A comparison study of U-Net based methods for brain tumor segmentation

The brain tumor segmentation (BraTS) Challenge is an international competition that focuses on the task of automated segmentation of the different parts of brain tumors in magnetic resonance imaging (MRI) scans. U-Net architecture has become the de-facto standard for medical image segmentation tasks...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Ferrando Garrido, Albert
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2023
País:España
Institución:Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Repositorio:UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:upcommons.upc.edu:2117/407795
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/2117/407795
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Imaging systems in medicine
Machine learning
Deep learning (Machine learning)
Image segmentation
BraTS-Africa
U-Net
Swin Transformer
Swin UNETR
BraTS challenge
MRI scans
aprenentatge automàtic
aprenentatge profund
aprenentatge per transferència
imatges biomèdiques
segmentació d'imatges mèdiques
segmentació de tumors cerebrals
concurs BraTS
ressonància magnètica
glioma adult
meningioma intracranial
metàstasis cerebrals
tumors pediàtrics
machine learning
deep learning
transfer learning
biomedical images
medical image segmentation
brain tumor segmentation
adult glioma
intracranial meningioma
brain metastases
pediatric tumors
Imatgeria mèdica
Aprenentatge automàtic
Aprenentatge profund
Imatges--Segmentació
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Intel·ligència artificial
Descripción
Sumario:The brain tumor segmentation (BraTS) Challenge is an international competition that focuses on the task of automated segmentation of the different parts of brain tumors in magnetic resonance imaging (MRI) scans. U-Net architecture has become the de-facto standard for medical image segmentation tasks, and the proposals based on this architecture have been among the top-ranked solution proposals in the last editions. The 2023 edition of the BraTS challenge introduced a set of 4 new datasets towards addressing additional populations (e.g., sub-Saharan Africa patients) and types of tumors (e.g., meningioma). The goal of this thesis is to train and test different U-Net based architectures using the datasets of the 2023 edition, and to compare and analyse the performance of the different methods both quantitatively and qualitatively.