Caracterización fenotípica y genotípica de aislados de cacao (Theobroma cacao l.) de Dibulla, Guajira

La Sierra Nevada de Santa Marta es conocida mundialmente por su enorme biodiversidad, que incluye numerosas variedades de frutas con alto valor comercial y cultural, como el cacao. Como ocurre en toda Colombia, los cultivos de cacao de esta región, están concentrados en variedades híbridas comercial...

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Detalhes bibliográficos
Autores: Ramos Ospino, Angélica Del Carmen, Gómez Álvarez, Margarita Sofía
Formato: tesis de maestría
Estado:Versión aceptada para publicación
Fecha de publicación:2019
País:Colombia
Recursos:Universidad Libre
Repositorio:RIU - Repositorio Institucional UniLibre
Idioma:español
OAI Identifier:oai:repository.unilibre.edu.co:10901/17815
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/10901/17815
Access Level:acceso abierto
Palavra-chave:Variedad de cacao
Características fenotípicas
Características genotípicas
Germplasm
UPOV markers
Multivariate
Phylogenetical methods
ITS region
Germoplasma vegetal
Análisis cladístico
Cacao -- Biotecnología
Biotecnología vegetal
Germoplasma
Marcadores UPOV
Multivariados
Métodos filogenéticos
Región ITS
Descrição
Resumo:La Sierra Nevada de Santa Marta es conocida mundialmente por su enorme biodiversidad, que incluye numerosas variedades de frutas con alto valor comercial y cultural, como el cacao. Como ocurre en toda Colombia, los cultivos de cacao de esta región, están concentrados en variedades híbridas comerciales; y los cacaos finos tipo criollos, con alto valor organoléptico han sido marginados. En el municipio de Dibulla, en el departamento de La Guajira, actualmente se está reactivando la producción de cacao como cultivo sostenible, y en esta iniciativa, los agricultores han rescatado los cacaos nativos. Dada la importancia de caracterizar éstos cultivos, para determinar los rasgos particulares de un individuo y/o población que se diferencian de los demás, y pueden ser utilizado para programas de mejoramiento vegetal; se realizó la caracterización fenotípica y genotípica de cacaos nativos del municipio Dibulla. Para ello se colectaron, caracterizaron y compararon las variedades de cacao cultivadas por la Asociación de Productores Orgánicos del Municipio de Dibulla (APOMD), ubicados en el corregimiento de Mingueo. Los rasgos fenotípicos se evaluaron a través de los descriptores UPOV para cacao, y se analizaron con herramientas estadísticas. Los parámetros cualitativos y cuantitativos se cotejaron por estadística descriptiva y multivariada (PCA y análisis de conglomerados); y adicionalmente, se compararon las variables cuantitativas de los cacaos híbridos comerciales con los cacaos criollos, a través de la prueba no paramétrica test Mann-Whitney. Conjuntamente, como marcador genético para evaluar las relaciones genéticas, se empleó la secuencia de la región ITS. En este sentido, fue necesario estandarizar los protocolos de extracción de DNA, amplificación del marcador genético, y posteriormente se secuenciaron las ampliaciones. A partir de las secuencias, se realizaron análisis de agrupamiento por métodos de distancia (UPGMA, Neighbor-Join) y métodos filogenéticos (Máxima Verosimilitud y Máxima Parsimonia). Los análisis fenotípicos y genotípicos, demostraron con base estadística que existen claras diferencias entre el grupo de los cacaos nativos de Dibulla y los cacaos de variedades hibridas comerciales cultivadas en el municipio. Esta diferenciación permitió determinar que, los cacaos nativos pertenecen al grupo de cacao tipo criollo. Finalmente, se recomienda en futuros estudios incluir marcadores moleculares como matK y trnH-psbA para estudios de variabilidad genética, filogenia y filogeografía; así como análisis bromatológicos, fisicoquímicos y microbiológicos, que permitan valorizar y dar una denominación de origen a estos cacaos criollos.