Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes
A aplicação inequívoca de nomes de fungos é importante para comunicar descobertas científicas. Os nomes são essenciais para diagnósticos (clínicos), conformidade legal e controles regulatórios, como biossegurança, segurança alimentar, regulamentos de quarentena e aplicações industriais. Consequentem...
| id |
BR_b29fed25d27d064cddbd3e6acb3bbc19 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufmg.br:1843/73322 |
| network_acronym_str |
BR |
| network_name_str |
Brasil |
| repository_id_str |
|
| dc.title.none.fl_str_mv |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| title |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| spellingShingle |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes Andrey Yurkov Typification Nomenclatural type Culture collection Metabolically inactive Viable strains Técnicas de tipagem micológica Fungos Nomenclatura |
| title_short |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| title_full |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| title_fullStr |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| title_full_unstemmed |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| title_sort |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes |
| dc.creator.none.fl_str_mv |
Andrey Yurkov Artur Alves Feng-Yan Bai Kyria Boundy-Mills Pietro Buzzin Neža Čadež Gianluigi Cardinali Serge Casaregola Vishnu Chaturvedi Valérie Collin Jack W. Fell Victoria Girard Marizeth Groenewald Ferry Hagen Chris Todd Hittinger Aleksey V. Kachalkin Markus Kostrzewa Vassili Kouvelis Carlos Augusto Rosa Diego Libkind Xinzhan Liu Thomas Maier Wieland Meyer Gábor Péter Marcin Piątek Vincent Robert Jose Paulo Sampaio Matthias Sipiczk Marc Stadler Takashi Sugita Junta Sugiyama Hiroshi Takagi Masako Takashima Benedetta Turchetti Qi-Ming Wang Teun Boekhout |
| author |
Andrey Yurkov |
| author_facet |
Andrey Yurkov Artur Alves Feng-Yan Bai Kyria Boundy-Mills Pietro Buzzin Neža Čadež Gianluigi Cardinali Serge Casaregola Vishnu Chaturvedi Valérie Collin Jack W. Fell Victoria Girard Marizeth Groenewald Ferry Hagen Chris Todd Hittinger Aleksey V. Kachalkin Markus Kostrzewa Vassili Kouvelis Carlos Augusto Rosa Diego Libkind Xinzhan Liu Thomas Maier Wieland Meyer Gábor Péter Marcin Piątek Vincent Robert Jose Paulo Sampaio Matthias Sipiczk Marc Stadler Takashi Sugita Junta Sugiyama Hiroshi Takagi Masako Takashima Benedetta Turchetti Qi-Ming Wang Teun Boekhout |
| author_role |
author |
| author2 |
Artur Alves Feng-Yan Bai Kyria Boundy-Mills Pietro Buzzin Neža Čadež Gianluigi Cardinali Serge Casaregola Vishnu Chaturvedi Valérie Collin Jack W. Fell Victoria Girard Marizeth Groenewald Ferry Hagen Chris Todd Hittinger Aleksey V. Kachalkin Markus Kostrzewa Vassili Kouvelis Carlos Augusto Rosa Diego Libkind Xinzhan Liu Thomas Maier Wieland Meyer Gábor Péter Marcin Piątek Vincent Robert Jose Paulo Sampaio Matthias Sipiczk Marc Stadler Takashi Sugita Junta Sugiyama Hiroshi Takagi Masako Takashima Benedetta Turchetti Qi-Ming Wang Teun Boekhout |
| author2_role |
author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author author |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
Typification Nomenclatural type Culture collection Metabolically inactive Viable strains Técnicas de tipagem micológica Fungos Nomenclatura |
| topic |
Typification Nomenclatural type Culture collection Metabolically inactive Viable strains Técnicas de tipagem micológica Fungos Nomenclatura |
| description |
A aplicação inequívoca de nomes de fungos é importante para comunicar descobertas científicas. Os nomes são essenciais para diagnósticos (clínicos), conformidade legal e controles regulatórios, como biossegurança, segurança alimentar, regulamentos de quarentena e aplicações industriais. Consequentemente, a estabilidade do sistema taxonómico e a rastreabilidade das mudanças nomenclaturais são cruciais para uma ampla gama de utilizadores e taxonomistas. A aplicação inequívoca dos nomes é assegurada pela preservação da história nomenclatural e dos organismos físicos que representam um nome. Os fungos são extremamente diversos em termos de ecologia, estilo de vida e métodos de estudo. Fungos predominantemente unicelulares conhecidos como leveduras são geralmente investigados como culturas vivas. Os métodos para caracterizar leveduras incluem testes fisiológicos (crescimento) e experimentos para induzir uma forma sexual; ambos os métodos requerem culturas viáveis. Assim, a preservação e a disponibilidade de culturas de referência viáveis são importantes, e as culturas que representam material de referência são citadas nas descrições das espécies. Levantamentos históricos revelaram desvantagens e inconsistências entre as práticas passadas e os requisitos modernos, conforme estabelecido no Código Internacional de Nomenclatura para Algas, Fungos e Plantas (ICNafp). A tipificação inadequada de leveduras é um problema comum, resultando em um grande número de nomes de espécies de leveduras inválidos. Com esta carta de parecer, abordamos o problema de os microrganismos cultiváveis, nomeadamente alguns fungos e algas, exigirem disposições específicas ao abrigo do ICNafp. Usamos leveduras como um exemplo proeminente de fungos conhecidos em culturas. Mas o tipo de material viável é importante não apenas para leveduras, mas também para outros fungos cultiváveis que são caracterizados por estruturas morfológicas específicas (um tipo específico de esporos), propriedades de crescimento e metabólitos secundários. Resumimos propostas potenciais que, na nossa opinião, irão melhorar a estabilidade dos nomes dos fungos, em particular protegendo aqueles nomes cujo material de referência pode ser rastreado até ao isolado original. |
| publishDate |
2021 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2021 2024-08-07T21:27:53Z 2024-08-07T21:27:53Z |
| dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
| format |
article |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://doi.org/10.1186/s43008-021-00067-x 2210-6359 http://hdl.handle.net/1843/73322 http://orcid.org/0000-0002-1072-5166 https://orcid.org/0000-0003-0117-2958 https://orcid.org/0000-0001-9823-6430 https://orcid.org/0000-0001-9272-5903 https://orcid.org/0000-0001-6793-0606 https://orcid.org/0000-0002-4987-0539 https://orcid.org/0000-0002-4522-7925 https://orcid.org/0000-0001-7140-8538 https://orcid.org/0000-0002-3922-9676 https://orcid.org/0000-0002-9937-3258 https://orcid.org/0000-0003-0835-5925 https://orcid.org/0000-0002-5622-1916 https://orcid.org/0000-0001-5088-7461 https://orcid.org/0000-0002-4494-2468 https://orcid.org/0000-0002-7828-3624 https://orcid.org/0000-0001-6753-0872 https://orcid.org/0000-0001-9687-6186 https://orcid.org/0000-0002-6227-1987 https://orcid.org/0000-0002-7056-3576 https://orcid.org/0000-0001-9933-8340 https://orcid.org/0000-0002-1118-0647 https://orcid.org/0000-0002-4968-2861 https://orcid.org/0000-0002-7284-8671 https://orcid.org/0000-0002-2127-5017 https://orcid.org/0000-0002-1786-3174 https://orcid.org/0000-0002-7686-8661 https://orcid.org/0000-0002-7370-3028 https://orcid.org/0000-0002-2180-8135 https://orcid.org/0000-0002-0476-3609 |
| url |
https://doi.org/10.1186/s43008-021-00067-x http://hdl.handle.net/1843/73322 http://orcid.org/0000-0002-1072-5166 https://orcid.org/0000-0003-0117-2958 https://orcid.org/0000-0001-9823-6430 https://orcid.org/0000-0001-9272-5903 https://orcid.org/0000-0001-6793-0606 https://orcid.org/0000-0002-4987-0539 https://orcid.org/0000-0002-4522-7925 https://orcid.org/0000-0001-7140-8538 https://orcid.org/0000-0002-3922-9676 https://orcid.org/0000-0002-9937-3258 https://orcid.org/0000-0003-0835-5925 https://orcid.org/0000-0002-5622-1916 https://orcid.org/0000-0001-5088-7461 https://orcid.org/0000-0002-4494-2468 https://orcid.org/0000-0002-7828-3624 https://orcid.org/0000-0001-6753-0872 https://orcid.org/0000-0001-9687-6186 https://orcid.org/0000-0002-6227-1987 https://orcid.org/0000-0002-7056-3576 https://orcid.org/0000-0001-9933-8340 https://orcid.org/0000-0002-1118-0647 https://orcid.org/0000-0002-4968-2861 https://orcid.org/0000-0002-7284-8671 https://orcid.org/0000-0002-2127-5017 https://orcid.org/0000-0002-1786-3174 https://orcid.org/0000-0002-7686-8661 https://orcid.org/0000-0002-7370-3028 https://orcid.org/0000-0002-2180-8135 https://orcid.org/0000-0002-0476-3609 |
| identifier_str_mv |
2210-6359 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
| language |
eng |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
IMA Fungus |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
pdf application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Minas Gerais Brasil ICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICA ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA UFMG |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Minas Gerais Brasil ICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICA ICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA UFMG |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFMG instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) instacron:UFMG |
| instname_str |
Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) |
| instacron_str |
UFMG |
| institution |
UFMG |
| reponame_str |
Repositório Institucional da UFMG |
| collection |
Repositório Institucional da UFMG |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@ufmg.br |
| _version_ |
1853663301190287360 |
| spelling |
Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changesTypificationNomenclatural typeCulture collectionMetabolically inactiveViable strainsTécnicas de tipagem micológicaFungosNomenclaturaA aplicação inequívoca de nomes de fungos é importante para comunicar descobertas científicas. Os nomes são essenciais para diagnósticos (clínicos), conformidade legal e controles regulatórios, como biossegurança, segurança alimentar, regulamentos de quarentena e aplicações industriais. Consequentemente, a estabilidade do sistema taxonómico e a rastreabilidade das mudanças nomenclaturais são cruciais para uma ampla gama de utilizadores e taxonomistas. A aplicação inequívoca dos nomes é assegurada pela preservação da história nomenclatural e dos organismos físicos que representam um nome. Os fungos são extremamente diversos em termos de ecologia, estilo de vida e métodos de estudo. Fungos predominantemente unicelulares conhecidos como leveduras são geralmente investigados como culturas vivas. Os métodos para caracterizar leveduras incluem testes fisiológicos (crescimento) e experimentos para induzir uma forma sexual; ambos os métodos requerem culturas viáveis. Assim, a preservação e a disponibilidade de culturas de referência viáveis são importantes, e as culturas que representam material de referência são citadas nas descrições das espécies. Levantamentos históricos revelaram desvantagens e inconsistências entre as práticas passadas e os requisitos modernos, conforme estabelecido no Código Internacional de Nomenclatura para Algas, Fungos e Plantas (ICNafp). A tipificação inadequada de leveduras é um problema comum, resultando em um grande número de nomes de espécies de leveduras inválidos. Com esta carta de parecer, abordamos o problema de os microrganismos cultiváveis, nomeadamente alguns fungos e algas, exigirem disposições específicas ao abrigo do ICNafp. Usamos leveduras como um exemplo proeminente de fungos conhecidos em culturas. Mas o tipo de material viável é importante não apenas para leveduras, mas também para outros fungos cultiváveis que são caracterizados por estruturas morfológicas específicas (um tipo específico de esporos), propriedades de crescimento e metabólitos secundários. Resumimos propostas potenciais que, na nossa opinião, irão melhorar a estabilidade dos nomes dos fungos, em particular protegendo aqueles nomes cujo material de referência pode ser rastreado até ao isolado original.The unambiguous application of fungal names is important to communicate scientific findings. Names are critical for (clinical) diagnostics, legal compliance, and regulatory controls, such as biosafety, food security, quarantine regulations, and industrial applications. Consequently, the stability of the taxonomic system and the traceability of nomenclatural changes is crucial for a broad range of users and taxonomists. The unambiguous application of names is assured by the preservation of nomenclatural history and the physical organisms representing a name. Fungi are extremely diverse in terms of ecology, lifestyle, and methods of study. Predominantly unicellular fungi known as yeasts are usually investigated as living cultures. Methods to characterize yeasts include physiological (growth) tests and experiments to induce a sexual morph; both methods require viable cultures. Thus, the preservation and availability of viable reference cultures are important, and cultures representing reference material are cited in species descriptions. Historical surveys revealed drawbacks and inconsistencies between past practices and modern requirements as stated in the International Code of Nomenclature for Algae, Fungi, and Plants (ICNafp). Improper typification of yeasts is a common problem, resulting in a large number invalid yeast species names. With this opinion letter, we address the problem that culturable microorganisms, notably some fungi and algae, require specific provisions under the ICNafp. We use yeasts as a prominent example of fungi known from cultures. But viable type material is important not only for yeasts, but also for other cultivable Fungi that are characterized by particular morphological structures (a specific type of spores), growth properties, and secondary metabolites. We summarize potential proposals which, in our opinion, will improve the stability of fungal names, in particular by protecting those names for which the reference material can be traced back to the original isolate.Outra AgênciaUniversidade Federal de Minas GeraisBrasilICB - DEPARTAMENTO DE BOTÂNICAICB - DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIAUFMG2024-08-07T21:27:53Z2024-08-07T21:27:53Z2021info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlepdfapplication/pdfhttps://doi.org/10.1186/s43008-021-00067-x2210-6359http://hdl.handle.net/1843/73322http://orcid.org/0000-0002-1072-5166https://orcid.org/0000-0003-0117-2958https://orcid.org/0000-0001-9823-6430https://orcid.org/0000-0001-9272-5903https://orcid.org/0000-0001-6793-0606https://orcid.org/0000-0002-4987-0539https://orcid.org/0000-0002-4522-7925https://orcid.org/0000-0001-7140-8538https://orcid.org/0000-0002-3922-9676https://orcid.org/0000-0002-9937-3258https://orcid.org/0000-0003-0835-5925https://orcid.org/0000-0002-5622-1916https://orcid.org/0000-0001-5088-7461https://orcid.org/0000-0002-4494-2468https://orcid.org/0000-0002-7828-3624https://orcid.org/0000-0001-6753-0872https://orcid.org/0000-0001-9687-6186https://orcid.org/0000-0002-6227-1987https://orcid.org/0000-0002-7056-3576https://orcid.org/0000-0001-9933-8340https://orcid.org/0000-0002-1118-0647https://orcid.org/0000-0002-4968-2861https://orcid.org/0000-0002-7284-8671https://orcid.org/0000-0002-2127-5017https://orcid.org/0000-0002-1786-3174https://orcid.org/0000-0002-7686-8661https://orcid.org/0000-0002-7370-3028https://orcid.org/0000-0002-2180-8135https://orcid.org/0000-0002-0476-3609engIMA Fungusinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGAndrey YurkovArtur AlvesFeng-Yan BaiKyria Boundy-MillsPietro BuzzinNeža ČadežGianluigi CardinaliSerge CasaregolaVishnu ChaturvediValérie CollinJack W. FellVictoria GirardMarizeth GroenewaldFerry HagenChris Todd HittingerAleksey V. KachalkinMarkus KostrzewaVassili KouvelisCarlos Augusto RosaDiego LibkindXinzhan LiuThomas MaierWieland MeyerGábor PéterMarcin PiątekVincent RobertJose Paulo SampaioMatthias SipiczkMarc StadlerTakashi SugitaJunta SugiyamaHiroshi TakagiMasako TakashimaBenedetta TurchettiQi-Ming WangTeun Boekhout2024-08-07T21:27:53Zoai:repositorio.ufmg.br:1843/73322Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oairepositorio@ufmg.bropendoar:2024-08-07T21:27:53Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false |
| score |
15,300719 |