Study of the role of the histone demethylase JMJD3 as a transcirptional regulator
El desarrollo neural es un proceso coordinado en el cuál las vías de señalización cooperan con factores de transcripción y enzimas modificadoras de la cromatina para generar diferentes programas génicos que finalmente conducen a la adquisición de las características fenotípicas necesarias. A nivel d...
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2018 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/664070 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/664070 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Cromatina Chromatin JMJD3 Transcripció Transcripción Transcription Ciències Experimentals 575 |
| Sumario: | El desarrollo neural es un proceso coordinado en el cuál las vías de señalización cooperan con factores de transcripción y enzimas modificadoras de la cromatina para generar diferentes programas génicos que finalmente conducen a la adquisición de las características fenotípicas necesarias. A nivel de megabases, los dominios asociados topológicamente limitan la accesibilidad de los factores de transcripción y las potenciales interacciones enhancer-promotor en un espacio y tiempo concretos. Al mismo tiempo, a nivel local, las secuencias de ADN presentes en los enhancers contienen gran cantidad de lugares de unión para los factores de transcripción que son necesarios en las decisiones celulares. Cómo estas vías de señalización dinámicas coordinan el reclutamiento de los factores de transcripción en el contexto de la unión enhancer-promotor, y a qué nivel la cooperación entre las proteínas modificadoras de la cromatina y las cascadas de señalización afectan a los loops genómicos son temas abordados en esta tesis doctoral. El trabajo de Raquel Fueyo Arévalo demuestra que en células madre de córtex embrionarios de ratones de estadio E12.5, la vía de señalización de TGFβ coordina el programa génico de la diferenciación neuronal mediante la activación de un conjunto de enhancers específicos. Haciendo uso de la tecnología CRISPR-Cas9 se descifra el papel del enhancer y el promotor del gen Neurog2 durante la diferenciación neuronal y además se establece un orden jerárquico del reclutamiento de las proteínas activadoras en la estructura tridimensional de la cromatina. Considerando datos de todo el genoma, se apunta hacia el factor proneural ASCL1 como un posible factor pionero necesario para el reclutamiento de SMAD3 a los enhancers y se indica, que el interactor conocido de SMAD3, JMJD3, coopera con ASCL1 en la activación de enhancers. Además, se aborda el papel de JMJD3 en los enhancers a nivel de conformación lineal y tridimensional. Para profundizar más en el mecanismo específico que funciona en estos enhancers, se ha descubierto una nueva proteína interactora de JMJD3, la proteína relacionada con autismo CHD8. |
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