Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal

Acidithiobacillus ferrooxidans es la bacteria presente en depósitos de drenajes ácido-mineros más estudiada, ya que juega un papel importante en los procesos de biolixiviación de cobre. Este metal redox en estado libre en la célula es extremadamente tóxico. Por esta razón, los organismos cuentan con...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor: Oetiker Mancilla, Nia Carolina
Formato: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2017
País:Chile
OAI Identifier:oai:repositorio.anid.cl:10533/232922
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/10533/232922
Access Level:acceso abierto
Palavra-chave:Ciencias Naturales
Otras Ciencias Naturales
id CL_1dd4a403cac122b67e3aed29bb73dbda
oai_identifier_str oai:repositorio.anid.cl:10533/232922
network_acronym_str CL
network_name_str Chile
repository_id_str
dc.title.es_CL.fl_str_mv Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
Study and characterization of possible copper tolerance determinants in Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 through of analysis of changes in the proteome and metabolome profile in metal response
title Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
spellingShingle Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
Oetiker Mancilla, Nia Carolina
Ciencias Naturales
Otras Ciencias Naturales
title_short Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
title_full Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
title_fullStr Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
title_full_unstemmed Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
title_sort Estudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metal
dc.creator.none.fl_str_mv Oetiker Mancilla, Nia Carolina
author Oetiker Mancilla, Nia Carolina
author_facet Oetiker Mancilla, Nia Carolina
author_role author
dc.contributor.institution.es_CL.fl_str_mv UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE
dc.subject.oecd1n.es_CL.fl_str_mv Ciencias Naturales
topic Ciencias Naturales
Otras Ciencias Naturales
dc.subject.oecd2n.es_CL.fl_str_mv Otras Ciencias Naturales
description Acidithiobacillus ferrooxidans es la bacteria presente en depósitos de drenajes ácido-mineros más estudiada, ya que juega un papel importante en los procesos de biolixiviación de cobre. Este metal redox en estado libre en la célula es extremadamente tóxico. Por esta razón, los organismos cuentan con sistemas para soportar un aumento en su concentración. A. ferrooxidans es un importante modelo de estudio ya que tolera altos niveles de Cu. Hemos descrito previamente que A. ferrooxidans ATCC 53993 sobrevive a 100 mM de Cu posiblemente por la presencia de una isla genómica (I.G.) que le confiere una mayor dosis génica de los principales determinantes de tolerancia al metal. Sin embargo, no se ha analizado la respuesta de esta cepa a concentraciones más extremas de Cu. En esta tesis, se identificaron 67 proteínas mediante análisis proteómico que cambiaron sus niveles en células sometidas a condiciones extremas del metal. La mayor parte de estas proteínas forman parte del sistema CusCBA de expulsión de Cu y sus chaperonas, algunas de ellas codificadas en su I.G. exclusiva. A pesar de que se observó una disminución general de varias proteínas relacionadas con el metabolismo, incluyendo algunas que participan en las rutas del metabolismo de carbono y la oxidación de Fe(II), los resultados sugieren la importancia de generar poder reductor en estas condiciones. Adicionalmente, mediante análisis metabolómico se determinó la disminución de la mayoría de los aminoácidos en presencia de Cu, posiblemente porque sus principales rutas de síntesis están disminuidas. Finalmente, en presencia del metal tóxico se observó el aumento de las proteínas MdoG (relacionada con la generación de poliglicanos periplasmáticos) y la polimerasa de antígeno O, y la disminución de las porinas OprB, Omp40 y OmpA. Estos resultados sugieren que la membrana externa y el espacio periplasmático contribuirían en gran medida a la alta tolerancia de A. ferrooxidans ATCC 53993 al cobre.
publishDate 2017
dc.date.issued.es_CL.fl_str_mv 2017
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2019-01-23T15:05:09Z
2022-08-16T16:41:21Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2019-01-23T15:05:09Z
2022-08-16T16:41:21Z
dc.type.none.fl_str_mv Tesis Doctorado
dc.type.driver.es_CL.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.openaire.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.tesis.none.fl_str_mv Tesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.folio.es_CL.fl_str_mv 21130264
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/10533/232922
identifier_str_mv 21130264
url https://hdl.handle.net/10533/232922
dc.relation.none.fl_str_mv instname: Conicyt
reponame: Repositorio Digital RI2.0
dc.relation.projectid.es_CL.fl_str_mv info:eu-repo/grantAgreement//21130264
dc.relation.set.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/dataset/hdl.handle.net/10533/93488
dc.rights.es_CL.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.anid.cl/bitstreams/c55bd966-3da2-4231-ad0c-d453f9fb45a6/download
https://repositorio.anid.cl/bitstreams/f9841af4-d90a-4300-bc35-3ee1c912cd5a/download
https://repositorio.anid.cl/bitstreams/784329a3-2d0f-45d8-b7d4-7e490981e69d/download
https://repositorio.anid.cl/bitstreams/03dda56a-a6e8-4342-a977-ebd53a3bc292/download
https://repositorio.anid.cl/bitstreams/cef0d611-e45e-449c-8974-71100c1a1b3c/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 76dcfde2cab79858e3884ea6ca1009a9
f97bcfdf58f3e17b5cec231112dab5b1
593a6e7305c66c56041a9f9e15a649c1
c1723d5649731dcb65189d6b5b64e77d
84dd7f399f74b455aabc91ddd962f563
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio ANID
repository.mail.fl_str_mv aletelier@anid.cl
_version_ 1843518627725180928
spelling UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILEOetiker Mancilla, Nia Carolina2017https://hdl.handle.net/10533/232922http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Otras Ciencias NaturalesCiencias NaturalesEstudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metalUNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILECHILEOetiker Mancilla, Nia Carolina2019-01-23T15:05:09Z2022-08-16T16:41:21Z2019-01-23T15:05:09Z2022-08-16T16:41:21Z2017Acidithiobacillus ferrooxidans es la bacteria presente en depósitos de drenajes ácido-mineros más estudiada, ya que juega un papel importante en los procesos de biolixiviación de cobre. Este metal redox en estado libre en la célula es extremadamente tóxico. Por esta razón, los organismos cuentan con sistemas para soportar un aumento en su concentración. A. ferrooxidans es un importante modelo de estudio ya que tolera altos niveles de Cu. Hemos descrito previamente que A. ferrooxidans ATCC 53993 sobrevive a 100 mM de Cu posiblemente por la presencia de una isla genómica (I.G.) que le confiere una mayor dosis génica de los principales determinantes de tolerancia al metal. Sin embargo, no se ha analizado la respuesta de esta cepa a concentraciones más extremas de Cu. En esta tesis, se identificaron 67 proteínas mediante análisis proteómico que cambiaron sus niveles en células sometidas a condiciones extremas del metal. La mayor parte de estas proteínas forman parte del sistema CusCBA de expulsión de Cu y sus chaperonas, algunas de ellas codificadas en su I.G. exclusiva. A pesar de que se observó una disminución general de varias proteínas relacionadas con el metabolismo, incluyendo algunas que participan en las rutas del metabolismo de carbono y la oxidación de Fe(II), los resultados sugieren la importancia de generar poder reductor en estas condiciones. Adicionalmente, mediante análisis metabolómico se determinó la disminución de la mayoría de los aminoácidos en presencia de Cu, posiblemente porque sus principales rutas de síntesis están disminuidas. Finalmente, en presencia del metal tóxico se observó el aumento de las proteínas MdoG (relacionada con la generación de poliglicanos periplasmáticos) y la polimerasa de antígeno O, y la disminución de las porinas OprB, Omp40 y OmpA. Estos resultados sugieren que la membrana externa y el espacio periplasmático contribuirían en gran medida a la alta tolerancia de A. ferrooxidans ATCC 53993 al cobre.Acidithiobacillus ferrooxidans is the most studied bacterium in deposits of acid-mining drains, since it plays an important role in copper bioleaching processes. This redox metal free in the cell is extremely toxic. For this reason, organisms have systems to support an increase in its concentration. A. ferrooxidans is an important study model since it tolerates high of copper. We have previously described that A. ferrooxidans ATCC 53993 survives 100 mM Cu possibly due to the presence of a genomic island (GI) that confers it a higher gene dose of the main determinants of metal tolerance. However, the response of this strain to more extreme Cu concentrations has not been yet analyzed. In this thesis, 67 proteins were identified by proteomic analysis that changed their levels in cells subjected to an extreme Cu concentration. Most of these proteins were part of the CusCBA system of Cu efflux and chaperones, some of them encoded in its exclusive GI. Although a general decrease in several proteins related to metabolism was observed, including some that participate in carbon metabolism routes and the oxidation of Fe (II), the results suggest the importance of generating reducing power under these conditions. Additionally, by using metabolomic analysis, the decrease of most aminoacids was seen in the presence of Cu in the growth medium, possibly because their main synthetic routes were diminished. Finally, an increase of MdoG proteins (related to the generation of periplasmic polyglycans) and the antigen O polymerase, and the decrease of the OprB, Omp40 and OmpA porins was seen in cells subjected to Cu. These results suggest that the outer membrane and the periplasmic space greatly contribute to the high tolerance of A. ferrooxidans ATCC 53993 to copper.PFCHA-BecasPFCHA-Becas21130264https://hdl.handle.net/10533/232922instname: Conicytreponame: Repositorio Digital RI2.0info:eu-repo/grantAgreement//21130264info:eu-repo/semantics/dataset/hdl.handle.net/10533/93488info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/Ciencias NaturalesOtras Ciencias NaturalesEstudio y caracterización de posibles determinantes de tolerancia a cobre en Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 mediante análisis de los cambios generados en el proteoma y metaboloma en respuesta al metalStudy and characterization of possible copper tolerance determinants in Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 through of analysis of changes in the proteome and metabolome profile in metal responseTesis Doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionTesisTesishttps://hdl.handle.net/10533/232922PFCHA-Becase81c7f50-6fec-460b-85f3-1f579cc49f40virtual::48434-1e81c7f50-6fec-460b-85f3-1f579cc49f40virtual::48434-1ORIGINALFINAL TESIS DOCTORADO NIA OETIKER .pdfapplication/pdf3594509https://repositorio.anid.cl/bitstreams/c55bd966-3da2-4231-ad0c-d453f9fb45a6/download76dcfde2cab79858e3884ea6ca1009a9MD51CC-LICENSElicense_rdfapplication/octet-stream1232https://repositorio.anid.cl/bitstreams/f9841af4-d90a-4300-bc35-3ee1c912cd5a/downloadf97bcfdf58f3e17b5cec231112dab5b1MD52LICENSElicense.txttext/plain1779https://repositorio.anid.cl/bitstreams/784329a3-2d0f-45d8-b7d4-7e490981e69d/download593a6e7305c66c56041a9f9e15a649c1MD53TEXTFINAL TESIS DOCTORADO NIA OETIKER .pdf.txtExtracted texttext/plain244772https://repositorio.anid.cl/bitstreams/03dda56a-a6e8-4342-a977-ebd53a3bc292/downloadc1723d5649731dcb65189d6b5b64e77dMD54THUMBNAILFINAL TESIS DOCTORADO NIA OETIKER .pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg1566https://repositorio.anid.cl/bitstreams/cef0d611-e45e-449c-8974-71100c1a1b3c/download84dd7f399f74b455aabc91ddd962f563MD5510533/232922oai:repositorio.anid.cl:10533/2329222023-07-24 12:26:46.85http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://repositorio.anid.clRepositorio ANIDaletelier@anid.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
score 15.811543

Registos relacionados