la comunitat científica des de desembre de 2019. La proteasa principal del SARS-CoV-2 (M-pro) és una de les dianes virals més investigades. El nostre grup de recerca va idear una metodologia de cribratge virtual basada en el docking proteïna-lligand durant l'inici de la pandèmia COVID-19 per identificar nous inhibidors del SARS-CoV-2 M-pro entre els fàrmacs aprovats. Quan vam comparar els nostres resultats amb els d'altres inhibidors sugerits de la Mpro del SARS-CoV-2 vam descobrir que nombrosos articles predien diferents compostos, tot i que utilitzaven el mateix conjunt de dades i enfocament inicial. En un curt període de temps, es va generar un gran nombre d’estructures de complexos no covalents entre la SARS-CoV-2 M-pro i diferents inhibidors, cosa que va propiciar el caldo de cultiu per a aquesta tesi. La actual tesi doctoral examina en profunditat les limitacions del docking proteïna-lligand a l’hora de predir els inhibidors de la SARS-CoV-2 M-pro. |
|---|