Single-cell transcriptional profile of CD34+ hematopoietic progenitor cells from del(5q) myelodysplastic syndromes and impact of lenalidomide

Hematopoietic progenitor cells; Myelodysplastic syndromes; Lenalidomide

Detalhes bibliográficos
Autores: Serrano Sanz, Guillermo, Berastegui Zufiaurre, Nerea, Díaz-Mazkiaran, Aintzane, García-Olloqui, Paula, Rodriguez-Res, Carmen, Huerga-Dominguez, Sofia, Acha, Pamela, Molero , Antonieta, MONTORO, JULIA, VALCARCEL, DAVID
Formato: artículo
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2024
País:España
Recursos:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)
Repositorio:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
OAI Identifier:oai:scientiasalut.gencat.cat:11351/11642
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/11351/11642
Access Level:acceso abierto
Palavra-chave:Síndromes mielodisplàsiques - Tractament
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[Serrano G] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. Biological and Environmental Science and Engineering Division, King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Saudi Arabia. [Berastegui N, García-Olloqui P] Hematology-Oncology Program, CIMA, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdiSNA, Pamplona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer, CIBERONC, Madrid, Spain. [Díaz-Mazkiaran A] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. Hematology-Oncology Program, CIMA, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdiSNA, Pamplona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer, CIBERONC, Madrid, Spain. [Rodriguez-Res C] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. [Huerga-Dominguez S] Hematology and Cell Therapy Service, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. [Acha P] MDS Research Group, Josep Carreras Leukaemia Research Institut, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain. Servei d’Hematologia, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. [Molero A, Montoro MJ, Valcarcel D] Servei d’Hematologia, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain
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Using single cell RNA-seq (scRNA-seq) on CD34+ progenitors from del(5q) MDS patients, we have identified cells harboring the deletion, characterizing the transcriptional impact of this genetic insult on disease pathogenesis and treatment response. Interestingly, both del(5q) and non-del(5q) cells present similar transcriptional lesions, indicating that all cells, and not only those harboring the deletion, may contribute to aberrant hematopoietic differentiation. However, gene regulatory network (GRN) analyses reveal a group of regulons showing aberrant activity that could trigger altered hematopoiesis exclusively in del(5q) cells, pointing to a more prominent role of these cells in disease phenotype. In del(5q) MDS patients achieving hematological response upon lenalidomide treatment, the drug reverts several transcriptional alterations in both del(5q) and non-del(5q) cells, but other lesions remain, which may be responsible for potential future relapses. Moreover, lack of hematological response is associated with the inability of lenalidomide to reverse transcriptional alterations. Collectively, this study reveals transcriptional alterations that could contribute to the pathogenesis and treatment response of del(5q) MDS.Nature PortfolioInstitut Català de la Salut[Serrano G] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. Biological and Environmental Science and Engineering Division, King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Saudi Arabia. [Berastegui N, García-Olloqui P] Hematology-Oncology Program, CIMA, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdiSNA, Pamplona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer, CIBERONC, Madrid, Spain. [Díaz-Mazkiaran A] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. Hematology-Oncology Program, CIMA, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdiSNA, Pamplona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer, CIBERONC, Madrid, Spain. [Rodriguez-Res C] Computational Biology Program CIMA-Universidad de Navarra, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. [Huerga-Dominguez S] Hematology and Cell Therapy Service, Cancer Center Clínica Universidad de Navarra (CCUN), IdISNA, Pamplona, Spain. [Acha P] MDS Research Group, Josep Carreras Leukaemia Research Institut, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain. Servei d’Hematologia, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. [Molero A, Montoro MJ, Valcarcel D] Servei d’Hematologia, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, SpainVall d'Hebron Barcelona Hospital Campus202420242024info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/11351/11642Scientiareponame:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salutinstname:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)InglésNature Communications;15https://doi.org/10.1038/s41467-024-49529-xAttribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:scientiasalut.gencat.cat:11351/116422026-06-12T09:38:37Z
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