Análise da expressão de genes relacionados ao Sistema CRISPR/Cas em isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa
O CRISPR/Cas é um sistema que confere defesa adaptativa a procariotos contra elementos genéticos móveis. Em contrapartida, os fagos codificam proteínas anti-CRISPR, capazes de bloquear a ação desse sistema. Dentre as principais bactérias de importância clínica, Pseudomonas aeruginosa é um bacilo Gra...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2022 |
| País: | Brasil |
| Institución: | Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
| Repositorio: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
| Idioma: | portugués |
| OAI Identifier: | oai:arca.fiocruz.br:icict/60179 |
| Acceso en línea: | https://arca.fiocruz.br/handle/icict/60179 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Sistemas CRISPR-Cas Proteínas Associadas a CRISPR - genética Pseudomonas aeruginosa — genética Prófagos CRISPR-Cas systems Proteins Associated with CRISPR - genetics Pseudomonas aeruginosa — genetics Prophages Proteínas Associadas a CRISPR Pseudomonas aeruginosa |
| Sumario: | O CRISPR/Cas é um sistema que confere defesa adaptativa a procariotos contra elementos genéticos móveis. Em contrapartida, os fagos codificam proteínas anti-CRISPR, capazes de bloquear a ação desse sistema. Dentre as principais bactérias de importância clínica, Pseudomonas aeruginosa é um bacilo Gram-negativo associado a infecções hospitalares e a resistência a múltiplas classes de antimicrobianos. Estudos prévios permitiram a identificação do sistema CRISPR/Cas do tipo I-F e I-E em isolados clínicos de P. aeruginosa, e o sequenciamento destes genomas permitiu a identificação de profagos, genes anti-CRISPR, espaçadores derivados de fagos e plasmídeos e de um gene bacteriano hemN. O mecanismo de ação destes genes relacionados ao sistema CRISPR/Cas ainda necessita de elucidações. Diante disto, o atual estudo teve por objetivo avaliar a expressão destes genes relacionados ao CRISPR/Cas em quatro isolados clínicos de P. aeruginosa positivos para o sistema tipo-F, sob diferentes condições nutricionais, através das técnicas de RT-PCR e qRT-PCR. Constatou-se no isolado Pae28 que os genes anti-CRISPR acIrE1, acrIF3, acrIF5 são mais expressos em condições nutricionais limitadas, enquanto no isolado Pae42 os níveis de expressão de acrIF7 são mais altos em condições ricas em nutrientes. A expressão de genes do fago phiCTX foi evidenciada em Pae28 e Pae42, que possuem espaçador contra este mesmo fago. Todos os isolados estudados apresentaram algum nível de expressão para o gene hemN, apesar da presença de um espaçador derivado desse gene dentro do locus CRISPR nos isolados Pae29 e Pae42. Embora estudos tenham mostrado uma função de regulador da expressão gênica, nossos resultados sugerem que o sistema CRISPR/Cas pode promover a indução de profagos em P. aeruginosa, como consequência de sua função primária, clivando material genético alvo. |
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