Genomic Insights into the Population Dynamics, Connectivity, and Geographic Origins of Critically Endangered Gorillas

Els goril·les són un grup de grans simis africans format per quatre subespècies, les quals estan en perill o perill crític d’extinció. En aquesta tesi, hem obtingut mostres no invasives de tres de les quatre subespècies al llarg de la seva distribució actual, amb l’objectiu de generar dades genètiqu...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Ruiz Gartzia, Irune
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2025
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/696058
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/696058
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Genetic de poblacions
Population Genomics
Genetica de poblaciones
Goril·les
Gorillas
Gorilas
Mostres no invasives
Non-invase samples
Muestras no invasivas
Grans simis
Great Apes
Grandes simios
Target capture sequencing
575
Descripción
Sumario:Els goril·les són un grup de grans simis africans format per quatre subespècies, les quals estan en perill o perill crític d’extinció. En aquesta tesi, hem obtingut mostres no invasives de tres de les quatre subespècies al llarg de la seva distribució actual, amb l’objectiu de generar dades genètiques georeferenciades, les quals combinades amb dades públiques representen un total de 33 llocs de mostreig diferents. Hem aplicat un protocol d’hibridació per tal de capturar el cromosoma 21 de 280 mostres fecals i de pèls de goril·les de poblacions salvatges. A més, també hem seqüenciat el genoma complet d’onze mostres de museu de les dues espècies de goril·les, i dotze mostres de sang obtingudes mitjançant targetes de FTA de mostres de goril·les de les planes occidentals rescatats. A partir d’aquestes mostres hem pogut caracteritzar l’estructura poblacional a petia escala en els goril·les de les planes occidentals, detectant tres poblacions principals i el riu Sangha com a barrera entre el flux genètic entre aquestes. També hem reconstruït patrons de connectivitat passats entre poblacions específiques dels goril·les de les planes occidentals i els goril·les de Cross River, els quals haurien estat facilitats per un corredor migratori també utilitzat per les dues subespècies de ximpanzés de la mateixa zona (Pan troglodytes troglodytes i Pan troglodytes ellioti). Utilitzant aquestes dades genètiques georeferenciades hem pogut predir els orígens geogràfics de dades de goril·les públiques nascuts en estat salvatge i de goril·les que han estat rescatats. Aquesta geolocalització s’ha pogut dur a terme a nivell poblacional en el cas dels goril·les de muntanya i per a algunes poblacions dels goril·les de les planes occidentals.