Avaliação da coprodução de KPC e NDM em Klebsiella pneumoniae : caracterização dos elementos genéticos móveis envolvidos
Infecções causadas por Enterobacterales produtoras de carbapenemases que abrigam mais de um gene de carbapenemases se espalham, principalmente, pela mobilização de plasmídios e transposons. É importante avaliar esses elementos genéticos móveis para compreender sua disseminação. Este estudo teve como...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2024 |
| País: | Brasil |
| Institución: | Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) |
| Repositorio: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS |
| Idioma: | portugués |
| OAI Identifier: | oai:www.lume.ufrgs.br:10183/273214 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10183/273214 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Klebsiella pneumoniae Genes bacterianos Antibacterianos Co-integrated plasmids BlaKPC-2 BlaNDM-1 K. pneumoniae coharboring Bioinformatics Spread of blaNDM-1 Genomic surveillance |
| Sumario: | Infecções causadas por Enterobacterales produtoras de carbapenemases que abrigam mais de um gene de carbapenemases se espalham, principalmente, pela mobilização de plasmídios e transposons. É importante avaliar esses elementos genéticos móveis para compreender sua disseminação. Este estudo teve como objetivo analisar os elementos genéticos móveis carreadores de blaKPC e blaNDM de coprodutores de carbapenemases de K. pneumoniae (KpKN). Isolados de K. pneumoniae com suscetibilidade reduzida a carbapenêmicos foram obtidos de 2016 a 2023. Para avaliar o ambiente genético de KpKN, 22 isolados foram selecionados para perfil de suscetibilidade antimicrobiana e sequenciamento do genoma completo (WGS) usando plataformas MiSeq e MinIon. O gene blaKPC-2 foi carreado, principalmente, por IncN/IncFIB (~84.000 pb), um novo plasmídio cointegrado (16/22; 72%) no transposon Tn4401b, que também carregava genes que conferem resistência ao trimetoprim. O blaNDM-2 foi carregado nos únicos dois isolados KpKN recuperados antes de 2020 pelo plasmídio do tipo IncHI1B/IncFIB (~255.000 pb), carregando o gene no transposon Tn3000, que também apresentava genes de resistência a aminoglicosídeos. Digno de nota, os isolados obtidos desde 2020 mostraram o gene blaNDM-1 carreado pelo IncA/C (~170.000 pb) (18/22; 82%) em um “IS26-flanked pseudo-composite transposon containing ISCR1”, que também tinha genes que conferem resistência a sulfonamidas, aminoglicosídeos, macrolídeos, quinolonas, anfenicóis, tetraciclinas, rifampicina, sulfonamida e trimetoprima. As alterações do plasmídio e do transposon durante os diferentes períodos podem estar relacionadas à maior disseminação de NDM e o grande número de genes de resistência presentes no transposon flanqueado IS26 pode ter aumentado a coseleção deste plasmídio através do amplo uso de antibióticos durante a pandemia. |
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